More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3274 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
171 aa  348  2e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  62.89 
 
 
170 aa  218  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  61.25 
 
 
170 aa  207  6e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  61.25 
 
 
170 aa  207  6e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  61.25 
 
 
170 aa  207  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  61.25 
 
 
170 aa  207  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  61.25 
 
 
170 aa  207  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  61.25 
 
 
170 aa  207  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  61.25 
 
 
170 aa  207  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  61.25 
 
 
170 aa  207  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  61.25 
 
 
170 aa  207  8e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  57.83 
 
 
173 aa  202  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3473  lipoprotein signal peptidase  60 
 
 
170 aa  202  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911066  normal  0.126226 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0196  lipoprotein signal peptidase  58.28 
 
 
170 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0222  lipoprotein signal peptidase  58.28 
 
 
170 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  50 
 
 
359 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 
359 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  43.67 
 
 
358 aa  143  9e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  48.32 
 
 
357 aa  143  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  48.37 
 
 
171 aa  142  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  52.63 
 
 
358 aa  141  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  50.71 
 
 
176 aa  140  8e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  46.67 
 
 
171 aa  140  9e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  46.11 
 
 
169 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  45.64 
 
 
166 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  46.21 
 
 
178 aa  138  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  51.75 
 
 
166 aa  137  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  49.29 
 
 
364 aa  137  6e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  49.28 
 
 
167 aa  137  7e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  46.98 
 
 
172 aa  137  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  46.31 
 
 
172 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  45.64 
 
 
166 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  45.64 
 
 
166 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  45.64 
 
 
166 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  45.64 
 
 
166 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  45.64 
 
 
166 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  45.64 
 
 
166 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  45.64 
 
 
166 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  46.34 
 
 
168 aa  136  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  44.14 
 
 
176 aa  135  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  44.14 
 
 
166 aa  134  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  44.14 
 
 
166 aa  134  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  46.31 
 
 
166 aa  134  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  42.38 
 
 
154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  46.76 
 
 
157 aa  131  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0480  lipoprotein signal peptidase  53.33 
 
 
159 aa  131  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  46.43 
 
 
164 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  46.43 
 
 
173 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  47.86 
 
 
174 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  43.62 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  46.43 
 
 
174 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  44.3 
 
 
166 aa  127  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  43.84 
 
 
163 aa  127  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  44.38 
 
 
182 aa  127  8.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  41.51 
 
 
180 aa  126  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  40.4 
 
 
159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  44.9 
 
 
169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  46.15 
 
 
182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  43.62 
 
 
166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  43.62 
 
 
166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  43.62 
 
 
166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  41.29 
 
 
158 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  42.58 
 
 
176 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  40.41 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  38.12 
 
 
165 aa  125  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  40.41 
 
 
162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  44.59 
 
 
178 aa  124  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1234  lipoprotein signal peptidase  45.33 
 
 
170 aa  124  8.000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  48.12 
 
 
169 aa  124  8.000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  40.12 
 
 
170 aa  122  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  43.95 
 
 
169 aa  122  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  43.95 
 
 
169 aa  122  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  43.23 
 
 
176 aa  122  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  44.76 
 
 
170 aa  122  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  44.83 
 
 
168 aa  122  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  47.26 
 
 
168 aa  121  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  45.14 
 
 
170 aa  120  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  41.61 
 
 
166 aa  120  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  41.61 
 
 
166 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  43.64 
 
 
169 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  43.31 
 
 
169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  44.6 
 
 
173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  40.91 
 
 
169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  42.96 
 
 
181 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  42.36 
 
 
164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  40.76 
 
 
165 aa  118  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  41.67 
 
 
164 aa  117  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  41.67 
 
 
164 aa  117  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  44.19 
 
 
173 aa  117  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  42.38 
 
 
170 aa  117  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  41.67 
 
 
164 aa  117  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  41.67 
 
 
164 aa  117  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  41.67 
 
 
164 aa  117  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  48.87 
 
 
179 aa  117  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  41.67 
 
 
164 aa  117  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  42.38 
 
 
170 aa  117  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  42.38 
 
 
170 aa  117  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  41.45 
 
 
171 aa  117  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  38.67 
 
 
164 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  38.82 
 
 
170 aa  117  9e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>