More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1410 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1410  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 174 aa  341  2.9999999999999997e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0632  lipoprotein signal peptidase  54.97 
 
 		 177 aa  142  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.263263  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2281  lipoprotein signal peptidase  49.32 
 
 		 171 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4037  lipoprotein signal peptidase  44.68 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1007  lipoprotein signal peptidase  41.4 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0392  lipoprotein signal peptidase  47.26 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.034269  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2326  lipoprotein signal peptidase  48.59 
 
 		 171 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  0.6435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2603  lipoprotein signal peptidase  47.89 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4181  lipoprotein signal peptidase  42.55 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4860  lipoprotein signal peptidase  40.67 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.777227  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1799  lipoprotein signal peptidase  46.85 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.408205  normal  0.0603455 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2543  lipoprotein signal peptidase  42.18 
 
 		 165 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3163  lipoprotein signal peptidase  40.82 
 
 		 164 aa  104  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2861  lipoprotein signal peptidase  39.16 
 
 		 171 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0978018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2219  lipoprotein signal peptidase  45.21 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  41.96 
 
 		 154 aa  102  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0288  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  39.22 
 
 		 176 aa  99  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  41.13 
 
 		 160 aa  98.6  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  40.13 
 
 		 163 aa  98.6  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  38.67 
 
 		 169 aa  97.8  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  36.88 
 
 		 182 aa  97.1  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  39.19 
 
 		 163 aa  95.5  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  39.19 
 
 		 165 aa  94.7  5e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  39.46 
 
 		 166 aa  93.6  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  38 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  39.6 
 
 		 170 aa  94  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  39.6 
 
 		 170 aa  94  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0614  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 		 199 aa  93.2  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.107984 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  39.6 
 
 		 170 aa  94  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  38.26 
 
 		 170 aa  92.8  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  38.78 
 
 		 170 aa  92.8  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 		 173 aa  92.4  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 		 170 aa  92.4  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  35.1 
 
 		 170 aa  92  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  39.46 
 
 		 168 aa  91.3  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  37.24 
 
 		 154 aa  91.3  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  38.1 
 
 		 158 aa  90.5  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  38.93 
 
 		 167 aa  90.5  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 		 171 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 		 171 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  37.06 
 
 		 174 aa  90.1  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 		 171 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0760  lipoprotein signal peptidase  36.05 
 
 		 158 aa  89.7  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.473173  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 163 aa  89.4  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  36.18 
 
 		 171 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 		 162 aa  89.7  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1257  lipoprotein signal peptidase  32.19 
 
 		 160 aa  89.4  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  38.51 
 
 		 171 aa  89.4  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  38.19 
 
 		 169 aa  89  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  41.55 
 
 		 160 aa  89  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 166 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 166 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 154 aa  88.6  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 166 aa  88.6  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 166 aa  88.6  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 166 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 166 aa  88.6  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4439  signal peptidase II  36.77 
 
 		 165 aa  88.6  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 166 aa  88.6  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0853  signal peptidase II  41.67 
 
 		 155 aa  88.6  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 166 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  42.14 
 
 		 159 aa  88.6  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 154 aa  88.2  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  34.44 
 
 		 182 aa  87.8  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  34.48 
 
 		 159 aa  88.2  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  33.8 
 
 		 180 aa  87.4  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  35.29 
 
 		 157 aa  87.4  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 		 170 aa  87.4  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  38.22 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  38.03 
 
 		 169 aa  87  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  36.81 
 
 		 169 aa  87.4  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  38.03 
 
 		 169 aa  87  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1715  lipoprotein signal peptidase  43.57 
 
 		 165 aa  87  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.488769  normal  0.154369 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  36.84 
 
 		 164 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  38.92 
 
 		 166 aa  86.7  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  38.62 
 
 		 166 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4043  signal peptidase II  37.67 
 
 		 157 aa  86.7  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  36.84 
 
 		 164 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  37.32 
 
 		 169 aa  86.7  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  34.42 
 
 		 176 aa  85.5  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  34.55 
 
 		 169 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 		 164 aa  85.1  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 166 aa  85.5  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 		 164 aa  85.1  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 		 149 aa  85.1  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  33.94 
 
 		 169 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 166 aa  84.7  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  35.06 
 
 		 235 aa  84.7  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 164 aa  84.7  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 166 aa  84.7  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 166 aa  84.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 166 aa  84.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 166 aa  84.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 		 178 aa  84.3  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0915  signal peptidase II  42.15 
 
 		 184 aa  84.3  8e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.00000000140419  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  36.18 
 
 		 164 aa  84  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  36.18 
 
 		 164 aa  84  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  36.18 
 
 		 164 aa  84  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  36.18 
 
 		 164 aa  84  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>