More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0573 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 166 aa  331  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  83.93 
 
 		 172 aa  286  9e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  80.81 
 
 		 172 aa  283  7e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  78.31 
 
 		 166 aa  280  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  78.31 
 
 		 166 aa  280  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  78.31 
 
 		 166 aa  280  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  78.31 
 
 		 166 aa  280  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  78.31 
 
 		 166 aa  280  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  78.31 
 
 		 166 aa  280  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  78.31 
 
 		 166 aa  280  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  77.71 
 
 		 166 aa  279  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  75.9 
 
 		 166 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  74.1 
 
 		 166 aa  271  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  75.9 
 
 		 166 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  75.9 
 
 		 166 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  75.9 
 
 		 166 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  74.7 
 
 		 166 aa  268  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  74.1 
 
 		 166 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  71.25 
 
 		 174 aa  229  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  71.7 
 
 		 173 aa  228  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  70.62 
 
 		 174 aa  228  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  59.38 
 
 		 176 aa  204  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  59.76 
 
 		 178 aa  203  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  60.74 
 
 		 164 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  55.09 
 
 		 170 aa  189  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  59.51 
 
 		 164 aa  188  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  55.42 
 
 		 169 aa  183  7e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  58.94 
 
 		 169 aa  182  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  56.49 
 
 		 165 aa  177  4e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  53.29 
 
 		 167 aa  177  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  56.29 
 
 		 165 aa  175  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  58.62 
 
 		 160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  59.29 
 
 		 179 aa  171  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  57.93 
 
 		 157 aa  171  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  50.98 
 
 		 163 aa  171  5e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  55.26 
 
 		 171 aa  168  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  50.68 
 
 		 162 aa  160  6e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 159 aa  159  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1234  lipoprotein signal peptidase  50.94 
 
 		 170 aa  157  8e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  53.19 
 
 		 163 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  53.1 
 
 		 154 aa  149  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2207  lipoprotein signal peptidase  51.68 
 
 		 151 aa  149  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  49.01 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  52.05 
 
 		 182 aa  148  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  52.08 
 
 		 178 aa  147  9e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  48.3 
 
 		 180 aa  145  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  48.39 
 
 		 168 aa  145  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  47.47 
 
 		 170 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  47.92 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  46.41 
 
 		 171 aa  137  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  47.59 
 
 		 173 aa  137  7e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  51.8 
 
 		 359 aa  137  7e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  51.8 
 
 		 359 aa  137  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  49.65 
 
 		 172 aa  137  7.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  46.1 
 
 		 171 aa  137  8.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  46.15 
 
 		 168 aa  136  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  45.52 
 
 		 173 aa  135  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  46.1 
 
 		 169 aa  136  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  46.1 
 
 		 169 aa  136  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  45.45 
 
 		 169 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  46.98 
 
 		 168 aa  135  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 164 aa  135  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  46.71 
 
 		 170 aa  135  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  46.71 
 
 		 170 aa  135  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  46.71 
 
 		 170 aa  135  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  46.05 
 
 		 170 aa  134  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  48.43 
 
 		 358 aa  134  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  46.31 
 
 		 171 aa  134  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  47.68 
 
 		 167 aa  134  7.000000000000001e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  48.57 
 
 		 176 aa  134  7.000000000000001e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  46.1 
 
 		 169 aa  134  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  49.65 
 
 		 171 aa  133  9e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  46.1 
 
 		 166 aa  133  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.322975 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0050  lipoprotein signal peptidase  46.1 
 
 		 166 aa  133  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0051  lipoprotein signal peptidase  46.1 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0475146 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0051  lipoprotein signal peptidase  46.1 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0052  lipoprotein signal peptidase  46.1 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876995  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  49.32 
 
 		 364 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  49.32 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  46.98 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  46.98 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0480  lipoprotein signal peptidase  49.3 
 
 		 159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  48.25 
 
 		 171 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  48.25 
 
 		 171 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6224  lipoprotein signal peptidase  52.6 
 
 		 174 aa  130  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  48.25 
 
 		 171 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  49.32 
 
 		 170 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  47.1 
 
 		 357 aa  130  9e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  45.27 
 
 		 165 aa  130  9e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  48.25 
 
 		 171 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0853  signal peptidase II  46.72 
 
 		 155 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  45.89 
 
 		 170 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  46.15 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  44.08 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  44.74 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  44.08 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  46.31 
 
 		 358 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  43.42 
 
 		 182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  46.15 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  49.32 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>