More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3783 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3783  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 172 aa  333  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.800649  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2356  lipoprotein signal peptidase  53.38 
 
 		 173 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0383384 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3258  signal peptidase II  52.83 
 
 		 171 aa  143  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.802617  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  44.52 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  40.82 
 
 		 169 aa  101  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 170 aa  101  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  43.33 
 
 		 154 aa  101  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  43.07 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  39.24 
 
 		 166 aa  97.4  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 170 aa  97.1  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  38.61 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  40.41 
 
 		 179 aa  95.9  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1007  lipoprotein signal peptidase  38.27 
 
 		 167 aa  95.5  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  40.67 
 
 		 160 aa  95.5  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 166 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 166 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 166 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 166 aa  95.5  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  36.71 
 
 		 166 aa  94.7  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0487  lipoprotein signal peptidase  39.16 
 
 		 178 aa  93.6  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  40.41 
 
 		 172 aa  92  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  42.24 
 
 		 169 aa  91.7  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  40.41 
 
 		 172 aa  91.3  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  38.89 
 
 		 166 aa  91.3  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 164 aa  90.9  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 		 169 aa  90.1  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  32.69 
 
 		 182 aa  90.1  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  36.31 
 
 		 169 aa  89.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  37.25 
 
 		 159 aa  89.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 		 173 aa  89.4  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  40.65 
 
 		 169 aa  89.4  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  36.31 
 
 		 169 aa  89.4  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  40.69 
 
 		 165 aa  89.4  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2861  lipoprotein signal peptidase  36.76 
 
 		 171 aa  88.6  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0978018 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  40.38 
 
 		 163 aa  89  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  39.04 
 
 		 174 aa  88.6  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  40.69 
 
 		 165 aa  88.6  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  35.92 
 
 		 166 aa  88.2  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 		 168 aa  87.8  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  39.33 
 
 		 358 aa  87.8  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 		 174 aa  87.8  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  37.58 
 
 		 159 aa  87.8  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  35.92 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  39.73 
 
 		 173 aa  87  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  35.92 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  35.92 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  35.92 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  35.92 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  35.92 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  35.92 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  36.54 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  34.67 
 
 		 163 aa  86.7  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  34.44 
 
 		 165 aa  86.3  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  37.04 
 
 		 189 aa  86.7  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 		 174 aa  86.3  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 		 164 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  34.46 
 
 		 172 aa  85.5  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 		 160 aa  85.5  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 		 154 aa  85.1  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 		 154 aa  84.7  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 		 170 aa  84.7  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  30.77 
 
 		 165 aa  84.7  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  37.01 
 
 		 163 aa  85.1  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4439  signal peptidase II  36.54 
 
 		 165 aa  84.7  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  36.55 
 
 		 158 aa  84.3  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  34.62 
 
 		 163 aa  84.3  8e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  38.62 
 
 		 169 aa  84.3  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  36.11 
 
 		 180 aa  84  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4860  lipoprotein signal peptidase  35.85 
 
 		 164 aa  84  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.777227  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 		 154 aa  83.6  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0051  lipoprotein signal peptidase  36.6 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  34.38 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0051  lipoprotein signal peptidase  36.6 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0475146 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  38.89 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0052  lipoprotein signal peptidase  36.6 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876995  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  35.57 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  38.62 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  35.57 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0288  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  39.19 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  35.57 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  35.57 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  35.57 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  34.25 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  35.57 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  36.88 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0050  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  34.23 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.322975 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0632  lipoprotein signal peptidase  37.91 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.263263  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  32.19 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  32.19 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  37.32 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  32.3 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  32.41 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  32.41 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.978547 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>