More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1117 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1117  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 165 aa  330  5e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.149841  normal  0.0706096 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0487  lipoprotein signal peptidase  59.38 
 
 		 178 aa  184  6e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  56.05 
 
 		 166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 178 aa  166  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  51.59 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  52.26 
 
 		 165 aa  164  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  44.9 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  44.65 
 
 		 158 aa  131  5e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  43.59 
 
 		 161 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  47.33 
 
 		 174 aa  127  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  46.67 
 
 		 174 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  40.76 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  37.2 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  44.97 
 
 		 161 aa  124  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  46.67 
 
 		 173 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  41.98 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  40.82 
 
 		 182 aa  120  8e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  39.39 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  43.71 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 		 163 aa  117  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  42.67 
 
 		 169 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  44.23 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  45.07 
 
 		 179 aa  115  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  44.37 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  43.62 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  45.21 
 
 		 171 aa  114  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 162 aa  114  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  42.47 
 
 		 176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  45.39 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  40.94 
 
 		 172 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0480  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  40.94 
 
 		 172 aa  111  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  38.22 
 
 		 174 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  40.67 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  37.25 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  40.94 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  40.94 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  40.94 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  40.94 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  40.94 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  40.94 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  40.94 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  40.94 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  38.26 
 
 		 171 aa  108  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  41.03 
 
 		 166 aa  107  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  36.2 
 
 		 163 aa  108  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  41.61 
 
 		 166 aa  107  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  40 
 
 		 159 aa  107  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  40.27 
 
 		 166 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  40.94 
 
 		 166 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  40.94 
 
 		 166 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  44.22 
 
 		 178 aa  107  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  44.44 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  40.27 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  40.27 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 		 359 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  39.33 
 
 		 169 aa  106  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  44.14 
 
 		 170 aa  106  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  40.27 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  38.36 
 
 		 359 aa  107  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  35.9 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  40.38 
 
 		 173 aa  106  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  42.34 
 
 		 168 aa  106  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  43.05 
 
 		 364 aa  105  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  41.78 
 
 		 358 aa  104  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  39.1 
 
 		 170 aa  103  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  38.67 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2207  lipoprotein signal peptidase  41.89 
 
 		 151 aa  102  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  42.07 
 
 		 170 aa  102  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  39.44 
 
 		 154 aa  101  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  38.1 
 
 		 170 aa  101  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  38.1 
 
 		 170 aa  101  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  38.1 
 
 		 170 aa  101  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  37.67 
 
 		 173 aa  100  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  34.44 
 
 		 169 aa  100  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  40.43 
 
 		 165 aa  101  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  43.36 
 
 		 167 aa  100  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  40.43 
 
 		 165 aa  100  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  40.94 
 
 		 166 aa  100  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  38.1 
 
 		 170 aa  100  8e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  35.66 
 
 		 171 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  40.94 
 
 		 166 aa  100  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  39.6 
 
 		 170 aa  100  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 		 169 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  38.26 
 
 		 358 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  40.69 
 
 		 169 aa  99.8  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  40.52 
 
 		 202 aa  99.8  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  34.9 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  37.33 
 
 		 168 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  37.97 
 
 		 169 aa  99.4  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  35.86 
 
 		 171 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  40.41 
 
 		 170 aa  99.8  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  40.41 
 
 		 170 aa  99.8  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  40.41 
 
 		 170 aa  99.8  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  40.41 
 
 		 170 aa  99.8  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  40.41 
 
 		 170 aa  99.8  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  40.41 
 
 		 170 aa  99.8  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  40.41 
 
 		 170 aa  99.8  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>