More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2295 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0278  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  63.24 
 
 		 682 aa  858    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2295  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  100 
 
 		 681 aa  1407    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0544  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  43.37 
 
 		 723 aa  560  1e-158  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3871  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  42.55 
 
 		 720 aa  547  1e-154  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.949138  normal  0.194963 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1285  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  40 
 
 		 727 aa  528  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.238431  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1348  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  41.01 
 
 		 713 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000457861  unclonable  0.00000004793 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1984  Methylmalonyl-CoA mutase  37.96 
 
 		 684 aa  445  1e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611894  normal  0.0597183 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3305  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  37.39 
 
 		 706 aa  406  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.457427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2480  methylmalonyl-CoA mutase  35.45 
 
 		 698 aa  389  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2192  methylmalonyl-CoA mutase  30.26 
 
 		 709 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172259  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0867  methylmalonyl-CoA mutase  30.26 
 
 		 709 aa  317  4e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0079  methylmalonyl-CoA mutase  31.03 
 
 		 706 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.373309  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1702  methylmalonyl-CoA mutase  31.38 
 
 		 718 aa  309  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321557 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1320  methylmalonyl-CoA mutase  30.45 
 
 		 722 aa  307  4.0000000000000004e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2761  methylmalonyl-CoA mutase  32.11 
 
 		 630 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.257221  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1943  methylmalonyl-CoA mutase  31.59 
 
 		 653 aa  305  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133903 
 
 
-
 
NC_002950  PG1656  methylmalonyl-CoA mutase, small subunit  31.45 
 
 		 618 aa  303  7.000000000000001e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.50388 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2300  methylmalonyl-CoA mutase  29.7 
 
 		 709 aa  303  8.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3681  methylmalonyl-CoA mutase  30.27 
 
 		 714 aa  301  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0388  methylmalonyl-CoA mutase  30.13 
 
 		 714 aa  299  9e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3260  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  29.46 
 
 		 713 aa  295  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4374  Methylmalonyl-CoA mutase  30.92 
 
 		 640 aa  293  8e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1190  methylmalonyl-CoA mutase  29.94 
 
 		 712 aa  291  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.942727  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6098  methylmalonyl-CoA mutase  30.11 
 
 		 712 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.23929  normal  0.554736 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0726  methylmalonyl-CoA mutase  29.72 
 
 		 712 aa  287  4e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.999011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2001  methylmalonyl-CoA mutase  35.4 
 
 		 714 aa  287  5.999999999999999e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2506  Methylmalonyl-CoA mutase  31.32 
 
 		 614 aa  286  9e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000082079  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3053  methylmalonyl-CoA mutase  33.84 
 
 		 714 aa  286  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5687  methylmalonyl-CoA mutase  35.4 
 
 		 712 aa  286  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02748  methylmalonyl-CoA mutase  33.62 
 
 		 714 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4213  methylmalonyl-CoA mutase  33.92 
 
 		 714 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3753  methylmalonyl-CoA mutase  28.45 
 
 		 738 aa  285  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801598  normal  0.879758 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3244  methylmalonyl-CoA mutase  33.92 
 
 		 714 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98625  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0793  methylmalonyl-CoA mutase  33.62 
 
 		 714 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02711  hypothetical protein  33.62 
 
 		 714 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3075  methylmalonyl-CoA mutase  33.62 
 
 		 714 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0776  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  33.62 
 
 		 714 aa  285  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2127  methylmalonyl-CoA mutase  28.94 
 
 		 720 aa  284  5.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.063815  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1167  methylmalonyl-CoA mutase  30.32 
 
 		 712 aa  283  6.000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.169366  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2891  methylmalonyl-CoA mutase  28.02 
 
 		 716 aa  282  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3367  methylmalonyl-CoA mutase  29.26 
 
 		 709 aa  282  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0868  methylmalonyl-CoA mutase  30.04 
 
 		 715 aa  281  4e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2294  methylmalonyl-CoA mutase  28.42 
 
 		 731 aa  280  5e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.895743  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4237  methylmalonyl-CoA mutase  34.19 
 
 		 712 aa  280  8e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6136  methylmalonyl-CoA mutase  29.4 
 
 		 717 aa  280  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0179109  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3006  methylmalonyl-CoA mutase  30.16 
 
 		 660 aa  278  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.84067  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2510  methylmalonyl-CoA mutase  28.97 
 
 		 722 aa  278  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5544  Methylmalonyl-CoA mutase  29.32 
 
 		 644 aa  277  4e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.11647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0545  methylmalonyl-CoA mutase  28.57 
 
 		 740 aa  278  4e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1173  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  28.82 
 
 		 1106 aa  276  6e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00593374 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6511  methylmalonyl-CoA mutase  29.49 
 
 		 712 aa  276  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1849  methylmalonyl-CoA mutase  28.72 
 
