More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1287 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 149 aa  291  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  49.61 
 
 		 145 aa  133  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 158 aa  107  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  45.33 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  41.77 
 
 		 171 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  41.77 
 
 		 171 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  41.77 
 
 		 171 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  39.6 
 
 		 149 aa  99.4  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  42.07 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  41.14 
 
 		 171 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  46.15 
 
 		 143 aa  97.1  8e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  42.57 
 
 		 170 aa  96.3  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  47.2 
 
 		 191 aa  95.5  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  41.96 
 
 		 165 aa  95.5  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  38.22 
 
 		 272 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  43.17 
 
 		 168 aa  95.5  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  42 
 
 		 219 aa  95.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  39.87 
 
 		 171 aa  94.7  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  38.1 
 
 		 195 aa  94.4  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  39.73 
 
 		 155 aa  94  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  44.22 
 
 		 169 aa  94  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  39.73 
 
 		 164 aa  93.6  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  43.05 
 
 		 153 aa  93.6  8e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  40.44 
 
 		 144 aa  93.6  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3196  lipoprotein signal peptidase  40.13 
 
 		 212 aa  92.8  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000467207  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  38.61 
 
 		 170 aa  92.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  39.71 
 
 		 224 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  38.61 
 
 		 170 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  38.61 
 
 		 170 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  38.61 
 
 		 170 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  39.31 
 
 		 178 aa  90.9  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4023  lipoprotein signal peptidase  43.33 
 
 		 151 aa  89.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000409916  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  41.3 
 
 		 168 aa  88.6  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  37.24 
 
 		 162 aa  87.8  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  38.12 
 
 		 162 aa  88.2  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  36.69 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  34.78 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  39.44 
 
 		 197 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  43.17 
 
 		 165 aa  86.3  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  40.82 
 
 		 161 aa  86.3  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 178 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  38.57 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  38.69 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 152 aa  85.5  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  39.31 
 
 		 168 aa  85.9  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3649  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 		 164 aa  85.1  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3938  lipoprotein signal peptidase  39.31 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000501111  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3945  lipoprotein signal peptidase  39.31 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  37.27 
 
 		 176 aa  84.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  38.93 
 
 		 169 aa  85.1  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3113  lipoprotein signal peptidase  40.88 
 
 		 230 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.719311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 160 aa  84.7  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  35.85 
 
 		 176 aa  84.7  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  36.05 
 
 		 161 aa  84.3  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  38.52 
 
 		 207 aa  84.3  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  37.34 
 
 		 170 aa  84.3  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 		 164 aa  84.3  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0281  lipoprotein signal peptidase  39.73 
 
 		 191 aa  84.3  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0645052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3720  lipoprotein signal peptidase  38.62 
 
 		 152 aa  84.3  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905453  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  37.82 
 
 		 170 aa  84  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 		 167 aa  84  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  35.33 
 
 		 165 aa  84.3  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  40.58 
 
 		 170 aa  83.6  8e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  36.42 
 
 		 180 aa  83.6  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2773  lipoprotein signal peptidase  40.88 
 
 		 234 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  0.677006 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  42.31 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  42.31 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  42.31 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  42.31 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2542  lipoprotein signal peptidase  38.62 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0674041  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  43.05 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  42.31 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  42.31 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  42.31 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  42.31 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  43.88 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  38.26 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  34.23 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2357  lipoprotein signal peptidase  37.67 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0614763  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  40.44 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  37.06 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  43.14 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  44.6 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  44.6 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1135  lipoprotein signal peptidase  40.13 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  44.53 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  44.53 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1410  lipoprotein signal peptidase  41.06 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  42.48 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  42.48 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  42.48 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  39.24 
 
 		 189 aa  80.5  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0142  lipoprotein signal peptidase  40.58 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  40.94 
 
 		 243 aa  80.1  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3907  lipoprotein signal peptidase  39.31 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000548028 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3635  lipoprotein signal peptidase  39.31 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00213979  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3652  lipoprotein signal peptidase  39.31 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000204349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>