More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0710 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0710  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 152 aa  288  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108511 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0555  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 152 aa  288  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.803857  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  54.36 
 
 		 167 aa  151  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  51.97 
 
 		 169 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  51.32 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  52.03 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  53.62 
 
 		 170 aa  140  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  51.97 
 
 		 168 aa  140  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  49.33 
 
 		 173 aa  137  7e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  51.72 
 
 		 163 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  47.33 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  48.68 
 
 		 173 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  45.27 
 
 		 170 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  52.17 
 
 		 176 aa  133  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  52.17 
 
 		 171 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  52.55 
 
 		 171 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  51.82 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  48.61 
 
 		 171 aa  129  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  45.1 
 
 		 171 aa  128  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  45.33 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  43.05 
 
 		 180 aa  128  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  43.92 
 
 		 168 aa  127  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  42.58 
 
 		 168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  47.06 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  50.36 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  41.29 
 
 		 169 aa  124  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  48.23 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  47.33 
 
 		 169 aa  124  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  46.76 
 
 		 179 aa  123  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  45.33 
 
 		 182 aa  123  8.000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  46.41 
 
 		 154 aa  123  9e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  41.18 
 
 		 171 aa  122  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  41.13 
 
 		 162 aa  122  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  47.68 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  48.23 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  47.62 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  48.94 
 
 		 160 aa  121  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  43.05 
 
 		 169 aa  122  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  48.23 
 
 		 172 aa  121  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  43.05 
 
 		 159 aa  121  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  42.45 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2207  lipoprotein signal peptidase  45.7 
 
 		 151 aa  121  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  44.3 
 
 		 170 aa  121  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  47.59 
 
 		 169 aa  121  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  42.28 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  41.72 
 
 		 182 aa  120  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  47.3 
 
 		 173 aa  120  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  44.97 
 
 		 176 aa  120  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  43.24 
 
 		 173 aa  120  8e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  45.27 
 
 		 170 aa  119  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  41.72 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  43.92 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  45.27 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  45.95 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  45.7 
 
 		 189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  43.92 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  43.92 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  45.27 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  43.92 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  43.92 
 
 		 170 aa  118  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  43.24 
 
 		 171 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  38.3 
 
 		 162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  46.26 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  46.26 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  46.26 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  46.26 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  46.26 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  45.27 
 
 		 174 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  46.27 
 
 		 181 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  43.26 
 
 		 161 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  46.26 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  43.92 
 
 		 170 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  43.92 
 
 		 170 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  46.26 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  43.92 
 
 		 170 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  43.71 
 
 		 163 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  46.26 
 
 		 166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  43.24 
 
 		 170 aa  117  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  42.95 
 
 		 178 aa  116  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  41.61 
 
 		 176 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  40.54 
 
 		 176 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  42.57 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  47.18 
 
 		 202 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  44.44 
 
 		 172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  41.89 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  40.27 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  46.81 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0585  lipoprotein signal peptidase  42.57 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00142013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  43.97 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  44.59 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0050  lipoprotein signal peptidase  42.57 
 
 		 166 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  42.57 
 
 		 166 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.322975 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  45.52 
 
 		 166 aa  113  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0051  lipoprotein signal peptidase  42.57 
 
 		 166 aa  113  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0051  lipoprotein signal peptidase  42.57 
 
 		 166 aa  113  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0475146 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0052  lipoprotein signal peptidase  42.57 
 
 		 166 aa  113  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876995  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  48.91 
 
 		 159 aa  113  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  41.89 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  41.22 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  41.22 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>