More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0195 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 163 aa  327  3e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  42.95 
 
 		 160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  43.23 
 
 		 166 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  43.23 
 
 		 166 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  43.23 
 
 		 166 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  43.23 
 
 		 166 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  43.23 
 
 		 166 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  43.23 
 
 		 166 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  43.23 
 
 		 166 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  43.23 
 
 		 166 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  42.38 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  38.13 
 
 		 159 aa  103  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  40.91 
 
 		 166 aa  103  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  42.21 
 
 		 174 aa  103  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  37.27 
 
 		 164 aa  103  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  37.89 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  45.89 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  41.5 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  36.88 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  36.88 
 
 		 172 aa  101  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  36.6 
 
 		 176 aa  99.8  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  41.94 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  42 
 
 		 173 aa  99.4  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  39.46 
 
 		 160 aa  99  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 169 aa  98.6  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  38.82 
 
 		 154 aa  98.6  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 169 aa  98.6  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  41.22 
 
 		 166 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  41.29 
 
 		 166 aa  98.2  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  40.65 
 
 		 166 aa  98.2  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  40.54 
 
 		 166 aa  98.2  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  40.65 
 
 		 166 aa  98.2  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  40.65 
 
 		 166 aa  98.2  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  36.65 
 
 		 163 aa  97.8  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1257  lipoprotein signal peptidase  37.91 
 
 		 160 aa  97.4  7e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  38.16 
 
 		 158 aa  97.4  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  39.35 
 
 		 169 aa  97.4  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  37.66 
 
 		 161 aa  97.4  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  40 
 
 		 164 aa  97.1  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  40.43 
 
 		 162 aa  96.3  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0487  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 		 178 aa  95.9  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  41.43 
 
 		 153 aa  95.5  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  35.46 
 
 		 161 aa  95.1  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  39.26 
 
 		 154 aa  94.7  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  40.54 
 
 		 189 aa  94.7  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 160 aa  93.6  9e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  42.36 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1860  signal peptidase II  40.94 
 
 		 174 aa  92.8  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 		 182 aa  92.8  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  36.62 
 
 		 171 aa  92.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2207  lipoprotein signal peptidase  39.73 
 
 		 151 aa  91.7  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4414  signal peptidase II  46.22 
 
 		 123 aa  91.3  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849735  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  33.96 
 
 		 178 aa  90.9  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 168 aa  90.5  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  39.39 
 
 		 172 aa  90.1  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  39.04 
 
 		 173 aa  90.1  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  39.04 
 
 		 150 aa  89.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  38.1 
 
 		 178 aa  89  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  39.26 
 
 		 169 aa  89  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 145 aa  88.6  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  40.43 
 
 		 358 aa  88.6  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  36.13 
 
 		 171 aa  88.6  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  37.42 
 
 		 178 aa  88.6  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  38.12 
 
 		 171 aa  87.8  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  36.71 
 
 		 169 aa  87.8  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  39.22 
 
 		 169 aa  87.8  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  39.73 
 
 		 160 aa  87.4  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  35.26 
 
 		 169 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  35.1 
 
 		 163 aa  86.7  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 		 173 aa  87  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  35.9 
 
 		 169 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 167 aa  86.3  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 170 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  37.16 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 170 aa  85.9  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 170 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 170 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 170 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 170 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 170 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 170 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 170 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  37.14 
 
 		 165 aa  84.7  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  35.42 
 
 		 170 aa  84.7  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 171 aa  84.7  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3783  lipoprotein signal peptidase  34.62 
 
 		 172 aa  84.3  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.800649  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 		 164 aa  84.3  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  34.93 
 
 		 166 aa  84  8e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3649  lipoprotein signal peptidase  39.37 
 
 		 164 aa  84  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 		 169 aa  83.6  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  37.78 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  34.15 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  38.67 
 
 		 150 aa  83.6  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  38.35 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  38.35 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  35.92 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  39.1 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  35.06 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  32.08 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>