More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5087 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 243 aa  461  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1425  lipoprotein signal peptidase  69.19 
 
 		 201 aa  207  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.0381743 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2912  peptidase A8 signal peptidase II  57.79 
 
 		 193 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000001174  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  47.34 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  54.86 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3053  peptidase A8, signal peptidase II  44.19 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507002  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  44.44 
 
 		 195 aa  146  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  46.37 
 
 		 224 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3249  lipoprotein signal peptidase  51.85 
 
 		 238 aa  145  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.620504  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3113  lipoprotein signal peptidase  48.28 
 
 		 230 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.719311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5747  lipoprotein signal peptidase  45.88 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2773  lipoprotein signal peptidase  47.16 
 
 		 234 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  0.677006 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3196  lipoprotein signal peptidase  50.31 
 
 		 212 aa  135  8e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000467207  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  49.68 
 
 		 197 aa  132  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1419  lipoprotein signal peptidase  53.55 
 
 		 165 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1122  signal peptidase II  45.83 
 
 		 182 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3093  lipoprotein signal peptidase  49.68 
 
 		 230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280943  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3153  lipoprotein signal peptidase  49.68 
 
 		 230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2882  lipoprotein signal peptidase  48.78 
 
 		 182 aa  128  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1031  signal peptidase II  47.56 
 
 		 182 aa  126  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0513962  normal  0.0206613 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3428  lipoprotein signal peptidase  43.14 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319038  decreased coverage  0.00618792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3202  lipoprotein signal peptidase  46.88 
 
 		 232 aa  123  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  43.02 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5736  lipoprotein signal peptidase  50.34 
 
 		 291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27280  lipoprotein signal peptidase  46.76 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.097176  normal  0.384801 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1580  lipoprotein signal peptidase  44.76 
 
 		 190 aa  106  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2402  lipoprotein signal peptidase  43.75 
 
 		 213 aa  105  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  40.11 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1579  lipoprotein signal peptidase  45.14 
 
 		 188 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0479337  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1293  lipoprotein signal peptidase  44.44 
 
 		 210 aa  98.2  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248018  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22710  lipoprotein signal peptidase  52.03 
 
 		 227 aa  93.6  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.52944  normal  0.101415 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2628  lipoprotein signal peptidase  45.58 
 
 		 182 aa  87  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.191199  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0140  lipoprotein signal peptidase  41.18 
 
 		 182 aa  86.7  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0759445  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  41.67 
 
 		 149 aa  84.7  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  39.51 
 
 		 168 aa  81.3  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1116  signal peptidase II  39.88 
 
 		 169 aa  80.9  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  40.41 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  33.79 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  35.79 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  38.3 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  40.14 
 
 		 143 aa  78.2  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  34.69 
 
 		 178 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 		 169 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  34.44 
 
 		 174 aa  77.4  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 		 155 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  38.75 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  37.14 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13510  signal peptidase II  42.48 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.376411  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  32.97 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  38.16 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  42 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  40.44 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2615  signal peptidase II  37.89 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0401  lipoprotein signal peptidase  33.68 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  37.96 
 
 		 170 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1860  signal peptidase II  36.3 
 
 		 174 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  39.88 
 
 		 166 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  40.4 
 
 		 157 aa  74.3  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  37.21 
 
 		 149 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  40.52 
 
 		 159 aa  73.9  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  34.04 
 
 		 145 aa  74.3  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  32.41 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  34.69 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2357  lipoprotein signal peptidase  31.82 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0614763  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  35.16 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0363  lipoprotein signal peptidase  37.42 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1604  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  normal  0.485547 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  30.56 
 
 		 163 aa  72  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 		 163 aa  71.6  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  38.89 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1577  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 167 aa  70.5  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  37.84 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1520  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 167 aa  70.5  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0161435  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  32.68 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  32.68 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  31.01 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  37.84 
 
 		 153 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  32.68 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  38.71 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  34.07 
 
 		 173 aa  69.7  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0950  lipoprotein signal peptidase  38.21 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  31.65 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  42.65 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  38.19 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  34.21 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1798  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226903  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2206  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.759642  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  37.16 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  32.5 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  31.03 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  31.72 
 
 		 173 aa  68.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 166 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  42.34 
 
 		 171 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2542  lipoprotein signal peptidase  32.1 
 
 		 152 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0674041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>