More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1292 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
176 aa  363  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  81.25 
 
 
176 aa  305  3e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  83.83 
 
 
170 aa  300  5.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  80.59 
 
 
170 aa  293  8e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  80.49 
 
 
168 aa  273  7e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  76.19 
 
 
170 aa  271  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  76.19 
 
 
170 aa  271  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  76.19 
 
 
170 aa  271  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  76.07 
 
 
171 aa  270  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  74.4 
 
 
170 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  75.93 
 
 
171 aa  264  4e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  75.31 
 
 
171 aa  263  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  75.31 
 
 
171 aa  263  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  75.31 
 
 
171 aa  263  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  76.25 
 
 
182 aa  261  3e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  72.78 
 
 
170 aa  260  8e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  51.46 
 
 
180 aa  186  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  53.37 
 
 
169 aa  184  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  53.37 
 
 
169 aa  184  5e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  54.12 
 
 
182 aa  183  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  52.15 
 
 
169 aa  179  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  53.99 
 
 
171 aa  179  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  52.1 
 
 
170 aa  179  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  54.36 
 
 
164 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  49.39 
 
 
170 aa  177  9e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  49.39 
 
 
170 aa  175  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  51.22 
 
 
164 aa  174  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  51.22 
 
 
164 aa  174  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  47.93 
 
 
168 aa  174  7e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  50.61 
 
 
164 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  50.61 
 
 
164 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  50.61 
 
 
164 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  50.61 
 
 
164 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  50.61 
 
 
164 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  52.41 
 
 
171 aa  173  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  50.61 
 
 
164 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  50.61 
 
 
164 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  52.17 
 
 
168 aa  171  5.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0585  lipoprotein signal peptidase  50.3 
 
 
166 aa  171  5.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00142013  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0050  lipoprotein signal peptidase  49.7 
 
 
166 aa  170  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  49.7 
 
 
166 aa  170  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.322975 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0051  lipoprotein signal peptidase  49.7 
 
 
166 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0052  lipoprotein signal peptidase  49.7 
 
 
166 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876995  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0051  lipoprotein signal peptidase  49.7 
 
 
166 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0475146 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  50.62 
 
 
169 aa  168  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  54 
 
 
158 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  46.39 
 
 
165 aa  161  6e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  45.83 
 
 
173 aa  160  9e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  51.7 
 
 
169 aa  160  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  51.59 
 
 
171 aa  154  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  52.29 
 
 
173 aa  149  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  50.33 
 
 
154 aa  149  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  48.32 
 
 
154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  48.32 
 
 
154 aa  146  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 
172 aa  144  5e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  47.1 
 
 
235 aa  143  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  47.13 
 
 
157 aa  143  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  52.24 
 
 
181 aa  142  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 
166 aa  142  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  48.34 
 
 
165 aa  142  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  48.34 
 
 
165 aa  141  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  44.87 
 
 
169 aa  141  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  45.57 
 
 
163 aa  141  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  44.65 
 
 
202 aa  141  6e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  44.59 
 
 
167 aa  140  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  48 
 
 
164 aa  139  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  43.64 
 
 
169 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  43.31 
 
 
168 aa  138  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  43.64 
 
 
169 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  45.16 
 
 
159 aa  137  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  46.36 
 
 
169 aa  137  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  46.94 
 
 
178 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  52.08 
 
 
178 aa  136  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  47.65 
 
 
173 aa  134  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  46.71 
 
 
166 aa  134  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  46.71 
 
 
166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  43.42 
 
 
167 aa  134  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  46.71 
 
 
166 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  46.71 
 
 
166 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  46.71 
 
 
166 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  46.15 
 
 
174 aa  134  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  46.71 
 
 
166 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  46.71 
 
 
166 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  46.71 
 
 
166 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  46.71 
 
 
166 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  41.67 
 
 
166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  44.76 
 
 
179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  44.17 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  44.91 
 
 
169 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  46.98 
 
 
174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  46.98 
 
 
174 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  40.61 
 
 
170 aa  131  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1234  lipoprotein signal peptidase  44.08 
 
 
170 aa  131  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  46.31 
 
 
162 aa  130  6.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  46 
 
 
165 aa  130  9e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  46.05 
 
 
166 aa  130  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  44.1 
 
 
163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  46.05 
 
 
166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2207  lipoprotein signal peptidase  51.7 
 
 
151 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  46.05 
 
 
166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>