More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2419 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2419  Methylmalonyl-CoA mutase  100 
 
 		 652 aa  1264    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.751014  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3123  methylmalonyl-CoA mutase, small subunit  50.16 
 
 		 615 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.987709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3184  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  50.16 
 
 		 615 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.170851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3134  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  49.84 
 
 		 615 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2762  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  51.33 
 
 		 626 aa  488  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0864334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3650  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  48.82 
 
 		 620 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11522  methylmalonyl-CoA mutase small subunit mutA  48.73 
 
 		 623 aa  463  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.384078 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2104  Methylmalonyl-CoA mutase  46.81 
 
 		 597 aa  427  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2506  Methylmalonyl-CoA mutase  43.09 
 
 		 614 aa  364  3e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000082079  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2761  methylmalonyl-CoA mutase  43.66 
 
 		 630 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.257221  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05670  methylmalonyl-CoA mutase, N-terminal domain/subunit  44.22 
 
 		 622 aa  353  8e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3006  methylmalonyl-CoA mutase  42.58 
 
 		 660 aa  349  1e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.84067  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4374  Methylmalonyl-CoA mutase  41.44 
 
 		 640 aa  347  5e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6419  Methylmalonyl-CoA mutase  42.83 
 
 		 593 aa  337  2.9999999999999997e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3187  Methylmalonyl-CoA mutase  38.99 
 
 		 633 aa  334  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800977  normal  0.217414 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5544  Methylmalonyl-CoA mutase  41.18 
 
 		 644 aa  332  1e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.11647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1943  methylmalonyl-CoA mutase  39.26 
 
 		 653 aa  305  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133903 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1921  methylmalonyl-CoA mutase  40.93 
 
 		 601 aa  302  1e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00796016  normal  0.671948 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2480  methylmalonyl-CoA mutase  36.58 
 
 		 698 aa  291  4e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3023  methylmalonyl-CoA mutase small subunit (MCM-beta)  36.67 
 
 		 621 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2636  methylmalonyl-CoA mutase  36.89 
 
 		 629 aa  248  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.668897  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2041  Methylmalonyl-CoA mutase  36.78 
 
 		 623 aa  247  4e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1929  methylmalonyl-CoA mutase  36.05 
 
 		 623 aa  243  7e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.102484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5425  methylmalonyl-CoA mutase  36.86 
 
 		 612 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.559772  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1984  Methylmalonyl-CoA mutase  30.78 
 
 		 684 aa  241  4e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611894  normal  0.0597183 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1762  methylmalonyl-CoA mutase  36.63 
 
 		 621 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223035 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2236  methylmalonyl-CoA mutase  35.77 
 
 		 639 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2345  Methylmalonyl-CoA mutase  36.3 
 
 		 605 aa  228  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.418628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3536  methylmalonyl-CoA mutase  35.59 
 
 		 623 aa  228  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0287465  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2295  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  28.38 
 
 		 681 aa  223  9e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2665  Methylmalonyl-CoA mutase  35.73 
 
 		 605 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22180  methylmalonyl-CoA mutase, N-terminal domain/subunit  33.33 
 
 		 710 aa  222  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0921601  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3135  methylmalonyl-CoA mutase  36.38 
 
 		 629 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2388  methylmalonyl-CoA mutase  35.68 
 
 		 605 aa  221  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.55342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0217  methylmalonyl-CoA mutase  42.49 
 
 		 611 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3629  methylmalonyl-CoA mutase  38.51 
 
 		 489 aa  208  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0278  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  30.55 
 
 		 682 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1656  methylmalonyl-CoA mutase, small subunit  28.62 
 
 		 618 aa  196  9e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.50388 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4729  methylmalonyl-CoA mutase  35.52 
 
 		 610 aa  196  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3545  methylmalonyl-CoA mutase  36.42 
 
 		 569 aa  193  7e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3785  Methylmalonyl-CoA mutase  34.05 
 
 		 621 aa  189  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.546238 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5167  Methylmalonyl-CoA mutase  37.84 
 
 		 600 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0544  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  32.31 
 
 		 723 aa  173  7.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3871  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  32.03 
 
 		 720 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.949138  normal  0.194963 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1348  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  30.49 
 
 		 713 aa  160  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000457861  unclonable  0.00000004793 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3305  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  34.22 
 
 		 706 aa  160  9e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.457427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2200  methylmalonyl-CoA mutase  31.62 
 
 		 624 aa  157  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.53913 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1285  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  28.69 
 
 		 727 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.238431  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0857  methylmalonyl-CoA mutase  34.2 
 
 		 479 aa  155  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315986  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2510  methylmalonyl-CoA mutase  27.27 
 
