More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2206 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2206  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 177 aa  347  4e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.252335  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2281  lipoprotein signal peptidase  51.27 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0392  lipoprotein signal peptidase  55.7 
 
 		 165 aa  136  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.034269  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4181  lipoprotein signal peptidase  48.1 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4860  lipoprotein signal peptidase  46.3 
 
 		 164 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.777227  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2603  lipoprotein signal peptidase  54.84 
 
 		 171 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172447 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2326  lipoprotein signal peptidase  54.84 
 
 		 171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  0.6435 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1007  lipoprotein signal peptidase  46.75 
 
 		 167 aa  124  9e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2219  lipoprotein signal peptidase  51.35 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4037  lipoprotein signal peptidase  46.2 
 
 		 165 aa  121  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1799  lipoprotein signal peptidase  50.33 
 
 		 171 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.408205  normal  0.0603455 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3163  lipoprotein signal peptidase  53.17 
 
 		 164 aa  117  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2543  lipoprotein signal peptidase  49.21 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2861  lipoprotein signal peptidase  44.85 
 
 		 171 aa  105  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0978018 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  43.23 
 
 		 160 aa  104  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2717  lipoprotein signal peptidase  40.96 
 
 		 227 aa  100  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.702732 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0632  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 177 aa  98.6  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.263263  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  41.83 
 
 		 154 aa  97.4  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  38.99 
 
 		 158 aa  95.5  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0288  lipoprotein signal peptidase  47.75 
 
 		 184 aa  94.4  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1394  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 190 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.660722  normal  0.96884 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  41.56 
 
 		 164 aa  93.2  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  38.93 
 
 		 169 aa  92.4  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0359  lipoprotein signal peptidase  36.77 
 
 		 158 aa  90.1  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  36.81 
 
 		 166 aa  89  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  35.46 
 
 		 166 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  35.46 
 
 		 166 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1410  lipoprotein signal peptidase  39.19 
 
 		 174 aa  89.4  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  35.46 
 
 		 166 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  35.46 
 
 		 166 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  35.46 
 
 		 166 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  35.46 
 
 		 166 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  36.17 
 
 		 166 aa  89.4  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  35.46 
 
 		 166 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0092  lipoprotein signal peptidase  41.78 
 
 		 160 aa  89  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.142417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  37.01 
 
 		 169 aa  88.6  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  36.42 
 
 		 159 aa  88.6  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  38.89 
 
 		 169 aa  87.8  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  35.1 
 
 		 163 aa  87  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3614  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.463393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3952  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.386002  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  36.13 
 
 		 178 aa  87  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0614  lipoprotein signal peptidase  36.63 
 
 		 199 aa  86.3  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.107984 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  28.48 
 
 		 180 aa  85.1  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  35.46 
 
 		 150 aa  84.3  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  34.72 
 
 		 166 aa  84.3  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  38.73 
 
 		 161 aa  84  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  34.84 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2356  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0383384 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  34.51 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  36.25 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  34.03 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  34.72 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  34.81 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0480  lipoprotein signal peptidase  36.25 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  34.72 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  39.73 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  34.72 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  34.72 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  37.76 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  35.66 
 
 		 170 aa  80.9  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  32.03 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  38.13 
 
 		 156 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 		 157 aa  80.5  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  35.53 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  37.06 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  29.68 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  34.57 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  37.76 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  36.76 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4439  signal peptidase II  31.61 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  29.68 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  34.03 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  31.85 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0149  lipoprotein signal peptidase  31.82 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0144  lipoprotein signal peptidase  31.82 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  34.72 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  36 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  32.14 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 202 aa  77.4  0.00000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  32.14 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  36.05 
 
 		 167 aa  77.4  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4043  signal peptidase II  39.47 
 
 		 157 aa  77  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  31.45 
 
 		 170 aa  77.4  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  34.72 
 
 		 172 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  32.89 
 
 		 170 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  32.89 
 
 		 170 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  32.89 
 
 		 170 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0760  lipoprotein signal peptidase  34.51 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.473173  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  35.94 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0161  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0915  signal peptidase II  32.39 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.00000000140419  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  32 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>