More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0588 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
168 aa  341  2.9999999999999997e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  75.88 
 
 
170 aa  278  3e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  63.25 
 
 
169 aa  228  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  62.5 
 
 
169 aa  229  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  62.5 
 
 
169 aa  229  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  63.46 
 
 
170 aa  221  4e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  62.18 
 
 
170 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  60.12 
 
 
164 aa  215  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  59.64 
 
 
166 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.322975 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0050  lipoprotein signal peptidase  59.64 
 
 
166 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  60.12 
 
 
164 aa  212  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  60.12 
 
 
164 aa  212  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  60.12 
 
 
164 aa  212  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  60.12 
 
 
164 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  60.12 
 
 
164 aa  212  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  60.12 
 
 
164 aa  212  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  60.12 
 
 
164 aa  211  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  60.12 
 
 
164 aa  211  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0051  lipoprotein signal peptidase  59.04 
 
 
166 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0052  lipoprotein signal peptidase  59.04 
 
 
166 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876995  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0051  lipoprotein signal peptidase  59.04 
 
 
166 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0475146 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0585  lipoprotein signal peptidase  58.43 
 
 
166 aa  209  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00142013  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  63.25 
 
 
169 aa  199  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  51.55 
 
 
170 aa  180  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  51.55 
 
 
170 aa  180  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  51.55 
 
 
170 aa  180  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  50.93 
 
 
170 aa  179  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  53.42 
 
 
171 aa  177  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  53.42 
 
 
171 aa  177  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  53.42 
 
 
171 aa  177  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  52.8 
 
 
171 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  50.94 
 
 
171 aa  176  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  48.21 
 
 
176 aa  175  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  48.81 
 
 
168 aa  174  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  47.93 
 
 
176 aa  174  6e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  47.31 
 
 
170 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  50.31 
 
 
170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  52.53 
 
 
171 aa  171  3.9999999999999995e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  51.19 
 
 
180 aa  171  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  48.81 
 
 
170 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  50.31 
 
 
169 aa  170  9e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  47.9 
 
 
182 aa  166  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  49.11 
 
 
171 aa  166  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  49.38 
 
 
173 aa  164  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  49.37 
 
 
168 aa  165  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  48.45 
 
 
182 aa  164  5e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  50.33 
 
 
154 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  49.06 
 
 
165 aa  164  5.9999999999999996e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  48.08 
 
 
173 aa  155  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0557  signal peptidase II  53.55 
 
 
167 aa  155  2e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  50.32 
 
 
178 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  46.1 
 
 
164 aa  149  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  47.68 
 
 
158 aa  147  6e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  44.59 
 
 
172 aa  147  7e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  46.5 
 
 
170 aa  147  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  47.47 
 
 
178 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  47.13 
 
 
174 aa  144  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  43.95 
 
 
168 aa  143  9e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  46.5 
 
 
174 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  45.81 
 
 
176 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  48.05 
 
 
171 aa  141  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  47.3 
 
 
165 aa  138  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  46.98 
 
 
165 aa  137  6e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  45.28 
 
 
164 aa  137  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  46.48 
 
 
160 aa  137  7e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  44.87 
 
 
173 aa  136  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  46.15 
 
 
166 aa  136  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  43.59 
 
 
166 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  43.59 
 
 
166 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  43.59 
 
 
166 aa  136  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  43.59 
 
 
166 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  45.34 
 
 
163 aa  136  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  43.59 
 
 
166 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  43.59 
 
 
166 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  43.59 
 
 
166 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  43.59 
 
 
166 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  42.86 
 
 
166 aa  134  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  46.2 
 
 
202 aa  134  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  46.84 
 
 
164 aa  134  9e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  46.2 
 
 
167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  45.16 
 
 
169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  46.53 
 
 
169 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  40.49 
 
 
167 aa  130  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  43.71 
 
 
165 aa  131  6e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  45.93 
 
 
179 aa  130  6.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  43.12 
 
 
169 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  42.5 
 
 
169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  43.05 
 
 
163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  41.4 
 
 
157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  45 
 
 
181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  40.76 
 
 
163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  45.16 
 
 
189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  47.3 
 
 
166 aa  127  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  47.3 
 
 
166 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  45.45 
 
 
154 aa  127  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  41.67 
 
 
235 aa  127  7.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  44.65 
 
 
172 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  41.29 
 
 
159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 
166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  40.36 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>