More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2480 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2480  methylmalonyl-CoA mutase  100 
 
 		 698 aa  1363    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0544  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  40.88 
 
 		 723 aa  462  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2761  methylmalonyl-CoA mutase  44.68 
 
 		 630 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.257221  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3871  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  40.83 
 
 		 720 aa  462  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.949138  normal  0.194963 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1348  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  38.51 
 
 		 713 aa  424  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000457861  unclonable  0.00000004793 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3006  methylmalonyl-CoA mutase  43.19 
 
 		 660 aa  419  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.84067  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3023  methylmalonyl-CoA mutase small subunit (MCM-beta)  42.2 
 
 		 621 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05670  methylmalonyl-CoA mutase, N-terminal domain/subunit  44.43 
 
 		 622 aa  413  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6419  Methylmalonyl-CoA mutase  42.38 
 
 		 593 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3135  methylmalonyl-CoA mutase  42.03 
 
 		 629 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4374  Methylmalonyl-CoA mutase  40.67 
 
 		 640 aa  399  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2295  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  35.45 
 
 		 681 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0278  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  37.97 
 
 		 682 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5544  Methylmalonyl-CoA mutase  41.53 
 
 		 644 aa  392  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.11647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1984  Methylmalonyl-CoA mutase  34.44 
 
 		 684 aa  388  1e-106  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611894  normal  0.0597183 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2345  Methylmalonyl-CoA mutase  43.87 
 
 		 605 aa  384  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.418628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3187  Methylmalonyl-CoA mutase  38.93 
 
 		 633 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800977  normal  0.217414 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2041  Methylmalonyl-CoA mutase  41.69 
 
 		 623 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2665  Methylmalonyl-CoA mutase  43.28 
 
 		 605 aa  375  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1762  methylmalonyl-CoA mutase  42.04 
 
 		 621 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223035 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1929  methylmalonyl-CoA mutase  40.73 
 
 		 623 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.102484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2636  methylmalonyl-CoA mutase  41.11 
 
 		 629 aa  371  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.668897  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2388  methylmalonyl-CoA mutase  42.98 
 
 		 605 aa  368  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.55342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1921  methylmalonyl-CoA mutase  41 
 
 		 601 aa  369  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00796016  normal  0.671948 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2236  methylmalonyl-CoA mutase  40.35 
 
 		 639 aa  361  2e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1285  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  35.24 
 
 		 727 aa  360  4e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.238431  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1943  methylmalonyl-CoA mutase  47.07 
 
 		 653 aa  353  5e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133903 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2506  Methylmalonyl-CoA mutase  46.17 
 
 		 614 aa  352  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000082079  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3305  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  39.33 
 
 		 706 aa  351  3e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.457427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3536  methylmalonyl-CoA mutase  39.53 
 
 		 623 aa  350  6e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0287465  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5425  methylmalonyl-CoA mutase  44.86 
 
 		 612 aa  319  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.559772  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4729  methylmalonyl-CoA mutase  39.82 
 
 		 610 aa  311  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3134  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  37.48 
 
 		 615 aa  307  3e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11522  methylmalonyl-CoA mutase small subunit mutA  37.48 
 
 		 623 aa  306  6e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.384078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3629  methylmalonyl-CoA mutase  41.6 
 
 		 489 aa  303  8.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3123  methylmalonyl-CoA mutase, small subunit  36.94 
 
 		 615 aa  301  3e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.987709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3184  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  36.94 
 
 		 615 aa  301  3e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.170851 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2200  methylmalonyl-CoA mutase  36.77 
 
 		 624 aa  294  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.53913 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2104  Methylmalonyl-CoA mutase  35.53 
 
 		 597 aa  280  5e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0217  methylmalonyl-CoA mutase  43.64 
 
 		 611 aa  278  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3650  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  37.17 
 
 		 620 aa  277  4e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2762  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  36.71 
 
 		 626 aa  276  8e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0864334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2419  Methylmalonyl-CoA mutase  36.58 
 
 		 652 aa  271  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.751014  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1656  methylmalonyl-CoA mutase, small subunit  29.76 
 
 		 618 aa  265  3e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.50388 
 
 
-
 
NC_004310  BR1190  methylmalonyl-CoA mutase  30.75 
 
 		 712 aa  262  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.942727  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2192  methylmalonyl-CoA mutase  32.85 
 
 		 709 aa  257  6e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172259  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0867  methylmalonyl-CoA mutase  32.85 
 
 		 709 aa  256  8e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2001  methylmalonyl-CoA mutase  30.79 
 
 		 714 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2300  methylmalonyl-CoA mutase  32.17 
 
 		 709 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4237  methylmalonyl-CoA mutase  29.59 
 
 		 712 aa  254  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2891  methylmalonyl-CoA mutase  31.98 
 
