More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0363 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0363  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 171 aa  343  8.999999999999999e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0401  lipoprotein signal peptidase  94.71 
 
 		 216 aa  298  2e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  76.47 
 
 		 235 aa  282  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  75.44 
 
 		 202 aa  274  4e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  56.67 
 
 		 154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  53.9 
 
 		 154 aa  161  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  53.25 
 
 		 154 aa  159  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0853  signal peptidase II  56.21 
 
 		 155 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  49.11 
 
 		 176 aa  149  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  45.29 
 
 		 172 aa  147  5e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  48.73 
 
 		 169 aa  147  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  44.31 
 
 		 169 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  43.71 
 
 		 169 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  51.77 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  48.41 
 
 		 163 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  50.34 
 
 		 163 aa  145  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  49.04 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  46.95 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  47.74 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  46.34 
 
 		 163 aa  141  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  47.22 
 
 		 182 aa  142  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  47.5 
 
 		 168 aa  141  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  44.97 
 
 		 173 aa  140  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  46.3 
 
 		 167 aa  140  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  45.22 
 
 		 169 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  44.51 
 
 		 168 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  45.22 
 
 		 169 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  47.59 
 
 		 170 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  42.44 
 
 		 170 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  48.03 
 
 		 173 aa  137  8.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  45.86 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  47.4 
 
 		 157 aa  136  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  45.86 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  43.95 
 
 		 169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  46.05 
 
 		 176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  45.86 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  45.86 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  45.86 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  48.99 
 
 		 180 aa  135  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  45.22 
 
 		 164 aa  134  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  45.22 
 
 		 164 aa  134  5e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  47.71 
 
 		 169 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  42.26 
 
 		 164 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  47.62 
 
 		 164 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  45.18 
 
 		 176 aa  134  8e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  46.63 
 
 		 166 aa  134  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  46.63 
 
 		 166 aa  134  8e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  46.63 
 
 		 166 aa  134  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  46.63 
 
 		 166 aa  134  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  46.63 
 
 		 166 aa  134  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  46.63 
 
 		 166 aa  134  8e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  46.63 
 
 		 166 aa  134  8e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  46.45 
 
 		 173 aa  133  9e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  45.86 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  45.86 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  46.63 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  46.63 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  45.57 
 
 		 174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  48.73 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  44.74 
 
 		 178 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  45.57 
 
 		 174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  44.52 
 
 		 170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  44.97 
 
 		 178 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0585  lipoprotein signal peptidase  46.2 
 
 		 166 aa  130  7.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00142013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  48.95 
 
 		 171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  47.97 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  45.86 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0051  lipoprotein signal peptidase  47.3 
 
 		 166 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0051  lipoprotein signal peptidase  47.3 
 
 		 166 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0475146 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0052  lipoprotein signal peptidase  47.3 
 
 		 166 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876995  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  46.2 
 
 		 171 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  43.4 
 
 		 170 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  47.92 
 
 		 176 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  45.57 
 
 		 171 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  41.76 
 
 		 167 aa  128  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  45.57 
 
 		 171 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  45.57 
 
 		 171 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  47.92 
 
 		 171 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  45.86 
 
 		 174 aa  127  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  40.7 
 
 		 171 aa  127  6e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  41.82 
 
 		 170 aa  127  6e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  45.45 
 
 		 172 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  43.42 
 
 		 165 aa  127  8.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  43.54 
 
 		 158 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  44.59 
 
 		 170 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  44.59 
 
 		 170 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  48.25 
 
 		 171 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  43.4 
 
 		 170 aa  127  9.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  44.59 
 
 		 170 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  44.17 
 
 		 166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0050  lipoprotein signal peptidase  46.62 
 
 		 166 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  46.67 
 
 		 172 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  46.62 
 
 		 166 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.322975 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  43.31 
 
 		 170 aa  125  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  43.42 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  44.16 
 
 		 182 aa  125  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  43.42 
 
 		 165 aa  124  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  46.45 
 
 		 164 aa  124  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  47.55 
 
 		 179 aa  123  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  43.56 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>