More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0609 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 163 aa  324  3e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  51.33 
 
 		 151 aa  147  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  46.21 
 
 		 145 aa  114  5e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  42.18 
 
 		 145 aa  97.4  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  41.4 
 
 		 154 aa  97.1  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  41.4 
 
 		 154 aa  97.1  9e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  34.97 
 
 		 182 aa  94  9e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 		 169 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  43.33 
 
 		 144 aa  93.6  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  35.54 
 
 		 174 aa  92  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  35.58 
 
 		 176 aa  90.9  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  36.77 
 
 		 150 aa  90.1  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  38.73 
 
 		 171 aa  88.2  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2691  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 187 aa  88.6  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 		 163 aa  87.8  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  35.8 
 
 		 169 aa  87  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0288  lipoprotein signal peptidase  37.14 
 
 		 184 aa  87  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  34.55 
 
 		 180 aa  85.9  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  34.73 
 
 		 169 aa  86.3  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  34.55 
 
 		 173 aa  85.9  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  34.73 
 
 		 169 aa  86.3  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 153 aa  86.3  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  39.6 
 
 		 165 aa  85.5  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  35.37 
 
 		 170 aa  85.1  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  34.51 
 
 		 155 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  32.67 
 
 		 166 aa  85.1  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  35.58 
 
 		 170 aa  84.7  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  35.58 
 
 		 170 aa  84.7  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  35.58 
 
 		 170 aa  84.7  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 166 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 166 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 166 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 166 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 166 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 166 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 166 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  38.22 
 
 		 170 aa  84.3  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  37.8 
 
 		 158 aa  84  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1860  signal peptidase II  36.48 
 
 		 174 aa  84  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  39.19 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3649  lipoprotein signal peptidase  40.74 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  37.41 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  33.33 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  33.74 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  36.54 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  38.13 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  31.55 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  37.7 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  34.57 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  37.06 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  35.82 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  38.62 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  38.62 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  36.81 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  32.1 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  35.66 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  40.91 
 
 		 364 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  38.13 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  36.81 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  35.4 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1081  lipoprotein signal peptidase  37.14 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  36.54 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  36.2 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  36.2 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  41.55 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  34.62 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0557  signal peptidase II  38.1 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  36.2 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  35.12 
 
 		 182 aa  80.9  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  36.92 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  32.64 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  36.92 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2207  lipoprotein signal peptidase  42.75 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  41.28 
 
 		 167 aa  80.5  0.000000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  34.44 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  35.17 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  34.53 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  37.41 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  36.17 
 
 		 170 aa  80.5  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  39.57 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  34.88 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  37.82 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  29.87 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  37.14 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>