More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2956 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 170 aa  340  5e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 170 aa  340  5e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 170 aa  340  5e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  96.47 
 
 		 170 aa  332  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  92.94 
 
 		 171 aa  321  3e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  88.24 
 
 		 171 aa  304  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  87.65 
 
 		 171 aa  303  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  87.65 
 
 		 171 aa  303  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  87.65 
 
 		 171 aa  303  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  81.44 
 
 		 170 aa  283  7e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  81.55 
 
 		 168 aa  279  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  81.21 
 
 		 170 aa  274  4e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  77.65 
 
 		 170 aa  273  8e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  76.19 
 
 		 176 aa  271  4.0000000000000004e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  75 
 
 		 176 aa  265  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  73.53 
 
 		 182 aa  262  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  55.21 
 
 		 170 aa  185  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  51.55 
 
 		 168 aa  180  9.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  53.09 
 
 		 169 aa  179  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  53.94 
 
 		 182 aa  177  4.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  50.62 
 
 		 180 aa  177  8e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  52.47 
 
 		 169 aa  177  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  52.47 
 
 		 169 aa  177  8e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  53.94 
 
 		 171 aa  175  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  53.61 
 
 		 171 aa  174  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  51.55 
 
 		 170 aa  174  7e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  51.55 
 
 		 170 aa  172  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  49.08 
 
 		 173 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  51.22 
 
 		 164 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  51.22 
 
 		 164 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  51.22 
 
 		 164 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  51.22 
 
 		 164 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  51.22 
 
 		 164 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  51.22 
 
 		 164 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  49.69 
 
 		 164 aa  170  7.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  50.61 
 
 		 164 aa  170  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  50.61 
 
 		 164 aa  170  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  51.22 
 
 		 164 aa  169  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  50.91 
 
 		 166 aa  168  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.322975 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0050  lipoprotein signal peptidase  50.91 
 
 		 166 aa  168  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0051  lipoprotein signal peptidase  50.91 
 
 		 166 aa  167  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0051  lipoprotein signal peptidase  50.91 
 
 		 166 aa  167  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0475146 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0052  lipoprotein signal peptidase  50.91 
 
 		 166 aa  167  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876995  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  52.15 
 
 		 168 aa  167  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0585  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 166 aa  166  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00142013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  51.2 
 
 		 169 aa  165  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  47.59 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  51.66 
 
 		 158 aa  159  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  53.79 
 
 		 169 aa  158  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  48.72 
 
 		 171 aa  143  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  45.51 
 
 		 172 aa  142  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  47.37 
 
 		 166 aa  142  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  47.37 
 
 		 166 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  49.69 
 
 		 166 aa  141  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  47.37 
 
 		 166 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  47.37 
 
 		 166 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  47.37 
 
 		 166 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  47.37 
 
 		 166 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  47.37 
 
 		 166 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  47.37 
 
 		 166 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  46.06 
 
 		 169 aa  141  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  45.1 
 
 		 166 aa  141  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  46.06 
 
 		 169 aa  140  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  48.03 
 
 		 166 aa  137  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  46.05 
 
 		 166 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  50.77 
 
 		 181 aa  136  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  47.55 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  46.5 
 
 		 178 aa  136  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  46.71 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  46.71 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  46.71 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  45.34 
 
 		 173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  44.23 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  45.62 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  46.71 
 
 		 166 aa  135  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  44.38 
 
 		 167 aa  134  8e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  47.33 
 
 		 164 aa  134  9e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  46.41 
 
 		 166 aa  134  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  45.75 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  45.91 
 
 		 174 aa  133  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  44.23 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  44.52 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  49.66 
 
 		 174 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  41.25 
 
 		 169 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  49.66 
 
 		 174 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  46.84 
 
 		 162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  43.36 
 
 		 179 aa  131  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  45.14 
 
 		 178 aa  131  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  46.75 
 
 		 160 aa  131  6e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  44.52 
 
 		 154 aa  130  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  48.97 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  43.64 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  44.74 
 
 		 164 aa  129  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  43.05 
 
 		 169 aa  127  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  43.87 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  39.77 
 
 		 364 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  41.72 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 		 170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  41.72 
 
 		 165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>