More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2967 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 160 aa  311  2.9999999999999996e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  51.03 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  47.85 
 
 		 163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  47.47 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4439  signal peptidase II  43.92 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  48.99 
 
 		 173 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  46.41 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  48.32 
 
 		 174 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  43.87 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  45.64 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  47.65 
 
 		 174 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  45.52 
 
 		 176 aa  123  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  45.27 
 
 		 166 aa  121  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  45.64 
 
 		 166 aa  120  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  45.27 
 
 		 166 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  45.27 
 
 		 166 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  45.27 
 
 		 166 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  45.27 
 
 		 166 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  45.27 
 
 		 166 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  45.27 
 
 		 166 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  45.27 
 
 		 166 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  44.97 
 
 		 166 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  44.97 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  46.62 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  46.15 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  46.62 
 
 		 172 aa  118  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  42.36 
 
 		 182 aa  118  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  50.69 
 
 		 164 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  44.3 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  43.06 
 
 		 178 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  44.3 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  44.3 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  45.95 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  47.18 
 
 		 159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4860  lipoprotein signal peptidase  44.37 
 
 		 164 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.777227  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  44.35 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  41.67 
 
 		 168 aa  110  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  34.62 
 
 		 173 aa  110  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  39.34 
 
 		 169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  42.75 
 
 		 174 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  43.95 
 
 		 166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4181  lipoprotein signal peptidase  45.7 
 
 		 165 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4037  lipoprotein signal peptidase  49.66 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  41.89 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  44.68 
 
 		 358 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  44.44 
 
 		 178 aa  107  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  42.21 
 
 		 170 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  45.89 
 
 		 160 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  44.35 
 
 		 171 aa  107  9.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  40.41 
 
 		 170 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  42.95 
 
 		 165 aa  106  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2281  lipoprotein signal peptidase  45.91 
 
 		 171 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  42.95 
 
 		 165 aa  106  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  40.67 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  42 
 
 		 169 aa  105  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  37.91 
 
 		 154 aa  103  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 		 170 aa  103  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  41.45 
 
 		 189 aa  103  9e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  39.47 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  37.25 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  38.99 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  43.97 
 
 		 364 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  38.99 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  38.99 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  41.13 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  34.87 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1060  signal peptidase II  35.66 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 		 171 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  41.13 
 
 		 163 aa  102  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0288  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  46.43 
 
 		 166 aa  101  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 182 aa  101  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1577  lipoprotein signal peptidase  48.55 
 
 		 167 aa  101  5e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  44.3 
 
 		 156 aa  101  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1520  lipoprotein signal peptidase  48.55 
 
 		 167 aa  101  5e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0161435  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  40.26 
 
 		 168 aa  100  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  43.26 
 
 		 157 aa  100  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  43.8 
 
 		 164 aa  100  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  37.34 
 
 		 170 aa  100  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  37.34 
 
 		 170 aa  100  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  37.34 
 
 		 170 aa  100  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  37.34 
 
 		 170 aa  100  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  37.34 
 
 		 170 aa  100  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  37.34 
 
 		 170 aa  100  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  37.34 
 
 		 170 aa  100  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  38.56 
 
 		 170 aa  100  9e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  40.41 
 
 		 162 aa  99.8  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  40.13 
 
 		 359 aa  100  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  41.1 
 
 		 150 aa  100  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  36.54 
 
 		 170 aa  99.8  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3163  lipoprotein signal peptidase  44.37 
 
 		 164 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  39.35 
 
 		 168 aa  99.8  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  36.54 
 
 		 170 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  40.13 
 
 		 359 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  38.51 
 
 		 170 aa  99.4  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 		 173 aa  99  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  42.36 
 
 		 358 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  41.67 
 
 		 357 aa  99.4  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  38.51 
 
 		 170 aa  99.4  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  38.51 
 
 		 170 aa  99.4  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>