More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0352 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 162 aa  328  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  77.36 
 
 		 160 aa  251  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  68.39 
 
 		 162 aa  234  5.0000000000000005e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  65.38 
 
 		 161 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  63.92 
 
 		 164 aa  209  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  65.62 
 
 		 163 aa  209  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3649  lipoprotein signal peptidase  59.75 
 
 		 164 aa  180  9.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  52.56 
 
 		 161 aa  176  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  53.9 
 
 		 164 aa  173  9e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0487  lipoprotein signal peptidase  44.24 
 
 		 178 aa  142  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  44.51 
 
 		 178 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  43.59 
 
 		 182 aa  134  7.000000000000001e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  47.45 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 		 160 aa  131  5e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  40.74 
 
 		 165 aa  128  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  47.97 
 
 		 157 aa  127  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  47.83 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  40.13 
 
 		 165 aa  124  7e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  45.77 
 
 		 171 aa  123  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  47.97 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  41.89 
 
 		 169 aa  122  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  44.81 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  41.89 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  44.76 
 
 		 176 aa  121  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  44.76 
 
 		 171 aa  121  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  43.26 
 
 		 170 aa  120  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  43.59 
 
 		 176 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  39.87 
 
 		 180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  44.37 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  40.91 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  42.03 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  42.66 
 
 		 167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  39.46 
 
 		 153 aa  118  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  41.77 
 
 		 170 aa  117  7e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  43.92 
 
 		 154 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  41.67 
 
 		 170 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  42.21 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  43.92 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  42.68 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  42.07 
 
 		 173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  40.51 
 
 		 176 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  45.83 
 
 		 176 aa  114  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  43.45 
 
 		 174 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  43.45 
 
 		 174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  39.22 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1117  lipoprotein signal peptidase  37.2 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.149841  normal  0.0706096 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  38.69 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  35.48 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  38.1 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  39.46 
 
 		 145 aa  112  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  41.29 
 
 		 357 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  43.44 
 
 		 171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  40.38 
 
 		 164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  40.82 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0710  lipoprotein signal peptidase  41.13 
 
 		 152 aa  111  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108511 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  44.37 
 
 		 169 aa  110  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0555  lipoprotein signal peptidase  41.13 
 
 		 152 aa  111  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.803857  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  40.65 
 
 		 170 aa  110  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  41.29 
 
 		 189 aa  110  7.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  36.65 
 
 		 202 aa  110  8.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  42.75 
 
 		 152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  37.58 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  40.14 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  37.91 
 
 		 149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1860  signal peptidase II  40.99 
 
 		 174 aa  108  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  38.89 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  38.56 
 
 		 162 aa  107  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  37.89 
 
 		 358 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  42.18 
 
 		 172 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  42.47 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  42.18 
 
 		 172 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  41.78 
 
 		 171 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  39.1 
 
 		 359 aa  106  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  39.1 
 
 		 359 aa  106  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  41.5 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  41.5 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  41.5 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  40.65 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  41.5 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  41.5 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  41.5 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  41.5 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  41.5 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 178 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  41.32 
 
 		 168 aa  104  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  41.5 
 
 		 166 aa  104  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 		 171 aa  104  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  37.91 
 
 		 163 aa  104  6e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2207  lipoprotein signal peptidase  43.15 
 
 		 151 aa  103  7e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  35.9 
 
 		 235 aa  103  7e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  38.15 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  36.18 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  37.89 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  41.22 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  37.32 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  37.66 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  37.66 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  37.66 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>