More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1858 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  100 
 
 		 157 aa  311  2.9999999999999996e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  60 
 
 		 172 aa  173  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  60 
 
 		 172 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  59.31 
 
 		 166 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  59.31 
 
 		 166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  59.31 
 
 		 166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  59.31 
 
 		 166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  59.31 
 
 		 166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  59.31 
 
 		 166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  57.93 
 
 		 166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  59.31 
 
 		 166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  59.31 
 
 		 166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  60 
 
 		 174 aa  170  9e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  60.69 
 
 		 174 aa  169  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  59.31 
 
 		 173 aa  169  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  53.46 
 
 		 160 aa  166  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  57.24 
 
 		 166 aa  165  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  56.55 
 
 		 176 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  57.24 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  56.55 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  55.86 
 
 		 166 aa  160  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  55.86 
 
 		 166 aa  160  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  55.86 
 
 		 166 aa  160  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  55.86 
 
 		 166 aa  160  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2207  lipoprotein signal peptidase  60 
 
 		 151 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  52.41 
 
 		 178 aa  159  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  53.59 
 
 		 154 aa  155  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  56.85 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  53.74 
 
 		 169 aa  153  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  42.94 
 
 		 180 aa  149  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  47.1 
 
 		 163 aa  149  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  51.3 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  54.05 
 
 		 163 aa  147  5e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  51.03 
 
 		 170 aa  147  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  49.38 
 
 		 178 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  51.39 
 
 		 171 aa  144  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  47.44 
 
 		 182 aa  145  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  49.66 
 
 		 167 aa  144  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  54.73 
 
 		 164 aa  144  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  53.25 
 
 		 173 aa  143  8.000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  47.13 
 
 		 176 aa  143  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1234  lipoprotein signal peptidase  49.35 
 
 		 170 aa  142  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  52.08 
 
 		 169 aa  141  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  54.29 
 
 		 359 aa  141  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  46.5 
 
 		 170 aa  141  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  54.29 
 
 		 359 aa  141  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  51.39 
 
 		 159 aa  140  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  48.43 
 
 		 168 aa  140  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  51.11 
 
 		 179 aa  139  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  49.32 
 
 		 182 aa  139  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  43.59 
 
 		 173 aa  137  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 165 aa  137  7e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  47.44 
 
 		 170 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  43.87 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  44.23 
 
 		 170 aa  135  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  45.45 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  44.23 
 
 		 170 aa  135  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  44.23 
 
 		 170 aa  135  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  51.32 
 
 		 169 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  45.75 
 
 		 171 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  52.83 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  46.05 
 
 		 164 aa  134  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  45.75 
 
 		 171 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  45.75 
 
 		 171 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  45.75 
 
 		 171 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  51.05 
 
 		 157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 169 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  42.95 
 
 		 170 aa  133  8e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  45.75 
 
 		 171 aa  133  8e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 173 aa  133  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  48.25 
 
 		 176 aa  133  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  44.94 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  45.16 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  45.51 
 
 		 170 aa  131  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  42.21 
 
 		 170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  46.76 
 
 		 171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  42.31 
 
 		 176 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  50.35 
 
 		 170 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  50.35 
 
 		 181 aa  130  7.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  44.67 
 
 		 154 aa  130  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  48.68 
 
 		 168 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  45.83 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  44 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6224  lipoprotein signal peptidase  51.37 
 
 		 174 aa  128  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  45.83 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  45.83 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  45.83 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  45.83 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  45.83 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  45.83 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  45.83 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  45.83 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  41.4 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  46.81 
 
 		 173 aa  128  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  45.75 
 
 		 168 aa  128  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  42.95 
 
 		 169 aa  127  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  42.95 
 
 		 169 aa  127  6e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  47.97 
 
 		 162 aa  127  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  42.95 
 
 		 169 aa  127  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>