More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0487 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0487  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 178 aa  358  3e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1117  lipoprotein signal peptidase  59.38 
 
 		 165 aa  167  6e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.149841  normal  0.0706096 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  51.27 
 
 		 156 aa  156  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  53.5 
 
 		 166 aa  155  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  53.5 
 
 		 178 aa  151  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  50.32 
 
 		 165 aa  145  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  44.24 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  47.24 
 
 		 160 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  44.94 
 
 		 161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  46.25 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  43.92 
 
 		 153 aa  121  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  40.38 
 
 		 162 aa  121  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  42.38 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  41.88 
 
 		 163 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0480  lipoprotein signal peptidase  46.2 
 
 		 159 aa  114  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  42 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  45.81 
 
 		 166 aa  108  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  44.83 
 
 		 173 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  43.05 
 
 		 174 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  40.41 
 
 		 159 aa  107  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  43.05 
 
 		 174 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  45.64 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  44.3 
 
 		 167 aa  104  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  41.89 
 
 		 158 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  45.83 
 
 		 163 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  41.33 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  37.06 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  41.25 
 
 		 169 aa  101  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  43.33 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  38.69 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  40.24 
 
 		 170 aa  100  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3649  lipoprotein signal peptidase  44.6 
 
 		 164 aa  99.4  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  42.95 
 
 		 171 aa  99.4  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  34.62 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  44.52 
 
 		 157 aa  99  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  34.32 
 
 		 171 aa  99.4  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  40.67 
 
 		 166 aa  98.6  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  40.67 
 
 		 166 aa  98.6  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  40.12 
 
 		 166 aa  98.2  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  36.02 
 
 		 164 aa  98.2  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  39.05 
 
 		 166 aa  98.2  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  37.97 
 
 		 176 aa  97.8  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  39.05 
 
 		 166 aa  98.2  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  39.05 
 
 		 166 aa  98.2  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  44.37 
 
 		 162 aa  97.8  7e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  38.65 
 
 		 164 aa  97.8  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  40.94 
 
 		 171 aa  97.8  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  39.52 
 
 		 166 aa  97.8  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  37.09 
 
 		 170 aa  97.1  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 170 aa  97.1  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  41.72 
 
 		 176 aa  96.7  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  37.87 
 
 		 166 aa  96.7  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 		 163 aa  95.9  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 166 aa  95.9  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  40.67 
 
 		 166 aa  95.1  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  36.94 
 
 		 174 aa  95.1  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  40.67 
 
 		 166 aa  95.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  40.67 
 
 		 166 aa  95.1  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2207  lipoprotein signal peptidase  41.89 
 
 		 151 aa  95.5  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  39.33 
 
 		 172 aa  95.1  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  40.67 
 
 		 166 aa  95.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  40.67 
 
 		 166 aa  95.1  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  40.67 
 
 		 166 aa  95.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  40.67 
 
 		 166 aa  95.1  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 		 172 aa  95.1  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  35.85 
 
 		 173 aa  94.7  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  35.53 
 
 		 171 aa  94.7  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  39.6 
 
 		 171 aa  94.7  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  39.33 
 
 		 172 aa  94.7  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  37.33 
 
 		 145 aa  94.7  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  41.33 
 
 		 166 aa  94.4  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  36.72 
 
 		 182 aa  94.4  8e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  38.51 
 
 		 168 aa  94.4  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  40.27 
 
 		 170 aa  94.4  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  39.6 
 
 		 171 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  39.6 
 
 		 171 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  39.6 
 
 		 171 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  38.04 
 
 		 170 aa  94  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  38.04 
 
 		 170 aa  94  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3783  lipoprotein signal peptidase  39.16 
 
 		 172 aa  93.6  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.800649  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  38.04 
 
 		 170 aa  94  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  41.61 
 
 		 357 aa  92.8  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  40.52 
 
 		 154 aa  92.8  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  39.61 
 
 		 170 aa  92.4  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1860  signal peptidase II  39.07 
 
 		 174 aa  92.4  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  41.72 
 
 		 359 aa  92  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  41.72 
 
 		 359 aa  92  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  30.46 
 
 		 180 aa  91.3  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  35.66 
 
 		 169 aa  91.3  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  41.13 
 
 		 163 aa  90.9  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  40.97 
 
 		 179 aa  90.5  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  43.17 
 
 		 169 aa  90.5  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  42.74 
 
 		 164 aa  90.9  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  43.17 
 
 		 169 aa  90.5  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 176 aa  89.4  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  35.57 
 
 		 168 aa  89.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  33.89 
 
 		 180 aa  89.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  38.67 
 
 		 178 aa  90.1  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  43.06 
 
 		 178 aa  89.4  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  38.82 
 
 		 160 aa  88.6  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>