More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1239 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 165 aa  335  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  70.81 
 
 		 166 aa  238  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  70.19 
 
 		 178 aa  231  5e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  61.18 
 
 		 156 aa  192  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1117  lipoprotein signal peptidase  51.27 
 
 		 165 aa  148  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.149841  normal  0.0706096 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0487  lipoprotein signal peptidase  50.32 
 
 		 178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  40.61 
 
 		 164 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  40.74 
 
 		 162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  43.14 
 
 		 161 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  39.02 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  39.35 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  42.11 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  45.52 
 
 		 160 aa  120  9e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  39.1 
 
 		 161 aa  118  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  43.33 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  47.48 
 
 		 166 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  42.11 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  42.11 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  38.96 
 
 		 155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  46.94 
 
 		 174 aa  110  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  42.11 
 
 		 166 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  42.11 
 
 		 166 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  42.11 
 
 		 166 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  42.11 
 
 		 166 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  42.11 
 
 		 166 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  42.11 
 
 		 166 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  42.11 
 
 		 166 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  40.54 
 
 		 153 aa  110  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  42.11 
 
 		 166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  39.58 
 
 		 202 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  41.33 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  44.9 
 
 		 173 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  41.45 
 
 		 166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  40.79 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  46.26 
 
 		 174 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  40.79 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  41.29 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  40.79 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  40.65 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  48.15 
 
 		 178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  42.76 
 
 		 164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  43.07 
 
 		 169 aa  107  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  41.22 
 
 		 163 aa  107  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  39.35 
 
 		 166 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  40.91 
 
 		 169 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  41.51 
 
 		 171 aa  105  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  40.91 
 
 		 169 aa  105  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  41.1 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  40.52 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  41.1 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  41.1 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3649  lipoprotein signal peptidase  41.67 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  40.49 
 
 		 171 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  40.76 
 
 		 173 aa  104  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  39.47 
 
 		 165 aa  104  7e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  38.71 
 
 		 170 aa  103  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  43.05 
 
 		 167 aa  103  8e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  38.89 
 
 		 235 aa  103  9e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  40.26 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  39.46 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  38.82 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 182 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  39.24 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0480  lipoprotein signal peptidase  41.89 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  35.48 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  39.35 
 
 		 164 aa  101  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  42.21 
 
 		 358 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 164 aa  101  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  43.24 
 
 		 166 aa  101  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 164 aa  101  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  41.03 
 
 		 170 aa  101  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  41.56 
 
 		 170 aa  100  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  41.03 
 
 		 170 aa  100  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  39.58 
 
 		 145 aa  100  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  41.03 
 
 		 170 aa  100  8e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  41.03 
 
 		 170 aa  100  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  39.35 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  39.35 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  39.35 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  39.35 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  44.6 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 		 154 aa  99.8  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1910  lipoprotein signal peptidase  42.21 
 
 		 154 aa  99.8  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  40.65 
 
 		 173 aa  99.4  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 169 aa  99.8  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3473  lipoprotein signal peptidase  40.71 
 
 		 170 aa  99.4  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911066  normal  0.126226 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  39.35 
 
 		 164 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  37.34 
 
 		 180 aa  98.6  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  39.35 
 
 		 164 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  39.62 
 
 		 170 aa  98.6  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  39.62 
 
 		 170 aa  99  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  39.62 
 
 		 170 aa  98.6  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  39.62 
 
 		 170 aa  98.6  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  39.62 
 
 		 170 aa  98.6  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  39.62 
 
 		 170 aa  98.6  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  39.62 
 
 		 170 aa  99  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  43.48 
 
 		 170 aa  99  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>