More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2506 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2506  Methylmalonyl-CoA mutase  100 
 
 		 614 aa  1217    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000082079  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3006  methylmalonyl-CoA mutase  58.4 
 
 		 660 aa  635    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.84067  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3187  Methylmalonyl-CoA mutase  56.68 
 
 		 633 aa  645    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800977  normal  0.217414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1943  methylmalonyl-CoA mutase  60.82 
 
 		 653 aa  670    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133903 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1921  methylmalonyl-CoA mutase  62.38 
 
 		 601 aa  630  1e-179  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00796016  normal  0.671948 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4374  Methylmalonyl-CoA mutase  59.13 
 
 		 640 aa  618  1e-176  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2761  methylmalonyl-CoA mutase  56.8 
 
 		 630 aa  615  9.999999999999999e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.257221  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6419  Methylmalonyl-CoA mutase  57.47 
 
 		 593 aa  581  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05670  methylmalonyl-CoA mutase, N-terminal domain/subunit  55.66 
 
 		 622 aa  567  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5544  Methylmalonyl-CoA mutase  55.22 
 
 		 644 aa  523  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.11647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3023  methylmalonyl-CoA mutase small subunit (MCM-beta)  44.3 
 
 		 621 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11522  methylmalonyl-CoA mutase small subunit mutA  44.93 
 
 		 623 aa  376  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.384078 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3650  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  45.69 
 
 		 620 aa  366  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3134  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  43.94 
 
 		 615 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2762  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  45.86 
 
 		 626 aa  363  4e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0864334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3123  methylmalonyl-CoA mutase, small subunit  43.78 
 
 		 615 aa  363  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.987709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3184  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  43.78 
 
 		 615 aa  363  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.170851 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5425  methylmalonyl-CoA mutase  42.65 
 
 		 612 aa  363  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.559772  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1929  methylmalonyl-CoA mutase  40.5 
 
 		 623 aa  361  3e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.102484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2636  methylmalonyl-CoA mutase  42.56 
 
 		 629 aa  351  2e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.668897  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2041  Methylmalonyl-CoA mutase  41.84 
 
 		 623 aa  350  4e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3135  methylmalonyl-CoA mutase  41.85 
 
 		 629 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2480  methylmalonyl-CoA mutase  46.17 
 
 		 698 aa  343  4e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0217  methylmalonyl-CoA mutase  44.87 
 
 		 611 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1762  methylmalonyl-CoA mutase  41.54 
 
 		 621 aa  333  8e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2665  Methylmalonyl-CoA mutase  43.02 
 
 		 605 aa  329  8e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3536  methylmalonyl-CoA mutase  41.78 
 
 		 623 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0287465  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2388  methylmalonyl-CoA mutase  42.56 
 
 		 605 aa  327  5e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.55342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2419  Methylmalonyl-CoA mutase  42.67 
 
 		 652 aa  325  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.751014  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3545  methylmalonyl-CoA mutase  45.1 
 
 		 569 aa  324  2e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2236  methylmalonyl-CoA mutase  39.87 
 
 		 639 aa  324  3e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2345  Methylmalonyl-CoA mutase  42.33 
 
 		 605 aa  312  9e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.418628  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2104  Methylmalonyl-CoA mutase  39.48 
 
 		 597 aa  301  2e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5167  Methylmalonyl-CoA mutase  46.38 
 
 		 600 aa  298  2e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4729  methylmalonyl-CoA mutase  40.19 
 
 		 610 aa  293  5e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0278  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  33.72 
 
 		 682 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3785  Methylmalonyl-CoA mutase  38.59 
 
 		 621 aa  288  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.546238 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2295  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  31.32 
 
 		 681 aa  280  5e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22180  methylmalonyl-CoA mutase, N-terminal domain/subunit  38.38 
 
 		 710 aa  278  3e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0921601  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2200  methylmalonyl-CoA mutase  36.16 
 
 		 624 aa  273  9e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.53913 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1984  Methylmalonyl-CoA mutase  30.82 
 
 		 684 aa  270  5e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611894  normal  0.0597183 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1348  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  36.4 
 
 		 713 aa  258  3e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000457861  unclonable  0.00000004793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3871  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  33.97 
 
 		 720 aa  250  6e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.949138  normal  0.194963 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0544  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  36.61 
 
 		 723 aa  249  8e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3629  methylmalonyl-CoA mutase  39.74 
 
 		 489 aa  246  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1656  methylmalonyl-CoA mutase, small subunit  30.06 
 
 		 618 aa  229  1e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.50388 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1120  methylmalonyl-CoA mutase  36.59 
 
 		 480 aa  206  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.170859 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3305  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  33.44 
 
 		 706 aa  205  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.457427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0869  Methylmalonyl-CoA mutase  29.7 
 
