More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2861 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2861  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 171 aa  337  4e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0978018 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1007  lipoprotein signal peptidase  61.45 
 
 		 167 aa  205  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2603  lipoprotein signal peptidase  52.94 
 
 		 171 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172447 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0392  lipoprotein signal peptidase  50.97 
 
 		 165 aa  143  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.034269  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2281  lipoprotein signal peptidase  53.64 
 
 		 171 aa  143  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4037  lipoprotein signal peptidase  49.37 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4181  lipoprotein signal peptidase  48.75 
 
 		 165 aa  141  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2326  lipoprotein signal peptidase  52.29 
 
 		 171 aa  141  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  0.6435 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4860  lipoprotein signal peptidase  46.2 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.777227  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2219  lipoprotein signal peptidase  49.68 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3163  lipoprotein signal peptidase  47.83 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1799  lipoprotein signal peptidase  50.88 
 
 		 171 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.408205  normal  0.0603455 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0288  lipoprotein signal peptidase  44.1 
 
 		 184 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2543  lipoprotein signal peptidase  45.83 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0632  lipoprotein signal peptidase  45.22 
 
 		 177 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.263263  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  42.38 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  43.88 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 		 169 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 		 169 aa  102  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  33.76 
 
 		 169 aa  100  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1715  lipoprotein signal peptidase  45.68 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.488769  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  35.85 
 
 		 170 aa  99  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1410  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 174 aa  98.2  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  41.26 
 
 		 166 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  41.26 
 
 		 166 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  41.26 
 
 		 166 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  41.26 
 
 		 166 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  41.26 
 
 		 166 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  41.26 
 
 		 166 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  41.26 
 
 		 166 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  37.75 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  35.22 
 
 		 170 aa  96.3  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  40.56 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  40.56 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  40.56 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  32.47 
 
 		 180 aa  95.9  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3783  lipoprotein signal peptidase  38 
 
 		 172 aa  95.5  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.800649  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  36.67 
 
 		 157 aa  95.9  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 		 166 aa  95.5  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  38 
 
 		 171 aa  95.5  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  37.09 
 
 		 169 aa  95.1  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 		 166 aa  95.1  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 173 aa  94.7  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 		 166 aa  95.1  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  36.81 
 
 		 182 aa  94.7  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  38.51 
 
 		 163 aa  94.4  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  38.35 
 
 		 163 aa  94  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 173 aa  94  9e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 		 172 aa  93.2  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  36.73 
 
 		 174 aa  92.8  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  33.78 
 
 		 176 aa  92.4  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  36.05 
 
 		 174 aa  91.7  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  35.86 
 
 		 159 aa  91.7  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  36.67 
 
 		 160 aa  90.9  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2356  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 		 173 aa  90.9  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0383384 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  37.09 
 
 		 172 aa  90.9  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  38.51 
 
 		 159 aa  90.1  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 176 aa  90.1  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  32.12 
 
 		 182 aa  90.1  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  39.67 
 
 		 178 aa  90.1  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  34.87 
 
 		 168 aa  90.1  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 170 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 170 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 170 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 170 aa  89.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  35.81 
 
 		 162 aa  89.7  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1394  lipoprotein signal peptidase  48.15 
 
 		 190 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.660722  normal  0.96884 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 171 aa  89.7  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4439  signal peptidase II  37.18 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  32.91 
 
 		 170 aa  89  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  35.33 
 
 		 154 aa  88.2  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  33.75 
 
 		 170 aa  88.6  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  36.31 
 
 		 160 aa  88.2  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 171 aa  88.2  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 176 aa  87.8  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  32.93 
 
 		 171 aa  87.4  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  35.48 
 
 		 358 aa  87.4  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  32.93 
 
 		 171 aa  87.4  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  32.93 
 
 		 171 aa  87.4  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  41.18 
 
 		 164 aa  87.4  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  33.78 
 
 		 171 aa  87.4  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  36.13 
 
 		 357 aa  87  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 		 157 aa  87  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  35.21 
 
 		 168 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  38.61 
 
 		 167 aa  86.7  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  37.33 
 
 		 165 aa  86.3  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 169 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3258  signal peptidase II  35.93 
 
 		 171 aa  86.3  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.802617  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  32.32 
 
 		 171 aa  86.3  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  35.57 
 
 		 170 aa  86.3  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  38 
 
 		 164 aa  85.9  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  38.02 
 
 		 163 aa  85.5  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  39.39 
 
 		 168 aa  85.9  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  35.5 
 
 		 170 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  30.49 
 
 		 176 aa  85.9  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  35.5 
 
 		 170 aa  85.9  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  32.5 
 
 		 169 aa  85.9  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  33.96 
 
 		 166 aa  85.1  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  39.13 
 
 		 165 aa  85.1  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>