More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5353 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 357 aa  707    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  81.28 
 
 		 358 aa  569  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  66.57 
 
 		 359 aa  457  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  66.57 
 
 		 359 aa  457  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  56.61 
 
 		 364 aa  374  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  56.7 
 
 		 358 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5285  phosphoesterase PA-phosphatase related  82.07 
 
 		 201 aa  272  6e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.965621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1644  phosphoesterase PA-phosphatase related  82.07 
 
 		 201 aa  272  6e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.126989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  52.29 
 
 		 167 aa  147  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  48.32 
 
 		 171 aa  143  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  53.24 
 
 		 166 aa  142  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  53.24 
 
 		 166 aa  142  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3473  lipoprotein signal peptidase  56 
 
 		 170 aa  140  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911066  normal  0.126226 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  51.75 
 
 		 170 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  51.75 
 
 		 170 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  51.75 
 
 		 170 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  51.75 
 
 		 170 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  51.75 
 
 		 170 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  51.75 
 
 		 170 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  51.75 
 
 		 170 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  51.75 
 
 		 170 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  51.75 
 
 		 170 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  55.2 
 
 		 173 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0196  lipoprotein signal peptidase  55.2 
 
 		 170 aa  136  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0222  lipoprotein signal peptidase  55.2 
 
 		 170 aa  136  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  50.33 
 
 		 178 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  50.68 
 
 		 164 aa  134  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  48.03 
 
 		 176 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  48.34 
 
 		 172 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  44.52 
 
 		 169 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  48.32 
 
 		 172 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  47.1 
 
 		 166 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  45.14 
 
 		 171 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  43.05 
 
 		 165 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  45.89 
 
 		 170 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  47.26 
 
 		 174 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  44.23 
 
 		 170 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1234  lipoprotein signal peptidase  49.32 
 
 		 170 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  46.21 
 
 		 159 aa  127  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  45.03 
 
 		 166 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  46.58 
 
 		 174 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  45.83 
 
 		 171 aa  126  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  44.37 
 
 		 168 aa  126  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  47.26 
 
 		 173 aa  126  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  43.04 
 
 		 182 aa  126  7e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  42.41 
 
 		 166 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  41.42 
 
 		 176 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  42.17 
 
 		 170 aa  124  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  42.41 
 
 		 166 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  42.41 
 
 		 166 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  42.41 
 
 		 166 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  42.41 
 
 		 166 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  42.41 
 
 		 166 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  42.41 
 
 		 166 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  42.41 
 
 		 166 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  45.03 
 
 		 166 aa  123  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  45.39 
 
 		 171 aa  123  5e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  45.1 
 
 		 168 aa  123  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  50.71 
 
 		 166 aa  123  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  44.37 
 
 		 166 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  44.37 
 
 		 166 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  44.37 
 
 		 166 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  45.03 
 
 		 166 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  43.67 
 
 		 170 aa  122  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  44.74 
 
 		 171 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  45.03 
 
 		 166 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  42 
 
 		 180 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  48.25 
 
 		 181 aa  122  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  42.17 
 
 		 170 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  42.17 
 
 		 170 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  42.17 
 
 		 170 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  44.08 
 
 		 171 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  44.08 
 
 		 171 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  44.08 
 
 		 171 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  43.59 
 
 		 176 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  43.03 
 
 		 170 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  44.68 
 
 		 163 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  45.89 
 
 		 169 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  49.64 
 
 		 176 aa  119  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0480  lipoprotein signal peptidase  47.95 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  41.89 
 
 		 154 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  48.48 
 
 		 179 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  45 
 
 		 157 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  45.89 
 
 		 169 aa  116  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  42.77 
 
 		 171 aa  116  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  45.89 
 
 		 165 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  46.67 
 
 		 164 aa  115  8.999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  45.89 
 
 		 165 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  45.21 
 
 		 169 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  45 
 
 		 178 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  42.96 
 
 		 164 aa  114  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  42.96 
 
 		 164 aa  114  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  42.21 
 
 		 163 aa  114  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  42.96 
 
 		 164 aa  114  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  42.96 
 
 		 164 aa  114  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  42.96 
 
 		 164 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  41.33 
 
 		 158 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  42.96 
 
 		 164 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  40.79 
 
 		 164 aa  113  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  42.96 
 
 		 164 aa  113  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>