 		 722 aa  151  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3753  methylmalonyl-CoA mutase  27.9 
 
 		 738 aa  150  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801598  normal  0.879758 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1120  methylmalonyl-CoA mutase  32.05 
 
 		 480 aa  150  8e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.170859 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2161  methylmalonyl-CoA mutase  27.09 
 
 		 723 aa  150  9e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385791  normal  0.481947 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2891  methylmalonyl-CoA mutase  28.25 
 
 		 716 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3398  methylmalonyl-CoA mutase  27.27 
 
 		 731 aa  148  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.526303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1849  methylmalonyl-CoA mutase  26.12 
 
 		 720 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2383  methylmalonyl-CoA mutase  26.8 
 
 		 718 aa  147  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2805  methylmalonyl-CoA mutase  26.85 
 
 		 719 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4006  methylmalonyl-CoA mutase  27.52 
 
 		 716 aa  147  9e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3486  methylmalonyl-CoA mutase  27.13 
 
 		 721 aa  146  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2040  methylmalonyl-CoA mutase  27.18 
 
 		 720 aa  146  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1014  methylmalonyl-CoA mutase  26.58 
 
 		 719 aa  146  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.856859 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0079  methylmalonyl-CoA mutase  27.14 
 
 		 706 aa  145  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.373309  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2127  methylmalonyl-CoA mutase  26.68 
 
 		 720 aa  143  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.063815  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2697  methylmalonyl-CoA mutase  26.71 
 
 		 720 aa  143  9e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.20812 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3681  methylmalonyl-CoA mutase  27.52 
 
 		 714 aa  143  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3244  methylmalonyl-CoA mutase  28.18 
 
 		 714 aa  140  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98625  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02748  methylmalonyl-CoA mutase  28.18 
 
 		 714 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2192  methylmalonyl-CoA mutase  27.06 
 
 		 709 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02711  hypothetical protein  28.18 
 
 		 714 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3075  methylmalonyl-CoA mutase  28.18 
 
 		 714 aa  139  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0793  methylmalonyl-CoA mutase  28.18 
 
 		 714 aa  139  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3005  methylmalonyl-CoA mutase  30.31 
 
 		 754 aa  139  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.598546  normal  0.356991 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0388  methylmalonyl-CoA mutase  28.03 
 
 		 714 aa  139  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3053  methylmalonyl-CoA mutase  27.97 
 
 		 714 aa  139  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0867  methylmalonyl-CoA mutase  27.06 
 
 		 709 aa  139  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0776  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  28.18 
 
 		 714 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4213  methylmalonyl-CoA mutase  27.97 
 
 		 714 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1190  methylmalonyl-CoA mutase  27.65 
 
 		 712 aa  138  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.942727  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1944  methylmalonyl-CoA mutase  29.12 
 
 		 740 aa  138  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.132442 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1927  methylmalonyl-CoA mutase  28.83 
 
 		 719 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.273596  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1320  methylmalonyl-CoA mutase  28.42 
 
 		 722 aa  138  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5545  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  29.46 
 
 		 738 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1760  methylmalonyl-CoA mutase  28.95 
 
 		 718 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.226069 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2001  methylmalonyl-CoA mutase  27.43 
 
 		 714 aa  138  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0811  methylmalonyl-CoA mutase  32.17 
 
 		 714 aa  137  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251875  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3538  methylmalonyl-CoA mutase  28.6 
 
 		 736 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.162308  normal  0.256268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3021  methylmalonyl-CoA mutase  29.5 
 
 		 718 aa  137  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.954275 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0545  methylmalonyl-CoA mutase  27.84 
 
 		 740 aa  137  9e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2039  methylmalonyl-CoA mutase  28.38 
 
 		 719 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6641  Methylmalonyl-CoA mutase  31.76 
 
 		 448 aa  135  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2300  methylmalonyl-CoA mutase  26.62 
 
 		 709 aa  134  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1165  methylmalonyl-CoA mutase  28.01 
 
 		 589 aa  134  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3188  Methylmalonyl-CoA mutase  29.28 
 
 		 725 aa  133  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.36577  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3872  methylmalonyl-CoA mutase  27.23 
 
 		 740 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.231489  normal  0.125312 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2294  methylmalonyl-CoA mutase  25.68 
 
 		 731 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.895743  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4731  methylmalonyl-CoA mutase  29.55 
 
 		 718 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.38651 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6418  methylmalonyl-CoA mutase  28.6 
 
 		 729 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0279  methylmalonyl-CoA mutase  27.25 
 
 		 731 aa  131  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4569  methylmalonyl-CoA mutase  29.12 
 
 		 703 aa  131  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.365134 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>