More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2146 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
167 aa  340  5.999999999999999e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  74.66 
 
 
166 aa  231  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  74.66 
 
 
166 aa  231  4.0000000000000004e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  51.61 
 
 
358 aa  147  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  52.29 
 
 
357 aa  147  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  53.1 
 
 
359 aa  147  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  53.1 
 
 
359 aa  147  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  58.11 
 
 
178 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  50.99 
 
 
172 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  50.33 
 
 
172 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  53.42 
 
 
176 aa  143  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0480  lipoprotein signal peptidase  53.15 
 
 
159 aa  141  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  51.37 
 
 
173 aa  140  9e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  51.37 
 
 
174 aa  138  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  48.34 
 
 
166 aa  138  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3473  lipoprotein signal peptidase  55.56 
 
 
170 aa  138  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911066  normal  0.126226 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  52.23 
 
 
358 aa  138  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  50.68 
 
 
174 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  49.01 
 
 
166 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  53.19 
 
 
166 aa  137  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  49.28 
 
 
171 aa  137  7e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  48.34 
 
 
166 aa  137  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  48.34 
 
 
166 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  48.34 
 
 
166 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  48.34 
 
 
166 aa  137  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  48.34 
 
 
166 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  48.34 
 
 
166 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  48.34 
 
 
166 aa  137  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  49.67 
 
 
166 aa  135  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  51.37 
 
 
165 aa  135  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  51.37 
 
 
165 aa  135  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  50.68 
 
 
169 aa  135  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  47.68 
 
 
167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0196  lipoprotein signal peptidase  54.76 
 
 
170 aa  134  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  51.03 
 
 
364 aa  134  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0222  lipoprotein signal peptidase  54.76 
 
 
170 aa  134  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  51.13 
 
 
170 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  49.01 
 
 
166 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  51.13 
 
 
173 aa  134  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  49.01 
 
 
166 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  51.13 
 
 
170 aa  134  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  49.01 
 
 
166 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  51.13 
 
 
170 aa  134  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  51.13 
 
 
170 aa  134  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  51.13 
 
 
170 aa  134  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  51.13 
 
 
170 aa  134  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  51.13 
 
 
170 aa  134  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  51.13 
 
 
170 aa  134  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  51.13 
 
 
170 aa  134  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  55.63 
 
 
169 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  47.68 
 
 
166 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  52.24 
 
 
170 aa  134  8e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 
160 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  47.02 
 
 
166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  49.26 
 
 
179 aa  131  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  47.02 
 
 
166 aa  131  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  51.11 
 
 
164 aa  130  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  42.94 
 
 
169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  46.41 
 
 
168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  42.51 
 
 
168 aa  128  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 
163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  46.58 
 
 
164 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  50.34 
 
 
169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  45.89 
 
 
170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  45.1 
 
 
170 aa  125  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  48.63 
 
 
164 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  44.87 
 
 
173 aa  124  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  44.44 
 
 
180 aa  124  8.000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  39.77 
 
 
171 aa  124  9e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  45.89 
 
 
158 aa  122  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  42.58 
 
 
168 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  45.1 
 
 
170 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  45.1 
 
 
170 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  45.1 
 
 
170 aa  122  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  46.5 
 
 
170 aa  122  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  46.53 
 
 
182 aa  121  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  43.51 
 
 
170 aa  121  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  46.62 
 
 
171 aa  121  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  47.62 
 
 
170 aa  121  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  47.26 
 
 
171 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  45.1 
 
 
171 aa  120  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  42.48 
 
 
169 aa  121  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  40.54 
 
 
163 aa  119  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  47.26 
 
 
171 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  47.26 
 
 
171 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  47.26 
 
 
171 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  44 
 
 
168 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  42.95 
 
 
170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  48.23 
 
 
157 aa  119  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  41.83 
 
 
169 aa  118  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  41.83 
 
 
169 aa  118  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1234  lipoprotein signal peptidase  43.87 
 
 
170 aa  118  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  43.06 
 
 
172 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  45.89 
 
 
176 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  44.22 
 
 
178 aa  116  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  44.9 
 
 
176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  45.21 
 
 
171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  45.7 
 
 
154 aa  115  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  41.89 
 
 
162 aa  114  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  51.67 
 
 
181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>