More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1814 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 358 aa  713    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  81.28 
 
 		 357 aa  569  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  65.18 
 
 		 359 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  65.18 
 
 		 359 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  55.9 
 
 		 364 aa  384  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  54.19 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1644  phosphoesterase PA-phosphatase related  85.16 
 
 		 201 aa  292  7e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.126989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5285  phosphoesterase PA-phosphatase related  85.16 
 
 		 201 aa  292  7e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.965621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  51.61 
 
 		 167 aa  147  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3473  lipoprotein signal peptidase  49.02 
 
 		 170 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911066  normal  0.126226 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  46.41 
 
 		 170 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  46.41 
 
 		 170 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  48.73 
 
 		 166 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  48.73 
 
 		 166 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  46.41 
 
 		 170 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  46.41 
 
 		 170 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  46.41 
 
 		 170 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  46.41 
 
 		 170 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  46.41 
 
 		 170 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  46.41 
 
 		 170 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  46.41 
 
 		 170 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  43.67 
 
 		 171 aa  143  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0222  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 170 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0196  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 170 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  47.92 
 
 		 173 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  50.65 
 
 		 176 aa  136  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  52.03 
 
 		 178 aa  136  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  47.95 
 
 		 170 aa  136  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  49.33 
 
 		 172 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  44.74 
 
 		 165 aa  135  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  49.66 
 
 		 172 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 170 aa  134  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  50 
 
 		 166 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  47.22 
 
 		 171 aa  130  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  48.59 
 
 		 168 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  49.34 
 
 		 164 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  44.1 
 
 		 170 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  46.31 
 
 		 166 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  46.58 
 
 		 174 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  45.33 
 
 		 166 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  44.59 
 
 		 171 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  47.26 
 
 		 174 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  48.97 
 
 		 176 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  46.1 
 
 		 182 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  41.4 
 
 		 169 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  44.74 
 
 		 158 aa  126  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  42.5 
 
 		 176 aa  126  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  43.95 
 
 		 180 aa  126  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  46.58 
 
 		 173 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  42.77 
 
 		 170 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  43.79 
 
 		 154 aa  125  8.000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  43.67 
 
 		 166 aa  125  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  44.23 
 
 		 171 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  46.75 
 
 		 159 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  42.51 
 
 		 168 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  44.52 
 
 		 171 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  44.52 
 
 		 171 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  44.52 
 
 		 171 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  43.04 
 
 		 173 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  42.58 
 
 		 176 aa  124  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  43.67 
 
 		 166 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  43.67 
 
 		 166 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  41.25 
 
 		 163 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  43.67 
 
 		 166 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  43.67 
 
 		 166 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  48 
 
 		 165 aa  124  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  43.67 
 
 		 166 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  43.67 
 
 		 166 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  43.67 
 
 		 166 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  48.63 
 
 		 165 aa  124  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  47.52 
 
 		 171 aa  123  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  42.14 
 
 		 170 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  42.14 
 
 		 170 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  44.83 
 
 		 170 aa  123  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  42.14 
 
 		 170 aa  124  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  46 
 
 		 166 aa  123  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  46 
 
 		 166 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  44.16 
 
 		 157 aa  122  8e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0480  lipoprotein signal peptidase  45.81 
 
 		 159 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  45.64 
 
 		 166 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  47.22 
 
 		 181 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  44.97 
 
 		 166 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  44.97 
 
 		 166 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  44.97 
 
 		 166 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  44.23 
 
 		 168 aa  119  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  44.74 
 
 		 169 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  46.36 
 
 		 169 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1234  lipoprotein signal peptidase  44.72 
 
 		 170 aa  119  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2207  lipoprotein signal peptidase  43.62 
 
 		 151 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  45.64 
 
 		 167 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  46.36 
 
 		 160 aa  117  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  45.89 
 
 		 169 aa  116  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  41.5 
 
 		 164 aa  116  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  41.5 
 
 		 164 aa  116  6e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  41.5 
 
 		 164 aa  116  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  41.5 
 
 		 164 aa  116  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  41.5 
 
 		 164 aa  116  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  41.5 
 
 		 164 aa  116  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  41.5 
 
 		 164 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  45.99 
 
 		 179 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>