More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2555 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
169 aa  332  2e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  59.48 
 
 
163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  52 
 
 
154 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  47.77 
 
 
172 aa  151  5e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  47.2 
 
 
182 aa  150  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  49.36 
 
 
164 aa  150  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  47.71 
 
 
180 aa  149  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  52.74 
 
 
157 aa  149  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  46.67 
 
 
154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  46 
 
 
154 aa  144  5e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  53.02 
 
 
172 aa  141  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  53.38 
 
 
160 aa  141  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  51.92 
 
 
174 aa  141  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  52.74 
 
 
174 aa  141  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  53.02 
 
 
172 aa  141  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  54.35 
 
 
176 aa  140  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  52.05 
 
 
173 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  53.62 
 
 
178 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  41.21 
 
 
169 aa  137  7.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  45.12 
 
 
168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  40.72 
 
 
168 aa  135  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  55.63 
 
 
167 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  45.7 
 
 
158 aa  134  8e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  52.48 
 
 
189 aa  133  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  43.98 
 
 
170 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  44.91 
 
 
176 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  42.94 
 
 
171 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  44.44 
 
 
173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  48.65 
 
 
171 aa  132  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  51.33 
 
 
164 aa  132  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 
166 aa  130  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  42.86 
 
 
166 aa  130  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  47.47 
 
 
165 aa  130  6.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  45.45 
 
 
171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  45.45 
 
 
171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  48.37 
 
 
165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  45.45 
 
 
171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  48.65 
 
 
166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  44.51 
 
 
171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0853  signal peptidase II  49.26 
 
 
155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  47.47 
 
 
160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  48.87 
 
 
179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  49.32 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  44.74 
 
 
168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  43.64 
 
 
170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  43.64 
 
 
170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  44.85 
 
 
171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  42.17 
 
 
176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  43.64 
 
 
170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  40.99 
 
 
171 aa  129  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 
166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 
166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  44.24 
 
 
167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 
166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 
166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  46.92 
 
 
181 aa  128  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 
166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 
166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 
166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  53.57 
 
 
150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  42.33 
 
 
170 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  42.07 
 
 
170 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  46.1 
 
 
202 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  45.06 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  50.36 
 
 
169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  49.32 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  50.68 
 
 
358 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  48.65 
 
 
166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  49.32 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  46.1 
 
 
170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  49.32 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  42.58 
 
 
169 aa  124  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  45.96 
 
 
178 aa  124  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  43.84 
 
 
182 aa  124  6e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  48.95 
 
 
169 aa  124  7e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  42.58 
 
 
169 aa  124  8.000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  42.58 
 
 
169 aa  124  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  45.39 
 
 
235 aa  124  8.000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  49.62 
 
 
164 aa  123  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  45.7 
 
 
169 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  43.87 
 
 
359 aa  123  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  48.61 
 
 
173 aa  123  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  43.87 
 
 
359 aa  123  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  45.71 
 
 
163 aa  123  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  47.3 
 
 
166 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  46.62 
 
 
166 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  47.97 
 
 
364 aa  122  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  42.31 
 
 
167 aa  122  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  37.35 
 
 
165 aa  122  3e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  42.94 
 
 
169 aa  121  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  42.58 
 
 
170 aa  121  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  47.14 
 
 
162 aa  120  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  44.37 
 
 
169 aa  121  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  49.32 
 
 
176 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  46.5 
 
 
173 aa  120  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  49.32 
 
 
171 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  49.66 
 
 
171 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  46.5 
 
 
168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  48.28 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>