More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2910 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 170 aa  340  5e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 170 aa  340  5e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 170 aa  340  5e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 170 aa  340  5e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 170 aa  340  5e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 170 aa  340  5e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 170 aa  340  5e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  99.41 
 
 		 170 aa  338  2.9999999999999998e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  99.41 
 
 		 170 aa  338  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  93.53 
 
 		 173 aa  316  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3473  lipoprotein signal peptidase  96.47 
 
 		 170 aa  312  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911066  normal  0.126226 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0196  lipoprotein signal peptidase  94.71 
 
 		 170 aa  306  9e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0222  lipoprotein signal peptidase  94.71 
 
 		 170 aa  306  9e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  76.33 
 
 		 170 aa  268  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  61.25 
 
 		 171 aa  207  8e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  48.78 
 
 		 359 aa  164  5e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  48.78 
 
 		 359 aa  164  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  46.41 
 
 		 358 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  52.52 
 
 		 364 aa  143  9e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  54.62 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  48.95 
 
 		 358 aa  137  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  51.75 
 
 		 357 aa  137  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  46.67 
 
 		 176 aa  135  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  49.33 
 
 		 166 aa  135  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  51.13 
 
 		 167 aa  134  5e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  46 
 
 		 154 aa  134  7.000000000000001e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  45.39 
 
 		 178 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  47.89 
 
 		 166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  47.89 
 
 		 166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  43.51 
 
 		 162 aa  130  6.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  49.63 
 
 		 174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  45.83 
 
 		 157 aa  129  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  48.89 
 
 		 174 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  48.15 
 
 		 173 aa  127  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  49.63 
 
 		 172 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  49.63 
 
 		 172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  44.74 
 
 		 170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  43.21 
 
 		 163 aa  124  5e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0480  lipoprotein signal peptidase  53.17 
 
 		 159 aa  124  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  44.23 
 
 		 171 aa  124  8.000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  46.48 
 
 		 164 aa  123  9e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  46.48 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  46.48 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  46.48 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  46.48 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  43.28 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  46.15 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  43.4 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  38.51 
 
 		 182 aa  122  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  43.84 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  45.77 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  46.43 
 
 		 181 aa  121  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  45.77 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  44.37 
 
 		 180 aa  121  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  41.14 
 
 		 178 aa  121  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  42.11 
 
 		 166 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  42.11 
 
 		 166 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  42.11 
 
 		 166 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  42.11 
 
 		 166 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  42.11 
 
 		 166 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  42.11 
 
 		 166 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  42.11 
 
 		 166 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  42.18 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  40.38 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0052  lipoprotein signal peptidase  46.04 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876995  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0051  lipoprotein signal peptidase  46.04 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0475146 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  42.11 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  44.16 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 		 169 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0051  lipoprotein signal peptidase  46.04 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  45.77 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  44.53 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  45.77 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  44.52 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  42.07 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  48.2 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  42.01 
 
 		 168 aa  119  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  47.48 
 
 		 165 aa  119  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  45.32 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.322975 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0050  lipoprotein signal peptidase  45.32 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  43.79 
 
 		 167 aa  119  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  45.93 
 
 		 164 aa  118  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  42.5 
 
 		 182 aa  117  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  40.67 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  44.37 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  43.24 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  47.4 
 
 		 173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  44.9 
 
 		 169 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  44.9 
 
 		 169 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  45.45 
 
 		 169 aa  114  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  42.57 
 
 		 170 aa  114  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  41.94 
 
 		 170 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  42.21 
 
 		 176 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  44.68 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  42.66 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0585  lipoprotein signal peptidase  44.6 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00142013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  37.8 
 
 		 169 aa  111  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  41.29 
 
 		 176 aa  111  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  43.15 
 
 		 169 aa  111  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>