More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0392 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0392  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 165 aa  320  6e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.034269  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2219  lipoprotein signal peptidase  79.88 
 
 		 165 aa  220  7e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2281  lipoprotein signal peptidase  71.88 
 
 		 171 aa  216  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2603  lipoprotein signal peptidase  72.66 
 
 		 171 aa  193  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172447 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2326  lipoprotein signal peptidase  72.66 
 
 		 171 aa  192  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  0.6435 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1799  lipoprotein signal peptidase  68.55 
 
 		 171 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.408205  normal  0.0603455 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1007  lipoprotein signal peptidase  51.61 
 
 		 167 aa  150  5.9999999999999996e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4037  lipoprotein signal peptidase  50.65 
 
 		 165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4181  lipoprotein signal peptidase  50.98 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2861  lipoprotein signal peptidase  50.72 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0978018 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3163  lipoprotein signal peptidase  52.6 
 
 		 164 aa  137  7e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4860  lipoprotein signal peptidase  49.03 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.777227  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2543  lipoprotein signal peptidase  53.28 
 
 		 165 aa  132  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2206  lipoprotein signal peptidase  55.64 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.252335  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1410  lipoprotein signal peptidase  47.26 
 
 		 174 aa  117  9e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0288  lipoprotein signal peptidase  44.52 
 
 		 184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  46.53 
 
 		 160 aa  107  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0632  lipoprotein signal peptidase  44.37 
 
 		 177 aa  106  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.263263  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1715  lipoprotein signal peptidase  53.24 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.488769  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0614  lipoprotein signal peptidase  42.31 
 
 		 199 aa  101  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.107984 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  40.14 
 
 		 166 aa  101  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1394  lipoprotein signal peptidase  52.63 
 
 		 190 aa  97.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.660722  normal  0.96884 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0092  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 160 aa  96.7  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.142417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2356  lipoprotein signal peptidase  41.43 
 
 		 173 aa  95.9  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0383384 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2717  lipoprotein signal peptidase  38.03 
 
 		 227 aa  95.5  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.702732 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  41.1 
 
 		 159 aa  94.7  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  37.32 
 
 		 166 aa  94.4  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 		 162 aa  94.4  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  36.62 
 
 		 166 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  36.62 
 
 		 166 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  36.62 
 
 		 166 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  36.62 
 
 		 166 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  36.62 
 
 		 166 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  36.62 
 
 		 166 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  36.62 
 
 		 166 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  40.27 
 
 		 169 aa  93.6  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  37.32 
 
 		 178 aa  93.6  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  36.62 
 
 		 166 aa  93.6  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  43.05 
 
 		 169 aa  93.6  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  36.62 
 
 		 166 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  36.62 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  34.23 
 
 		 163 aa  92.8  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 173 aa  91.7  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  37.42 
 
 		 162 aa  91.7  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  36.62 
 
 		 166 aa  91.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  36.62 
 
 		 166 aa  91.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  36.62 
 
 		 166 aa  91.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  37.01 
 
 		 163 aa  91.3  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3783  lipoprotein signal peptidase  44.76 
 
 		 172 aa  90.9  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.800649  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 		 170 aa  90.9  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  35.53 
 
 		 157 aa  90.5  9e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  34.35 
 
 		 181 aa  89.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  40.46 
 
 		 174 aa  89.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  34.23 
 
 		 154 aa  89.4  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  34.01 
 
 		 166 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  34.69 
 
 		 172 aa  88.6  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  34.19 
 
 		 235 aa  88.6  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  34.69 
 
 		 172 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 159 aa  87.8  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  35.48 
 
 		 158 aa  87.4  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  33.97 
 
 		 172 aa  87.4  7e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0760  lipoprotein signal peptidase  38.17 
 
 		 158 aa  87.4  9e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.473173  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  35.66 
 
 		 174 aa  86.3  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4439  signal peptidase II  35.81 
 
 		 165 aa  86.3  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  35.66 
 
 		 174 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  31.08 
 
 		 180 aa  85.1  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  38.93 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  42.47 
 
 		 156 aa  84.3  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  34.36 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  28.39 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0359  lipoprotein signal peptidase  37.75 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4043  signal peptidase II  38.46 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  35.21 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  33.97 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  38.67 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  37.23 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  35.57 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  30.07 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  40.85 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  39.71 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4414  signal peptidase II  40.95 
 
 		 123 aa  81.3  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849735  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  32.05 
 
 		 176 aa  80.9  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  36.94 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 		 202 aa  80.5  0.000000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  35.53 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  34.72 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  34.51 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1257  lipoprotein signal peptidase  29.66 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  33.96 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0487  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  29.05 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  40.77 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  27.7 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0052  lipoprotein signal peptidase  31.68 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0853  signal peptidase II  32.45 
 
 		 155 aa  77  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  28.38 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  38.69 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>