More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3952 on replicon NC_009957
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009955  Dshi_3614  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 157 aa  307  2.9999999999999997e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.463393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3952  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 157 aa  307  2.9999999999999997e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.386002  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  49.67 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  47.33 
 
 		 364 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  41.3 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  45.86 
 
 		 358 aa  99.4  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  44.76 
 
 		 165 aa  98.2  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  38.67 
 
 		 170 aa  97.1  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  41.3 
 
 		 168 aa  95.5  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  39.13 
 
 		 357 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  37.33 
 
 		 170 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  37.33 
 
 		 170 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  38.1 
 
 		 359 aa  95.5  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  38.1 
 
 		 359 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  37.33 
 
 		 170 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 358 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  38.22 
 
 		 158 aa  94.4  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  38.97 
 
 		 166 aa  94.4  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  38.97 
 
 		 166 aa  94.4  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 		 171 aa  94.4  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  42.75 
 
 		 153 aa  94.4  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  39.47 
 
 		 156 aa  94  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 		 171 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  36.67 
 
 		 170 aa  93.2  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 		 171 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 		 171 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0480  lipoprotein signal peptidase  39.87 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1117  lipoprotein signal peptidase  43.38 
 
 		 165 aa  92.4  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.149841  normal  0.0706096 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  36.73 
 
 		 162 aa  92.8  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  43.18 
 
 		 169 aa  92.8  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  44.12 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 		 171 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 176 aa  91.7  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  42.66 
 
 		 178 aa  91.7  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 		 164 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 		 164 aa  90.9  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0585  lipoprotein signal peptidase  37.33 
 
 		 166 aa  90.9  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00142013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  39.13 
 
 		 170 aa  90.9  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  38.46 
 
 		 159 aa  90.5  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 171 aa  90.5  9e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  40.15 
 
 		 166 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0051  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 		 166 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0475146 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  40.15 
 
 		 166 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  40.15 
 
 		 166 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  40.15 
 
 		 166 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  40.15 
 
 		 166 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  40.15 
 
 		 166 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 		 166 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.322975 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  35.57 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  37.67 
 
 		 170 aa  89.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  40.15 
 
 		 166 aa  89.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0050  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 		 166 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  40.58 
 
 		 169 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  40.15 
 
 		 166 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0051  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 		 166 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  35.57 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  35.57 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  35.57 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  38.69 
 
 		 182 aa  89.7  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0052  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 		 166 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876995  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  35.57 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  36.5 
 
 		 161 aa  89.4  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  39.42 
 
 		 166 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  35.53 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  35.57 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  40.58 
 
 		 169 aa  89.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  40.58 
 
 		 169 aa  89.4  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 176 aa  88.2  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  34.9 
 
 		 164 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 		 170 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  41.26 
 
 		 176 aa  87.8  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 		 170 aa  87.8  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  33.99 
 
 		 171 aa  87.4  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 		 170 aa  87.8  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 		 170 aa  87.8  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 		 170 aa  87.8  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 		 170 aa  87.8  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 		 170 aa  87.8  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 		 170 aa  87.8  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 		 170 aa  87.8  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 		 160 aa  87  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  39.71 
 
 		 182 aa  87  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  38.13 
 
 		 168 aa  87  9e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  41.13 
 
 		 170 aa  87  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  37.23 
 
 		 165 aa  86.3  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0632  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 177 aa  87  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.263263  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 		 168 aa  85.9  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  37.32 
 
 		 171 aa  85.9  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  41.73 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 		 170 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 		 170 aa  85.5  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1007  lipoprotein signal peptidase  39.16 
 
 		 167 aa  85.1  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  43.17 
 
 		 166 aa  85.1  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 		 145 aa  84.7  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0487  lipoprotein signal peptidase  37.84 
 
 		 178 aa  84.7  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  35.53 
 
 		 173 aa  84.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  34.23 
 
 		 162 aa  84.3  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  38.64 
 
 		 166 aa  84.3  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 163 aa  84.3  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  40.58 
 
 		 174 aa  84.3  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>