More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3678 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3678  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
160 aa  315  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0149  lipoprotein signal peptidase  52.23 
 
 
160 aa  159  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0144  lipoprotein signal peptidase  52.23 
 
 
160 aa  159  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0161  lipoprotein signal peptidase  50.96 
 
 
160 aa  158  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0026  lipoprotein signal peptidase  46.91 
 
 
165 aa  148  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138167 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0037  lipoprotein signal peptidase  46.98 
 
 
167 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.251395 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0052  lipoprotein signal peptidase  45.39 
 
 
167 aa  137  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0415  lipoprotein signal peptidase  51.22 
 
 
163 aa  130  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  40.91 
 
 
163 aa  106  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  40.91 
 
 
165 aa  106  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 
164 aa  103  9e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 
164 aa  103  9e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  39.31 
 
 
164 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  39.31 
 
 
164 aa  102  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  39.31 
 
 
164 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  39.31 
 
 
164 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  39.31 
 
 
164 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  39.31 
 
 
164 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  43.45 
 
 
167 aa  100  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  38.62 
 
 
164 aa  100  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 
170 aa  99.4  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  35.85 
 
 
173 aa  99.4  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 
170 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 
170 aa  98.6  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  39.49 
 
 
165 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  39.57 
 
 
154 aa  98.6  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 
170 aa  98.6  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 
170 aa  98.6  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 
170 aa  98.6  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 
170 aa  98.6  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 
170 aa  98.6  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 
170 aa  98.6  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0585  lipoprotein signal peptidase  39.04 
 
 
166 aa  98.6  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00142013  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  40.13 
 
 
172 aa  98.2  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  40.13 
 
 
172 aa  97.8  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  39.69 
 
 
171 aa  97.4  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  36.73 
 
 
168 aa  97.4  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 
166 aa  97.4  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0050  lipoprotein signal peptidase  39.13 
 
 
166 aa  97.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0052  lipoprotein signal peptidase  37.24 
 
 
166 aa  97.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876995  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  39.13 
 
 
166 aa  97.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.322975 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1375  lipoprotein signal peptidase  41.38 
 
 
165 aa  97.4  7e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0051  lipoprotein signal peptidase  37.24 
 
 
166 aa  97.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0475146 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0051  lipoprotein signal peptidase  37.24 
 
 
166 aa  97.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  37.33 
 
 
180 aa  97.1  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  36.99 
 
 
170 aa  97.4  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  35.22 
 
 
170 aa  97.1  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  39.29 
 
 
157 aa  96.3  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  40.28 
 
 
179 aa  96.7  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  37.97 
 
 
166 aa  95.9  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 
166 aa  95.5  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  39.24 
 
 
166 aa  96.3  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  38.61 
 
 
166 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 
166 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 
166 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 
166 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 
166 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  36.94 
 
 
164 aa  94.7  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 
166 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 
166 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 
166 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 
165 aa  94.7  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  34.16 
 
 
169 aa  94  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  36.88 
 
 
171 aa  93.2  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  35.1 
 
 
169 aa  93.2  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  43.38 
 
 
167 aa  93.6  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0853  signal peptidase II  42.96 
 
 
155 aa  93.2  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6224  lipoprotein signal peptidase  41.67 
 
 
174 aa  93.2  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  37.97 
 
 
166 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  37.06 
 
 
168 aa  92.8  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  37.97 
 
 
166 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  37.97 
 
 
166 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  38.03 
 
 
359 aa  92.4  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  39.6 
 
 
164 aa  92.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  37.97 
 
 
166 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  38.03 
 
 
359 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  35.42 
 
 
169 aa  91.7  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  36.88 
 
 
176 aa  91.7  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  37.78 
 
 
170 aa  91.3  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  40.14 
 
 
159 aa  91.3  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  37.91 
 
 
163 aa  91.3  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 
176 aa  91.3  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3473  lipoprotein signal peptidase  34.97 
 
 
170 aa  90.9  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911066  normal  0.126226 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  34.51 
 
 
176 aa  90.9  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 
182 aa  90.5  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  39.04 
 
 
163 aa  90.5  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 
166 aa  89.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  36.69 
 
 
169 aa  90.1  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  36.69 
 
 
169 aa  90.1  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  38.1 
 
 
235 aa  90.5  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  38.41 
 
 
166 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  38.89 
 
 
178 aa  90.1  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 
165 aa  89.7  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  39.06 
 
 
170 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  37.91 
 
 
154 aa  89.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  34.72 
 
 
171 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  34.72 
 
 
171 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  34.72 
 
 
171 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  37.12 
 
 
169 aa  88.6  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>