More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2146 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  100 
 
 		 159 aa  317  3e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  40.99 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  37.75 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  44.85 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  40.82 
 
 		 162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  38.82 
 
 		 157 aa  110  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4181  lipoprotein signal peptidase  41.36 
 
 		 165 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  43.15 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  41.04 
 
 		 171 aa  107  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0487  lipoprotein signal peptidase  40.41 
 
 		 178 aa  107  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  42.28 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 164 aa  104  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  42.45 
 
 		 164 aa  104  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4037  lipoprotein signal peptidase  41.06 
 
 		 165 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  39.13 
 
 		 171 aa  104  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  39.61 
 
 		 161 aa  103  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  38.13 
 
 		 163 aa  103  7e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0555  lipoprotein signal peptidase  43.05 
 
 		 152 aa  103  9e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.803857  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0710  lipoprotein signal peptidase  43.05 
 
 		 152 aa  103  9e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108511 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  39.72 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  40.58 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  37.06 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  41.29 
 
 		 169 aa  102  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  40.91 
 
 		 167 aa  101  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  38.13 
 
 		 172 aa  100  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  38.13 
 
 		 172 aa  100  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 154 aa  100  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  37.76 
 
 		 180 aa  100  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2281  lipoprotein signal peptidase  42.18 
 
 		 171 aa  100  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  35.92 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 		 161 aa  99  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 169 aa  99.4  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  35.9 
 
 		 160 aa  99  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  39.46 
 
 		 164 aa  98.6  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  40.41 
 
 		 178 aa  98.6  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  34.69 
 
 		 163 aa  98.6  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 		 182 aa  97.8  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  39.63 
 
 		 169 aa  97.8  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1007  lipoprotein signal peptidase  38.12 
 
 		 167 aa  97.4  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  37.42 
 
 		 170 aa  97.1  8e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  43.26 
 
 		 143 aa  97.1  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  39.13 
 
 		 160 aa  96.7  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 		 235 aa  96.3  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 		 169 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  36.69 
 
 		 166 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 		 168 aa  95.5  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1117  lipoprotein signal peptidase  38.76 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.149841  normal  0.0706096 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4860  lipoprotein signal peptidase  35.8 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.777227  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  41.33 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 176 aa  95.9  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 170 aa  95.9  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  38.97 
 
 		 153 aa  96.3  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  35.97 
 
 		 166 aa  95.5  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 182 aa  95.1  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 166 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  35.1 
 
 		 176 aa  95.1  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  38.51 
 
 		 168 aa  94.7  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  38.1 
 
 		 191 aa  94.7  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  36.36 
 
 		 158 aa  94.4  6e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  37.74 
 
 		 170 aa  94.4  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1655  lipoprotein signal peptidase  42.57 
 
 		 164 aa  94  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1234  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 		 170 aa  94  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  40.41 
 
 		 170 aa  94  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 		 169 aa  93.6  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  39.44 
 
 		 160 aa  93.6  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 173 aa  93.6  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3649  lipoprotein signal peptidase  40.91 
 
 		 164 aa  93.6  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  33.81 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  37.33 
 
 		 173 aa  92.4  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  33.81 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  33.81 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  33.81 
 
 		 166 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  42.31 
 
 		 181 aa  92.8  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  33.81 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1860  signal peptidase II  35.46 
 
 		 174 aa  92.8  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  33.81 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  33.81 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  33.81 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  34.53 
 
 		 166 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  35.97 
 
 		 174 aa  92  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  35.97 
 
 		 174 aa  92  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2326  lipoprotein signal peptidase  40.88 
 
 		 171 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  0.6435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2603  lipoprotein signal peptidase  40.88 
 
 		 171 aa  92  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172447 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  34.53 
 
 		 166 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  34.53 
 
 		 166 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  36.71 
 
 		 170 aa  91.7  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 171 aa  91.3  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  34.23 
 
 		 165 aa  91.7  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  35.25 
 
 		 166 aa  91.3  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  35.25 
 
 		 166 aa  91.3  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  34.67 
 
 		 169 aa  90.9  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 		 170 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  34.9 
 
 		 164 aa  90.9  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  34.67 
 
 		 169 aa  90.9  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  41.96 
 
 		 169 aa  90.9  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  34.53 
 
 		 166 aa  90.9  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  43.93 
 
 		 358 aa  90.9  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 		 154 aa  90.5  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  44.86 
 
 		 357 aa  90.5  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>