213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1644 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1644  phosphoesterase PA-phosphatase related  100 
 
 		 201 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.126989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5285  phosphoesterase PA-phosphatase related  100 
 
 		 201 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.965621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  85.16 
 
 		 358 aa  296  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  82.07 
 
 		 357 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  68.31 
 
 		 359 aa  249  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  68.31 
 
 		 359 aa  249  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  60.73 
 
 		 364 aa  226  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  58.92 
 
 		 358 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2147  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.98 
 
 		 178 aa  100  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.913624  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1037  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.23 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000361007  hitchhiker  0.00000179156 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0918  PAP2 family protein  37.23 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.791764  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0036  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.81 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4760  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.11 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1131  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.98 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0463  Undecaprenyl-diphosphatase  29.23 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.282936  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0037  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.78 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0148  hypothetical protein  39.8 
 
 		 266 aa  58.2  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1504  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.6 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1042  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.05 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00209  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.74 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0425  undecaprenyl-diphosphatase  29.44 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3620  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.75 
 
 		 311 aa  54.3  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000326063 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1412  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.05 
 
 		 263 aa  53.5  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.98368  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0465  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.27 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.451199  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1375  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.19 
 
 		 273 aa  52.4  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3550  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.37 
 
 		 278 aa  52  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.62844 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5915  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.63 
 
 		 249 aa  51.2  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.322864  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.68 
 
 		 157 aa  51.6  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0547  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.14 
 
 		 261 aa  51.2  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0347407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03667  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 230 aa  50.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.85 
 
 		 169 aa  50.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3198  PAP2 family protein  42.25 
 
 		 170 aa  50.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0979  phosphoesterase PA-phosphatase-like protein  29.05 
 
 		 253 aa  51.2  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.626703  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.03 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2555  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.14 
 
 		 271 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.729938  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0740  PAP2 family protein  45.9 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0272  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  27.96 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0637  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.58 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0315  membrane-associated phospholipid phosphatase  34.95 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.770739  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2515  hypothetical protein  30.86 
 
 		 296 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00069207  normal  0.734956 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1103  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.93 
 
 		 175 aa  50.4  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1778  phosphoesterase, PA-phosphatase related  24.86 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0735  PAP2 family protein  45.9 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1672  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.87 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2570  hypothetical protein  38.74 
 
 		 227 aa  49.3  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6892  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.64 
 
 		 251 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.757531 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2419  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.88 
 
 		 222 aa  48.9  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.623876  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3773  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.28 
 
 		 178 aa  48.9  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0882252 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3290  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.46 
 
 		 171 aa  48.9  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3885  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.28 
 
 		 178 aa  48.9  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5027  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.93 
 
 		 255 aa  48.5  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.223489  normal  0.43198 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2029  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.93 
 
 		 200 aa  48.5  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0021  PAP2 family protein  31.28 
 
 		 220 aa  48.1  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0282  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.96 
 
 		 246 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0187484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2126  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.45 
 
 		 213 aa  48.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0807737  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2232  phosphatidylglycerophosphatase B  39.74 
 
 		 253 aa  48.1  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000384262  hitchhiker  0.00312553 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2028  phosphatidylglycerophosphatase B  39.74 
 
 		 253 aa  48.1  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000921729  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1917  phosphatidylglycerophosphatase B  39.74 
 
 		 253 aa  48.1  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857525  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001653  membrane-associated phospholipid phosphatase  36.59 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7181  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.26 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.495224 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1102  phosphatase  31.86 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0240643  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.56 
 
 		 169 aa  47.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5780  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.61 
 
 		 430 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.313383  normal  0.564601 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2342  PAP2 family protein  27.59 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.149302  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0532  phosphoesterase PA-phosphatase related  44.44 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2154  PAP2 family protein  27.59 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0168528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2092  phosphatidylglycerophosphatase B  27.59 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.115637  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0937  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30.81 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2088  phosphatidylglycerophosphatase B  27.59 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0563174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2309  PAP2 family protein  27.59 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0998  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30.81 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51948  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2570  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  37.21 
 
 		 209 aa  46.6  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.501729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5319  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.84 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0786  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.55 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000027355 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1280  PAP2 family protein  32.74 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0275929  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2492  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.86 
 
 		 425 aa  47  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2335  PAP2 family protein  27.59 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0969  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30.81 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2181  PAP2 family protein  24.6 
 
 		 346 aa  46.2  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2990  phosphoesterase PA-phosphatase related  46.38 
 
 		 255 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4117  phosphoesterase PA-phosphatase related  38 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4143  phosphoesterase PA-phosphatase related  38 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3095  phosphoesterase PA-phosphatase related  46.38 
 
 		 255 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0901  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30.81 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2417  PAP2 family protein  27.59 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2748  phosphoesterase, PA-phosphatase-related protein  36.44 
 
 		 248 aa  46.2  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.572696  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0231  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.26 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1842  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.54 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1017  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30.81 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0729132  normal  0.570341 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2063  hypothetical protein  40 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0878  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.71 
 
 		 182 aa  46.2  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.749948  hitchhiker  0.002123 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0479  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.67 
 
 		 170 aa  45.8  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2222  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.7 
 
 		 447 aa  46.2  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2382  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.47 
 
 		 221 aa  45.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000279179  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1713  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.41 
 
 		 176 aa  45.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.118972  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4761  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.08 
 
 		 280 aa  45.4  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000159664 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.66 
 
 		 178 aa  45.8  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0313  phosphoesterase, PA-phosphatase related  45.9 
 
 		 305 aa  45.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.512715  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1093  membrane-associated phospholipid phosphatase  29.25 
 
 		 218 aa  45.4  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00170585  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1577  hypothetical protein  39.78 
 
 		 392 aa  45.4  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.353635  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>