More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4794 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02748  methylmalonyl-CoA mutase  62.89 
 
 		 714 aa  843    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0776  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  62.74 
 
 		 714 aa  842    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1173  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  64.37 
 
 		 1106 aa  909    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00593374 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1349  methylmalonyl-CoA mutase  68.9 
 
 		 733 aa  978    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0148615  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6136  methylmalonyl-CoA mutase  61.65 
 
 		 717 aa  833    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0179109  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_002950  PG1657  methylmalonyl-CoA mutase  67.55 
 
 		 715 aa  945    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.387473 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02711  hypothetical protein  62.89 
 
 		 714 aa  843    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1190  methylmalonyl-CoA mutase  60.58 
 
 		 712 aa  859    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.942727  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2001  methylmalonyl-CoA mutase  60.65 
 
 		 714 aa  854    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4006  methylmalonyl-CoA mutase  65.16 
 
 		 716 aa  928    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4573  methylmalonyl-CoA mutase  86.09 
 
 		 720 aa  1249    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2762  methylmalonyl-CoA mutase  72.7 
 
 		 740 aa  1068    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0875  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  66.47 
 
 		 1081 aa  952    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.036821 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11523  methylmalonyl-CoA mutase  75.82 
 
 		 750 aa  1053    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.26728 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3075  methylmalonyl-CoA mutase  63.03 
 
 		 714 aa  845    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2238  methylmalonyl-CoA mutase  77.98 
 
 		 722 aa  1164    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2127  methylmalonyl-CoA mutase  64.9 
 
 		 720 aa  918    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.063815  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3304  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  68.77 
 
 		 719 aa  982    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00679496  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2192  methylmalonyl-CoA mutase  64.52 
 
 		 709 aa  889    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172259  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1292  methylmalonyl-CoA mutase  63.17 
 
 		 714 aa  914    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1223  methylmalonyl-CoA mutase  64.36 
 
 		 712 aa  936    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0279  methylmalonyl-CoA mutase  72.57 
 
 		 731 aa  1028    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3872  methylmalonyl-CoA mutase  69.61 
 
 		 740 aa  1000    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.231489  normal  0.125312 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1849  methylmalonyl-CoA mutase  65.49 
 
 		 720 aa  926    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2479  methylmalonyl-CoA mutase  75.58 
 
 		 732 aa  1140    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3021  methylmalonyl-CoA mutase  79.02 
 
 		 718 aa  1171    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.954275 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1167  methylmalonyl-CoA mutase  63.65 
 
 		 712 aa  922    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.169366  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3784  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  72.56 
 
 		 736 aa  1036    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.362344 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3486  methylmalonyl-CoA mutase  65.65 
 
 		 721 aa  915    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1983  methylmalonyl-CoA mutase  66.81 
 
 		 714 aa  955    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.774356  normal  0.0211504 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3005  methylmalonyl-CoA mutase  76.26 
 
 		 754 aa  1048    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.598546  normal  0.356991 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2891  methylmalonyl-CoA mutase  63.73 
 
 		 716 aa  850    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0545  methylmalonyl-CoA mutase  69.61 
 
 		 740 aa  1004    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3538  methylmalonyl-CoA mutase  78.81 
 
 		 736 aa  1163    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.162308  normal  0.256268 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0811  methylmalonyl-CoA mutase  63.96 
 
 		 714 aa  860    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251875  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1944  methylmalonyl-CoA mutase  72.55 
 
 		 740 aa  1043    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.132442 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3367  methylmalonyl-CoA mutase  62.17 
 
 		 709 aa  840    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2805  methylmalonyl-CoA mutase  63.73 
 
 		 719 aa  896    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2039  methylmalonyl-CoA mutase  79.09 
 
 		 719 aa  1184    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1760  methylmalonyl-CoA mutase  79.16 
 
 		 718 aa  1184    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.226069 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2161  methylmalonyl-CoA mutase  63.73 
 
 		 723 aa  883    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385791  normal  0.481947 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4237  methylmalonyl-CoA mutase  61.79 
 
 		 712 aa  829    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1702  methylmalonyl-CoA mutase  69.46 
 
 		 718 aa  949    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321557 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1927  methylmalonyl-CoA mutase  79.31 
 
 		 719 aa  1165    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.273596  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05680  methylmalonyl-CoA mutase  77.96 
 
 		 726 aa  1103    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2638  methylmalonyl-CoA mutase  80.28 
 
 		 720 aa  1179    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3260  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  67.4 
 
 		 713 aa  941    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2294  methylmalonyl-CoA mutase  71.26 
 
 		 731 aa  1024    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.895743  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5337  methylmalonyl-CoA mutase  99.31 
 
 		 721 aa  1462    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.759699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5166  methylmalonyl-CoA mutase  75.29 
 
 		 724 aa  1057    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1320  methylmalonyl-CoA mutase  66.1 
 