 		 716 aa  251  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1221  methylmalonyl-CoA mutase  28.07 
 
 		 715 aa  250  7e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.584735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3053  methylmalonyl-CoA mutase  29.95 
 
 		 714 aa  250  8e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0388  methylmalonyl-CoA mutase  30.87 
 
 		 714 aa  249  9e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3244  methylmalonyl-CoA mutase  29.68 
 
 		 714 aa  249  9e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98625  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4213  methylmalonyl-CoA mutase  29.68 
 
 		 714 aa  249  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1320  methylmalonyl-CoA mutase  29.73 
 
 		 722 aa  249  2e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02748  methylmalonyl-CoA mutase  29.66 
 
 		 714 aa  247  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6511  methylmalonyl-CoA mutase  29.87 
 
 		 712 aa  247  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02711  hypothetical protein  29.66 
 
 		 714 aa  247  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3367  methylmalonyl-CoA mutase  28.27 
 
 		 709 aa  248  4e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3075  methylmalonyl-CoA mutase  29.66 
 
 		 714 aa  247  4e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3260  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  29.24 
 
 		 713 aa  247  4e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0793  methylmalonyl-CoA mutase  29.66 
 
 		 714 aa  247  4e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0776  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  29.66 
 
 		 714 aa  247  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0811  methylmalonyl-CoA mutase  28.77 
 
 		 714 aa  246  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251875  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3785  Methylmalonyl-CoA mutase  40.18 
 
 		 621 aa  245  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.546238 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2510  methylmalonyl-CoA mutase  28.81 
 
 		 722 aa  244  5e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6136  methylmalonyl-CoA mutase  29.64 
 
 		 717 aa  243  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0179109  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3538  methylmalonyl-CoA mutase  30.94 
 
 		 736 aa  243  9e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.162308  normal  0.256268 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5687  methylmalonyl-CoA mutase  28.2 
 
 		 712 aa  243  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3681  methylmalonyl-CoA mutase  31.61 
 
 		 714 aa  241  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0079  methylmalonyl-CoA mutase  28.25 
 
 		 706 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.373309  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6098  methylmalonyl-CoA mutase  30.77 
 
 		 712 aa  240  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.23929  normal  0.554736 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0726  methylmalonyl-CoA mutase  27.77 
 
 		 712 aa  239  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.999011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3188  Methylmalonyl-CoA mutase  30.18 
 
 		 725 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.36577  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1927  methylmalonyl-CoA mutase  30.77 
 
 		 719 aa  238  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.273596  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6640  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  28.6 
 
 		 724 aa  238  4e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.70273 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1349  methylmalonyl-CoA mutase  29.65 
 
 		 733 aa  237  5.0000000000000005e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0148615  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1760  methylmalonyl-CoA mutase  29.86 
 
 		 718 aa  237  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.226069 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3486  methylmalonyl-CoA mutase  28.47 
 
 		 721 aa  234  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1702  methylmalonyl-CoA mutase  30.45 
 
 		 718 aa  234  6e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321557 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2161  methylmalonyl-CoA mutase  27.93 
 
 		 723 aa  233  8.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385791  normal  0.481947 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2383  methylmalonyl-CoA mutase  28.26 
 
 		 718 aa  233  9e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2805  methylmalonyl-CoA mutase  27.64 
 
 		 719 aa  233  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1849  methylmalonyl-CoA mutase  28.14 
 
 		 720 aa  233  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1014  methylmalonyl-CoA mutase  28.65 
 
 		 719 aa  233  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.856859 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2039  methylmalonyl-CoA mutase  29.74 
 
 		 719 aa  232  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3304  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  29.97 
 
 		 719 aa  232  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00679496  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2040  methylmalonyl-CoA mutase  28.14 
 
 		 720 aa  232  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0545  methylmalonyl-CoA mutase  29.57 
 
 		 740 aa  231  4e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3021  methylmalonyl-CoA mutase  30.03 
 
 		 718 aa  231  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.954275 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1120  methylmalonyl-CoA mutase  37.16 
 
 		 480 aa  230  7e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.170859 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0279  methylmalonyl-CoA mutase  28.22 
 
 		 731 aa  230  8e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1920  methylmalonyl-CoA mutase large subunit  29.67 
 
 		 720 aa  229  9e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0552222  normal  0.617547 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2294  methylmalonyl-CoA mutase  26.98 
 
 		 731 aa  229  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.895743  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3753  methylmalonyl-CoA mutase  28.31 
 
 		 738 aa  227  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801598  normal  0.879758 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3005  methylmalonyl-CoA mutase  32.61 
 
 		 754 aa  226  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.598546  normal  0.356991 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2697  methylmalonyl-CoA mutase  29.15 
 
 		 720 aa  226  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.20812 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2127  methylmalonyl-CoA mutase  27.47 
 
 		 720 aa  225  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.063815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>