More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1409 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
170 aa  342  2e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  76.33 
 
 
170 aa  269  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  76.33 
 
 
170 aa  269  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  76.33 
 
 
170 aa  268  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  76.33 
 
 
170 aa  268  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  76.33 
 
 
170 aa  268  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  76.33 
 
 
170 aa  268  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  76.33 
 
 
170 aa  268  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  76.33 
 
 
170 aa  268  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  76.33 
 
 
170 aa  268  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3473  lipoprotein signal peptidase  76.92 
 
 
170 aa  262  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911066  normal  0.126226 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0196  lipoprotein signal peptidase  76.33 
 
 
170 aa  257  5.0000000000000005e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0222  lipoprotein signal peptidase  76.33 
 
 
170 aa  257  5.0000000000000005e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  74.55 
 
 
173 aa  256  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  62.89 
 
 
171 aa  218  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  52.26 
 
 
359 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  52.26 
 
 
359 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  47.95 
 
 
358 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  49.01 
 
 
364 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  52.24 
 
 
167 aa  134  8e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  47.89 
 
 
176 aa  131  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  44.3 
 
 
154 aa  130  9e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  43.92 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  46.43 
 
 
358 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  45.89 
 
 
357 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  42.38 
 
 
182 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  46.38 
 
 
166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  46.15 
 
 
178 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  46.38 
 
 
166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  44.29 
 
 
162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  46.76 
 
 
176 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  45.21 
 
 
168 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  45.14 
 
 
158 aa  124  6e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  42.11 
 
 
170 aa  124  7e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  45 
 
 
166 aa  122  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  44.97 
 
 
164 aa  122  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  43.05 
 
 
157 aa  121  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  43.05 
 
 
171 aa  121  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  42.58 
 
 
178 aa  121  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  42.96 
 
 
164 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  42.96 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  43.51 
 
 
168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  42.96 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  46.56 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  42.96 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  47.33 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  42.96 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  42.96 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  42.96 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  42.14 
 
 
163 aa  119  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  47.73 
 
 
172 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  47.73 
 
 
172 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.699045 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  42.22 
 
 
164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  42.22 
 
 
164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  43.84 
 
 
180 aa  118  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  41.83 
 
 
171 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  41.83 
 
 
171 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  41.83 
 
 
171 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  45.8 
 
 
173 aa  117  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  43.54 
 
 
171 aa  117  7e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  42.66 
 
 
166 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  42.66 
 
 
166 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  42.66 
 
 
166 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  42.66 
 
 
166 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  42.66 
 
 
166 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  42.66 
 
 
166 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  42.66 
 
 
166 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  42.66 
 
 
166 aa  117  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  45.52 
 
 
170 aa  117  9e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  42 
 
 
171 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  40.48 
 
 
169 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  43.75 
 
 
169 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  43.06 
 
 
169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  45.83 
 
 
176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  43.06 
 
 
169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0585  lipoprotein signal peptidase  40.58 
 
 
166 aa  115  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00142013  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  42.67 
 
 
170 aa  115  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  42.21 
 
 
159 aa  115  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  45.45 
 
 
160 aa  115  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  41.22 
 
 
168 aa  115  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 
163 aa  115  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  42.67 
 
 
170 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  42.67 
 
 
170 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  38.06 
 
 
170 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  44.3 
 
 
169 aa  114  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  38.89 
 
 
169 aa  114  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  44.94 
 
 
169 aa  114  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  46.1 
 
 
182 aa  114  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  44.36 
 
 
166 aa  114  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0050  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 
166 aa  114  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 
166 aa  114  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.322975 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0051  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 
166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0475146 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0052  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 
166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876995  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0051  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 
166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  45.39 
 
 
168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  41.33 
 
 
170 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  45.75 
 
 
173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  40.4 
 
 
171 aa  112  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  42.45 
 
 
170 aa  112  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  42.95 
 
 
170 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>