 		 722 aa  947    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6418  methylmalonyl-CoA mutase  78.76 
 
 		 729 aa  1118    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1865  methylmalonyl-CoA mutase  65.34 
 
 		 661 aa  843    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1221  methylmalonyl-CoA mutase  62.7 
 
 		 715 aa  817    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.584735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3122  methylmalonyl-CoA mutase  75.54 
 
 		 760 aa  1061    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.203405  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6511  methylmalonyl-CoA mutase  62.12 
 
 		 712 aa  834    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2420  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  73.6 
 
 		 763 aa  1041    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2505  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  76.92 
 
 		 736 aa  1086    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000422516  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22170  methylmalonyl-CoA mutase  72.71 
 
 		 754 aa  1044    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.366718  normal  0.398515 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0856  methylmalonyl-CoA mutase  70.85 
 
 		 714 aa  1040    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1119  methylmalonyl-CoA mutase  70.5 
 
 		 716 aa  988    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.262731 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51830  methylmalonyl-coa mutase  56.56 
 
 		 719 aa  789    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0388  methylmalonyl-CoA mutase  62.21 
 
 		 714 aa  863    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0868  methylmalonyl-CoA mutase  63.85 
 
 		 715 aa  934    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5261  methylmalonyl-CoA mutase  100 
 
 		 721 aa  1472    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.145645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1284  methylmalonyl-CoA mutase  67.17 
 
 		 723 aa  978    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.811968  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4731  methylmalonyl-CoA mutase  79.49 
 
 		 718 aa  1136    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.38651 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1164  methylmalonyl-CoA mutase  62.64 
 
 		 713 aa  916    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197015  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0014  methylmalonyl-CoA mutase  68.88 
 
 		 711 aa  971    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185174  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3681  methylmalonyl-CoA mutase  65.1 
 
 		 714 aa  880    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0793  methylmalonyl-CoA mutase  62.89 
 
 		 714 aa  843    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6098  methylmalonyl-CoA mutase  60.67 
 
 		 712 aa  807    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.23929  normal  0.554736 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0079  methylmalonyl-CoA mutase  64.85 
 
 		 706 aa  904    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.373309  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0932  methylmalonyl-CoA mutase  64.17 
 
 		 724 aa  885    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3053  methylmalonyl-CoA mutase  62.89 
 
 		 714 aa  842    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3544  methylmalonyl-CoA mutase  74.89 
 
 		 720 aa  1034    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143219  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5804  methylmalonyl-CoA mutase  64.58 
 
 		 972 aa  910    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.256305  normal  0.17905 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3183  methylmalonyl-CoA mutase  75.54 
 
 		 760 aa  1061    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0724467 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0726  methylmalonyl-CoA mutase  63.81 
 
 		 712 aa  872    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.999011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4213  methylmalonyl-CoA mutase  62.44 
 
 		 714 aa  839    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2763  methylmalonyl-CoA mutase  75.97 
 
 		 751 aa  1074    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0863781  normal  0.728933 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4794  methylmalonyl-CoA mutase  100 
 
 		 721 aa  1472    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.134601  normal  0.670991 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2510  methylmalonyl-CoA mutase  65.2 
 
 		 722 aa  921    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2383  methylmalonyl-CoA mutase  63.8 
 
 		 718 aa  904    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2697  methylmalonyl-CoA mutase  64.09 
 
 		 720 aa  894    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.20812 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2040  methylmalonyl-CoA mutase  65.49 
 
 		 720 aa  927    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3398  methylmalonyl-CoA mutase  64.44 
 
 		 731 aa  909    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.526303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3753  methylmalonyl-CoA mutase  64.9 
 
 		 738 aa  895    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801598  normal  0.879758 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1014  methylmalonyl-CoA mutase  65.25 
 
 		 719 aa  927    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.856859 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2199  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  69.67 
 
 		 727 aa  983    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0867  methylmalonyl-CoA mutase  64.66 
 
 		 709 aa  890    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3244  methylmalonyl-CoA mutase  62.89 
 
 		 714 aa  843    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98625  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3042  methylmalonyl-CoA mutase  86.79 
 
 		 720 aa  1253    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.057217 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3133  methylmalonyl-CoA mutase  75.54 
 
 		 760 aa  1063    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2300  methylmalonyl-CoA mutase  64.22 
 
 		 709 aa  871    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3630  methylmalonyl-CoA mutase  73.44 
 
 		 717 aa  1058    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5687  methylmalonyl-CoA mutase  61.3 
 
 		 712 aa  836    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1736  methylmalonyl-CoA mutase  88.77 
 
 		 721 aa  1268    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3649  methylmalonyl-CoA mutase  75.82 
 
 		 752 aa  1072    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0910  methylmalonyl-CoA mutase  63.5 
 
 		 739 aa  880    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.736612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>