 		 604 aa  205  3e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0857  methylmalonyl-CoA mutase  36.38 
 
 		 479 aa  199  9e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315986  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1168  Methylmalonyl-CoA mutase  33.17 
 
 		 591 aa  192  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.648096  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1285  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  27.68 
 
 		 727 aa  190  7e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.238431  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2192  methylmalonyl-CoA mutase  28.75 
 
 		 709 aa  167  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172259  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0867  methylmalonyl-CoA mutase  28.75 
 
 		 709 aa  167  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2300  methylmalonyl-CoA mutase  28.54 
 
 		 709 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2001  methylmalonyl-CoA mutase  36.67 
 
 		 714 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1190  methylmalonyl-CoA mutase  36.51 
 
 		 712 aa  164  6e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.942727  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3753  methylmalonyl-CoA mutase  28.21 
 
 		 738 aa  162  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801598  normal  0.879758 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3681  methylmalonyl-CoA mutase  29.05 
 
 		 714 aa  161  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3005  methylmalonyl-CoA mutase  29.59 
 
 		 754 aa  160  8e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.598546  normal  0.356991 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5687  methylmalonyl-CoA mutase  28.67 
 
 		 712 aa  160  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2510  methylmalonyl-CoA mutase  28.31 
 
 		 722 aa  159  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2891  methylmalonyl-CoA mutase  29.44 
 
 		 716 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3367  methylmalonyl-CoA mutase  28.03 
 
 		 709 aa  159  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0726  methylmalonyl-CoA mutase  28.54 
 
 		 712 aa  158  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.999011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5545  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  29.68 
 
 		 738 aa  158  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3053  methylmalonyl-CoA mutase  28.6 
 
 		 714 aa  158  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1320  methylmalonyl-CoA mutase  37.34 
 
 		 722 aa  158  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1221  methylmalonyl-CoA mutase  29.51 
 
 		 715 aa  158  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.584735  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02748  methylmalonyl-CoA mutase  35.39 
 
 		 714 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0776  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  35.39 
 
 		 714 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02711  hypothetical protein  35.39 
 
 		 714 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3244  methylmalonyl-CoA mutase  35.39 
 
 		 714 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98625  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4213  methylmalonyl-CoA mutase  35.39 
 
 		 714 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3075  methylmalonyl-CoA mutase  35.39 
 
 		 714 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0793  methylmalonyl-CoA mutase  35.39 
 
 		 714 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1944  methylmalonyl-CoA mutase  29.59 
 
 		 740 aa  156  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.132442 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1702  methylmalonyl-CoA mutase  35.39 
 
 		 718 aa  156  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321557 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0079  methylmalonyl-CoA mutase  27.35 
 
 		 706 aa  155  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.373309  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4237  methylmalonyl-CoA mutase  27.75 
 
 		 712 aa  155  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6260  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  27.93 
 
 		 517 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.593051 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1014  methylmalonyl-CoA mutase  28.38 
 
 		 719 aa  155  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.856859 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1349  methylmalonyl-CoA mutase  36.93 
 
 		 733 aa  154  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0148615  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6511  methylmalonyl-CoA mutase  29.24 
 
 		 712 aa  154  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1849  methylmalonyl-CoA mutase  26.95 
 
 		 720 aa  154  5e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3398  methylmalonyl-CoA mutase  28.09 
 
 		 731 aa  154  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.526303  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1920  methylmalonyl-CoA mutase large subunit  37.34 
 
 		 720 aa  153  8e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0552222  normal  0.617547 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2040  methylmalonyl-CoA mutase  26.95 
 
 		 720 aa  153  8e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1657  methylmalonyl-CoA mutase  33.99 
 
 		 715 aa  153  8.999999999999999e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.387473 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2805  methylmalonyl-CoA mutase  27 
 
 		 719 aa  152  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1865  methylmalonyl-CoA mutase  35.27 
 
 		 661 aa  152  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0811  methylmalonyl-CoA mutase  28.78 
 
 		 714 aa  152  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251875  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6136  methylmalonyl-CoA mutase  37.04 
 
 		 717 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0179109  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1165  methylmalonyl-CoA mutase  25.95 
 
 		 589 aa  152  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3260  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  27.63 
 
 		 713 aa  152  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3188  Methylmalonyl-CoA mutase  37.92 
 
 		 725 aa  151  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.36577  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1173  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  35.68 
 
 		 1106 aa  151  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00593374 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6098  methylmalonyl-CoA mutase  39.15 
 
 		 712 aa  151  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.23929  normal  0.554736 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3486  methylmalonyl-CoA mutase  26.94 
 
 		 721 aa  151  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3872  methylmalonyl-CoA mutase  35.68 
 
 		 740 aa  150  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.231489  normal  0.125312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>