More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0288 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0288  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 184 aa  362  2e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4181  lipoprotein signal peptidase  43.29 
 
 		 165 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4860  lipoprotein signal peptidase  44.72 
 
 		 164 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.777227  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1007  lipoprotein signal peptidase  42.07 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3163  lipoprotein signal peptidase  46.72 
 
 		 164 aa  124  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4037  lipoprotein signal peptidase  41.57 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2543  lipoprotein signal peptidase  47.45 
 
 		 165 aa  122  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2861  lipoprotein signal peptidase  43.92 
 
 		 171 aa  115  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0978018 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  42.68 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  41.61 
 
 		 174 aa  111  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2281  lipoprotein signal peptidase  42.65 
 
 		 171 aa  108  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2603  lipoprotein signal peptidase  48.28 
 
 		 171 aa  108  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172447 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2326  lipoprotein signal peptidase  47.41 
 
 		 171 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  0.6435 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1799  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 171 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.408205  normal  0.0603455 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0392  lipoprotein signal peptidase  44.52 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.034269  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2219  lipoprotein signal peptidase  42.33 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 		 160 aa  102  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0632  lipoprotein signal peptidase  41.5 
 
 		 177 aa  100  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.263263  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4414  signal peptidase II  40.52 
 
 		 123 aa  96.3  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849735  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0614  lipoprotein signal peptidase  40.46 
 
 		 199 aa  95.9  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.107984 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2356  lipoprotein signal peptidase  35.66 
 
 		 173 aa  92.4  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0383384 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 		 169 aa  88.2  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1715  lipoprotein signal peptidase  44.68 
 
 		 165 aa  87.8  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.488769  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  37.14 
 
 		 163 aa  87  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1410  lipoprotein signal peptidase  34.93 
 
 		 174 aa  85.1  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2206  lipoprotein signal peptidase  45.05 
 
 		 177 aa  84.3  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.252335  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3783  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.800649  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1394  lipoprotein signal peptidase  44.36 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.660722  normal  0.96884 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2717  lipoprotein signal peptidase  33.73 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.702732 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  35.94 
 
 		 181 aa  80.9  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  35.33 
 
 		 159 aa  80.9  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4439  signal peptidase II  32.87 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  40.69 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  40.69 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  36.62 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  33.78 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  38.62 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  32.92 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  37.76 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_002978  WD0760  lipoprotein signal peptidase  37.72 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.473173  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  34.03 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  34.16 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  34.16 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  34.16 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  34.16 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  34.16 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  34.16 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  34.16 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  37.93 
 
 		 358 aa  75.1  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  34.16 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  34.16 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  35.07 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  35.92 
 
 		 174 aa  74.3  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1060  signal peptidase II  31.21 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  35.21 
 
 		 174 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  32.39 
 
 		 168 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  35.04 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  40.65 
 
 		 364 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  38.21 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  35.59 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  36.21 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  30.28 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  38.52 
 
 		 166 aa  72  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  38.52 
 
 		 166 aa  72  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  38.52 
 
 		 166 aa  72  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  39.29 
 
 		 176 aa  72  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  38.52 
 
 		 166 aa  72  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  38.52 
 
 		 166 aa  72  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  38.52 
 
 		 166 aa  72  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  38.52 
 
 		 166 aa  72  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  35.1 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0222  lipoprotein signal peptidase  34.16 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0196  lipoprotein signal peptidase  34.16 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  35.65 
 
 		 176 aa  70.9  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  34.18 
 
 		 173 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3614  lipoprotein signal peptidase  35.85 
 
 		 157 aa  70.9  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.463393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0852  signal peptidase II  34.33 
 
 		 153 aa  70.5  0.00000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.213743  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  35.9 
 
 		 154 aa  70.5  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  34.78 
 
 		 166 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  38.26 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3473  lipoprotein signal peptidase  34.16 
 
 		 170 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911066  normal  0.126226 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3952  lipoprotein signal peptidase  35.85 
 
 		 157 aa  70.9  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.386002  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  33.82 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  34.78 
 
 		 166 aa  70.9  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  33.82 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  33.81 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  35.66 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  37.06 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  35.97 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  31.54 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  32.31 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>