More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6224 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6224  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 174 aa  339  1e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  50.61 
 
 		 178 aa  155  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  55.26 
 
 		 173 aa  152  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  53.95 
 
 		 174 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  53.95 
 
 		 174 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  52.5 
 
 		 172 aa  151  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  51.88 
 
 		 172 aa  150  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 176 aa  147  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  52.6 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  48.21 
 
 		 170 aa  146  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  50.66 
 
 		 164 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  50.96 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  50.65 
 
 		 166 aa  141  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  50.65 
 
 		 166 aa  140  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  50.65 
 
 		 166 aa  140  7e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  50.65 
 
 		 166 aa  140  7e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  50.65 
 
 		 166 aa  140  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  50.65 
 
 		 166 aa  140  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  50.65 
 
 		 166 aa  140  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  50.65 
 
 		 166 aa  140  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  51.3 
 
 		 166 aa  140  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  51.32 
 
 		 165 aa  140  9e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  51.3 
 
 		 166 aa  140  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  51.3 
 
 		 166 aa  140  9e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  51.37 
 
 		 157 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  50.65 
 
 		 166 aa  139  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  51.3 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  51.95 
 
 		 166 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  51.95 
 
 		 166 aa  137  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  45.78 
 
 		 169 aa  135  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1234  lipoprotein signal peptidase  44.44 
 
 		 170 aa  133  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  49.32 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  45.51 
 
 		 171 aa  130  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  47.37 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  46.05 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  47.44 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  46.1 
 
 		 178 aa  128  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  48.37 
 
 		 159 aa  127  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 160 aa  127  8.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  48.25 
 
 		 179 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  45.39 
 
 		 235 aa  125  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  47.37 
 
 		 163 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0853  signal peptidase II  48.55 
 
 		 155 aa  124  9e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  47.62 
 
 		 162 aa  121  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  47.06 
 
 		 169 aa  120  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  46.41 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  44.68 
 
 		 202 aa  118  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  43.33 
 
 		 168 aa  115  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  42.76 
 
 		 173 aa  114  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2207  lipoprotein signal peptidase  48.34 
 
 		 151 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  42.28 
 
 		 180 aa  114  7.999999999999999e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  49.32 
 
 		 167 aa  114  7.999999999999999e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 		 169 aa  110  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  44.37 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  46.32 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  46.81 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  40.85 
 
 		 182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  46.43 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  43.66 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  42.28 
 
 		 358 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  50.4 
 
 		 171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  45.51 
 
 		 173 aa  107  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  40.4 
 
 		 154 aa  107  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  42.28 
 
 		 359 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  42.28 
 
 		 359 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  40.4 
 
 		 154 aa  107  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  42.38 
 
 		 164 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  39.22 
 
 		 165 aa  107  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  42.38 
 
 		 164 aa  107  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  39.88 
 
 		 357 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  41.72 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  41.96 
 
 		 176 aa  105  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  39.22 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0363  lipoprotein signal peptidase  48.94 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  41.72 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  41.72 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  41.72 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  41.72 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  44.53 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  41.72 
 
 		 164 aa  104  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  44.53 
 
 		 176 aa  104  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  41.72 
 
 		 164 aa  104  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  43.48 
 
 		 168 aa  104  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0401  lipoprotein signal peptidase  47.52 
 
 		 216 aa  104  6e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  44.06 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  44.3 
 
 		 358 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  40.27 
 
 		 164 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  44.14 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0555  lipoprotein signal peptidase  46.67 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.803857  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0710  lipoprotein signal peptidase  46.67 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108511 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  42.66 
 
 		 170 aa  102  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  48 
 
 		 176 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  48 
 
 		 171 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  40.97 
 
 		 168 aa  101  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  44.37 
 
 		 171 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3678  lipoprotein signal peptidase  43.59 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  39.19 
 
 		 182 aa  101  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  38.82 
 
 		 158 aa  100  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  40.94 
 
 		 364 aa  100  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>