More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4320 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
359 aa  716    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  100 
 
 
359 aa  716    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  65.18 
 
 
358 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  66.57 
 
 
357 aa  441  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  57.38 
 
 
364 aa  404  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  57.83 
 
 
358 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1644  phosphoesterase PA-phosphatase related  68.31 
 
 
201 aa  233  5e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.126989  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5285  phosphoesterase PA-phosphatase related  68.31 
 
 
201 aa  233  5e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.965621  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  49.08 
 
 
170 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  49.08 
 
 
170 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  48.78 
 
 
170 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  48.78 
 
 
170 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  48.78 
 
 
170 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  48.78 
 
 
170 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  48.78 
 
 
170 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  48.78 
 
 
170 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  48.78 
 
 
170 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 
171 aa  162  9e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  52.26 
 
 
170 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3473  lipoprotein signal peptidase  48.78 
 
 
170 aa  161  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911066  normal  0.126226 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  52.05 
 
 
173 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  52.98 
 
 
178 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0222  lipoprotein signal peptidase  48.17 
 
 
170 aa  155  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0196  lipoprotein signal peptidase  48.17 
 
 
170 aa  155  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  52.2 
 
 
176 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  49.7 
 
 
166 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  49.7 
 
 
166 aa  151  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  53.69 
 
 
166 aa  147  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  53.1 
 
 
167 aa  147  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  52.56 
 
 
164 aa  143  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  51.53 
 
 
172 aa  142  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  52.6 
 
 
172 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  54.29 
 
 
157 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  52.82 
 
 
166 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  50.33 
 
 
173 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  46.05 
 
 
165 aa  138  1e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  52.82 
 
 
166 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  52.82 
 
 
166 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  52.48 
 
 
166 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  52.82 
 
 
166 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  52.82 
 
 
166 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  52.82 
 
 
166 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  52.82 
 
 
166 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  52.82 
 
 
166 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  51.8 
 
 
166 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  49.67 
 
 
174 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  49.01 
 
 
174 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  44.44 
 
 
159 aa  135  8e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  48.59 
 
 
163 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  53.52 
 
 
166 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  52.82 
 
 
166 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  52.82 
 
 
166 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  53.19 
 
 
166 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  52.82 
 
 
166 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0480  lipoprotein signal peptidase  52.86 
 
 
159 aa  133  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1234  lipoprotein signal peptidase  45.83 
 
 
170 aa  133  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  52.48 
 
 
166 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  48.68 
 
 
169 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  46.5 
 
 
182 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  48.57 
 
 
182 aa  130  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  43.53 
 
 
168 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  45.81 
 
 
168 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  43.4 
 
 
180 aa  129  9.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  46.5 
 
 
165 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  47.06 
 
 
169 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  42.31 
 
 
170 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  41.36 
 
 
176 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  47.92 
 
 
154 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  49.26 
 
 
163 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  43.04 
 
 
171 aa  126  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  48.57 
 
 
179 aa  126  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  42.77 
 
 
170 aa  126  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  43.67 
 
 
170 aa  126  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  51.77 
 
 
176 aa  125  9e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  47.14 
 
 
171 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  43.04 
 
 
170 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  47.02 
 
 
165 aa  125  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  42.77 
 
 
170 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  42.77 
 
 
170 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 
170 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  42.59 
 
 
171 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  44.23 
 
 
171 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  42.77 
 
 
170 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  43.67 
 
 
171 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  41.67 
 
 
170 aa  124  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  43.67 
 
 
171 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  43.67 
 
 
171 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  43.87 
 
 
169 aa  123  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  46.9 
 
 
162 aa  123  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  45.45 
 
 
181 aa  122  7e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  40.24 
 
 
169 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  48.34 
 
 
164 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  48.95 
 
 
160 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  48.89 
 
 
178 aa  120  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2207  lipoprotein signal peptidase  45.27 
 
 
151 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  41.72 
 
 
168 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  43.87 
 
 
171 aa  119  7.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  42.77 
 
 
176 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  43.14 
 
 
173 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  43.97 
 
 
158 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>