 		 720 aa  276  9e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0811  methylmalonyl-CoA mutase  27.89 
 
 		 714 aa  276  1.0000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251875  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2697  methylmalonyl-CoA mutase  27.58 
 
 		 720 aa  275  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.20812 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2040  methylmalonyl-CoA mutase  28.57 
 
 		 720 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1221  methylmalonyl-CoA mutase  28.41 
 
 		 715 aa  275  3e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.584735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1014  methylmalonyl-CoA mutase  28.72 
 
 		 719 aa  273  6e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.856859 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1223  methylmalonyl-CoA mutase  29.41 
 
 		 712 aa  272  1e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3135  methylmalonyl-CoA mutase  30.88 
 
 		 629 aa  271  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2805  methylmalonyl-CoA mutase  28.25 
 
 		 719 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3872  methylmalonyl-CoA mutase  32.69 
 
 		 740 aa  271  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.231489  normal  0.125312 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3398  methylmalonyl-CoA mutase  29.13 
 
 		 731 aa  271  4e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.526303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2161  methylmalonyl-CoA mutase  28.35 
 
 		 723 aa  270  5e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385791  normal  0.481947 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3486  methylmalonyl-CoA mutase  27.85 
 
 		 721 aa  270  5e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2383  methylmalonyl-CoA mutase  28.06 
 
 		 718 aa  270  5e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1349  methylmalonyl-CoA mutase  32.16 
 
 		 733 aa  270  8.999999999999999e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0148615  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0279  methylmalonyl-CoA mutase  28.13 
 
 		 731 aa  269  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2636  methylmalonyl-CoA mutase  30.53 
 
 		 629 aa  268  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.668897  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3023  methylmalonyl-CoA mutase small subunit (MCM-beta)  30.28 
 
 		 621 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2236  methylmalonyl-CoA mutase  30.84 
 
 		 639 aa  266  8.999999999999999e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0910  methylmalonyl-CoA mutase  27.55 
 
 		 739 aa  265  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.736612  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1865  methylmalonyl-CoA mutase  29.28 
 
 		 661 aa  264  3e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3188  Methylmalonyl-CoA mutase  27.86 
 
 		 725 aa  263  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.36577  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0932  methylmalonyl-CoA mutase  27.68 
 
 		 724 aa  263  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6640  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  28.09 
 
 		 724 aa  263  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.70273 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0014  methylmalonyl-CoA mutase  26.58 
 
 		 711 aa  261  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185174  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2479  methylmalonyl-CoA mutase  27.31 
 
 		 732 aa  261  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5804  methylmalonyl-CoA mutase  28.16 
 
 		 972 aa  261  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.256305  normal  0.17905 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6419  Methylmalonyl-CoA mutase  31.26 
 
 		 593 aa  261  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4006  methylmalonyl-CoA mutase  26.64 
 
 		 716 aa  260  5.0000000000000005e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1929  methylmalonyl-CoA mutase  30.32 
 
 		 623 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.102484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3187  Methylmalonyl-CoA mutase  28.97 
 
 		 633 aa  260  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800977  normal  0.217414 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1921  methylmalonyl-CoA mutase  31.27 
 
 		 601 aa  259  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00796016  normal  0.671948 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1164  methylmalonyl-CoA mutase  28.16 
 
 		 713 aa  258  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197015  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05680  methylmalonyl-CoA mutase  26.91 
 
 		 726 aa  259  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1760  methylmalonyl-CoA mutase  27.25 
 
 		 718 aa  257  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.226069 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1920  methylmalonyl-CoA mutase large subunit  26.84 
 
 		 720 aa  257  5e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0552222  normal  0.617547 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3042  methylmalonyl-CoA mutase  28.24 
 
 		 720 aa  257  6e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.057217 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4573  methylmalonyl-CoA mutase  28.38 
 
 		 720 aa  256  7e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2505  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  27.51 
 
 		 736 aa  256  8e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000422516  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1292  methylmalonyl-CoA mutase  29.31 
 
 		 714 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3021  methylmalonyl-CoA mutase  27.4 
 
 		 718 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.954275 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1762  methylmalonyl-CoA mutase  29.6 
 
 		 621 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223035 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0875  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  28.13 
 
 		 1081 aa  255  2.0000000000000002e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.036821 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3304  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  32.63 
 
 		 719 aa  254  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00679496  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_002950  PG1657  methylmalonyl-CoA mutase  27.31 
 
 		 715 aa  254  4.0000000000000004e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.387473 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4373  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  27.72 
 
 		 735 aa  253  6e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6418  methylmalonyl-CoA mutase  26.66 
 
 		 729 aa  253  9.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3123  methylmalonyl-CoA mutase, small subunit  31.13 
 
 		 615 aa  253  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.987709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3184  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  31.13 
 
 		 615 aa  253  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.170851 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>