More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2886 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 178 aa  360  5.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  80.68 
 
 		 176 aa  294  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  63.22 
 
 		 173 aa  237  5e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  64 
 
 		 174 aa  237  8e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  62.86 
 
 		 174 aa  234  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  60.36 
 
 		 172 aa  214  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  59.09 
 
 		 172 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  59.76 
 
 		 166 aa  203  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  60.37 
 
 		 166 aa  202  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  61.78 
 
 		 165 aa  202  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  60.98 
 
 		 166 aa  200  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  63.58 
 
 		 165 aa  200  7e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  60.37 
 
 		 166 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  60.37 
 
 		 166 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  60.37 
 
 		 166 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  58.54 
 
 		 166 aa  197  9e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  58.54 
 
 		 166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  61.59 
 
 		 169 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  53.89 
 
 		 170 aa  195  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  58.18 
 
 		 164 aa  194  6e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  57.32 
 
 		 166 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  57.32 
 
 		 166 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  57.32 
 
 		 166 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  57.32 
 
 		 166 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  57.32 
 
 		 166 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  57.32 
 
 		 166 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  57.32 
 
 		 166 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  57.32 
 
 		 166 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  61.15 
 
 		 164 aa  192  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  55.49 
 
 		 169 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  63.57 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  56.05 
 
 		 171 aa  184  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1234  lipoprotein signal peptidase  54.97 
 
 		 170 aa  183  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  59.46 
 
 		 160 aa  179  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  55.41 
 
 		 167 aa  176  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  50.68 
 
 		 163 aa  166  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  52.41 
 
 		 157 aa  159  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  48.32 
 
 		 159 aa  156  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  52.98 
 
 		 359 aa  157  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  52.98 
 
 		 359 aa  157  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  48.97 
 
 		 162 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  50.32 
 
 		 168 aa  152  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  52.38 
 
 		 154 aa  150  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  47.44 
 
 		 170 aa  150  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  51.32 
 
 		 163 aa  149  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  49.36 
 
 		 173 aa  147  7e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 178 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  58.11 
 
 		 167 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  46.58 
 
 		 172 aa  144  9e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2207  lipoprotein signal peptidase  51.37 
 
 		 151 aa  143  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  49.32 
 
 		 180 aa  142  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  49.32 
 
 		 182 aa  142  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  48.99 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6224  lipoprotein signal peptidase  50.61 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  48.99 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  47.92 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  48.28 
 
 		 169 aa  138  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  53.62 
 
 		 169 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  46.21 
 
 		 171 aa  138  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  52.03 
 
 		 358 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  46.94 
 
 		 176 aa  137  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  49.32 
 
 		 164 aa  136  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  48.28 
 
 		 169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  48.28 
 
 		 169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  44.31 
 
 		 170 aa  135  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0196  lipoprotein signal peptidase  48.61 
 
 		 170 aa  135  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0222  lipoprotein signal peptidase  48.61 
 
 		 170 aa  135  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3473  lipoprotein signal peptidase  48.95 
 
 		 170 aa  134  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911066  normal  0.126226 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  44.38 
 
 		 173 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  51.37 
 
 		 358 aa  133  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  44.81 
 
 		 169 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  50.33 
 
 		 357 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  44.81 
 
 		 169 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  45.39 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  45.39 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  45.39 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  45.39 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  45.39 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  45.39 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  45.39 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  45.39 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  45.39 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  45.89 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  45.16 
 
 		 171 aa  132  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  46.9 
 
 		 171 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  46.9 
 
 		 171 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  46.9 
 
 		 171 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  45.45 
 
 		 182 aa  132  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  46.9 
 
 		 171 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  45.27 
 
 		 168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  47.45 
 
 		 181 aa  131  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  45.14 
 
 		 170 aa  131  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  47.33 
 
 		 171 aa  131  6e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  46.15 
 
 		 171 aa  131  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  45.14 
 
 		 170 aa  131  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  45.14 
 
 		 170 aa  131  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  44.74 
 
 		 158 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  45.21 
 
 		 170 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  45.83 
 
 		 170 aa  130  9e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  46.36 
 
 		 168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>