More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0265 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 166 aa  332  2e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  70.81 
 
 		 165 aa  238  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  65.45 
 
 		 178 aa  216  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  67.1 
 
 		 156 aa  214  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1117  lipoprotein signal peptidase  56.05 
 
 		 165 aa  166  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.149841  normal  0.0706096 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0487  lipoprotein signal peptidase  53.5 
 
 		 178 aa  155  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  45.39 
 
 		 161 aa  124  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  42.17 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  45.39 
 
 		 202 aa  119  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  44.74 
 
 		 162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  41.03 
 
 		 163 aa  117  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  43.14 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  42.68 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  41.03 
 
 		 160 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  43.24 
 
 		 161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  43.54 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  47.48 
 
 		 166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  40.65 
 
 		 169 aa  110  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  40.79 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  40.79 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  46.04 
 
 		 166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  46.04 
 
 		 166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  46.04 
 
 		 166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  46.04 
 
 		 166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  46.04 
 
 		 166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  46.04 
 
 		 166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  44.22 
 
 		 172 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  46.04 
 
 		 166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  46.04 
 
 		 166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  46.72 
 
 		 166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  43.54 
 
 		 172 aa  108  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  45.99 
 
 		 166 aa  107  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  42.76 
 
 		 164 aa  107  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  39.49 
 
 		 160 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  45.32 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  39.6 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  45.32 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  38.93 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  45.32 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  45.65 
 
 		 173 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  43.17 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  45.65 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  44.6 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  39.24 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  44.6 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  44.93 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  39.19 
 
 		 165 aa  103  9e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  39.46 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  37.01 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  47.76 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  42.42 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  41.4 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  44.52 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  43.7 
 
 		 169 aa  102  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  37.89 
 
 		 158 aa  100  7e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  42.76 
 
 		 178 aa  100  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  39.26 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  40 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  39.26 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  41.1 
 
 		 235 aa  100  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  42.03 
 
 		 170 aa  100  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  39.26 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  38.65 
 
 		 171 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  39.19 
 
 		 174 aa  99.8  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  39.26 
 
 		 171 aa  99  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  44 
 
 		 167 aa  98.6  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  41.61 
 
 		 170 aa  98.2  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  39.04 
 
 		 168 aa  98.2  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  39.02 
 
 		 166 aa  97.8  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  44.67 
 
 		 176 aa  97.8  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0480  lipoprotein signal peptidase  41.72 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2207  lipoprotein signal peptidase  41.22 
 
 		 151 aa  96.7  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  41.73 
 
 		 179 aa  96.7  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  39.04 
 
 		 165 aa  97.1  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 169 aa  95.5  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  38.61 
 
 		 164 aa  95.9  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  42.11 
 
 		 154 aa  95.5  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  37.58 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1577  lipoprotein signal peptidase  39.04 
 
 		 167 aa  95.1  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3649  lipoprotein signal peptidase  41.83 
 
 		 164 aa  95.1  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1520  lipoprotein signal peptidase  39.04 
 
 		 167 aa  95.1  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0161435  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  43.64 
 
 		 160 aa  94.7  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  40.41 
 
 		 159 aa  94.7  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  41.73 
 
 		 164 aa  94.7  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  39.46 
 
 		 168 aa  94.4  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 170 aa  94  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  39.22 
 
 		 170 aa  94  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  40.94 
 
 		 154 aa  94  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  36.67 
 
 		 170 aa  94  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  37.66 
 
 		 170 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  42.54 
 
 		 170 aa  92.8  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  41.79 
 
 		 176 aa  92.8  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  41.96 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  34.76 
 
 		 172 aa  93.2  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3952  lipoprotein signal peptidase  44.12 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.386002  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  41.5 
 
 		 358 aa  92.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  37.66 
 
 		 170 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  37.66 
 
 		 170 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  43.85 
 
 		 170 aa  92.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>