More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1893 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 202 aa  413  1e-114  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  65.35 
 
 		 235 aa  286  1e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0401  lipoprotein signal peptidase  73.66 
 
 		 216 aa  248  4e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0363  lipoprotein signal peptidase  75.44 
 
 		 171 aa  246  1e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  58 
 
 		 154 aa  159  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  55.1 
 
 		 154 aa  155  3e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  54.42 
 
 		 154 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  47.5 
 
 		 165 aa  149  3e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  48.7 
 
 		 163 aa  148  4e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  50.33 
 
 		 157 aa  148  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  50.66 
 
 		 159 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  50.34 
 
 		 167 aa  145  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  48.3 
 
 		 169 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  45.51 
 
 		 172 aa  143  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  46.94 
 
 		 169 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  48.45 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  50.36 
 
 		 170 aa  142  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  44.65 
 
 		 176 aa  141  8e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 163 aa  141  8e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  52.55 
 
 		 162 aa  140  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  49.66 
 
 		 168 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  45.22 
 
 		 169 aa  139  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  45.22 
 
 		 169 aa  139  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0853  signal peptidase II  51.63 
 
 		 155 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  48.32 
 
 		 173 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  44.87 
 
 		 180 aa  135  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  43.95 
 
 		 169 aa  134  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  45.96 
 
 		 170 aa  134  7.000000000000001e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  45.35 
 
 		 166 aa  134  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  46.2 
 
 		 168 aa  134  9e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  43.95 
 
 		 158 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  46.41 
 
 		 170 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  47.3 
 
 		 164 aa  132  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  42.14 
 
 		 170 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  45.75 
 
 		 170 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  51.47 
 
 		 171 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  46.62 
 
 		 164 aa  131  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  46.62 
 
 		 164 aa  131  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  46.62 
 
 		 164 aa  131  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  46.62 
 
 		 164 aa  131  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  46.62 
 
 		 164 aa  131  6.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  46.62 
 
 		 164 aa  131  6.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  47.13 
 
 		 163 aa  131  7.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  43.79 
 
 		 182 aa  130  9e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  44.44 
 
 		 176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  46.62 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  46.62 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  40.88 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  43.31 
 
 		 171 aa  128  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  49.66 
 
 		 173 aa  128  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  43.31 
 
 		 171 aa  128  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  43.31 
 
 		 171 aa  128  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 169 aa  128  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  48.77 
 
 		 174 aa  127  8.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  40.88 
 
 		 170 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  42.68 
 
 		 171 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  50.36 
 
 		 176 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  50.36 
 
 		 171 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0051  lipoprotein signal peptidase  44.85 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0475146 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0052  lipoprotein signal peptidase  44.85 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876995  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  46.1 
 
 		 169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  50.74 
 
 		 171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0051  lipoprotein signal peptidase  44.85 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  45.29 
 
 		 173 aa  126  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  37.89 
 
 		 178 aa  125  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0585  lipoprotein signal peptidase  45.27 
 
 		 166 aa  126  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00142013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  43.4 
 
 		 162 aa  124  9e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  44.24 
 
 		 166 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.322975 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0050  lipoprotein signal peptidase  44.24 
 
 		 166 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  41.33 
 
 		 168 aa  123  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  44 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  45.58 
 
 		 164 aa  122  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  47.62 
 
 		 166 aa  122  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  42.61 
 
 		 174 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  42.05 
 
 		 174 aa  121  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  41.4 
 
 		 171 aa  121  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  46.67 
 
 		 178 aa  121  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  38.51 
 
 		 168 aa  121  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  46.43 
 
 		 171 aa  120  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  45.58 
 
 		 166 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  45.58 
 
 		 166 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  45.58 
 
 		 166 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  45.58 
 
 		 166 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  46.31 
 
 		 164 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  45.58 
 
 		 166 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  45.58 
 
 		 166 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  45.58 
 
 		 166 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  45.58 
 
 		 166 aa  119  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  48.61 
 
 		 160 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  45.39 
 
 		 166 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  41.38 
 
 		 165 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  43.54 
 
 		 157 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  43.12 
 
 		 163 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  43.84 
 
 		 189 aa  118  6e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  49.25 
 
 		 176 aa  118  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  41.43 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  46.21 
 
 		 150 aa  116  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  45.16 
 
 		 172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  39.13 
 
 		 170 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  39.13 
 
 		 170 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>