More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0614 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0614  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
199 aa  392  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.107984 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4037  lipoprotein signal peptidase  42.13 
 
 
165 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4860  lipoprotein signal peptidase  39.33 
 
 
164 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.777227  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4181  lipoprotein signal peptidase  38.12 
 
 
165 aa  104  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3163  lipoprotein signal peptidase  45.65 
 
 
164 aa  99.8  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0288  lipoprotein signal peptidase  40.46 
 
 
184 aa  95.9  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2326  lipoprotein signal peptidase  47.86 
 
 
171 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  0.6435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2603  lipoprotein signal peptidase  47.86 
 
 
171 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.172447 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2543  lipoprotein signal peptidase  40.16 
 
 
165 aa  92.4  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2281  lipoprotein signal peptidase  45.3 
 
 
171 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  35.56 
 
 
160 aa  90.9  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 
169 aa  90.1  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
168 aa  89  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  41.27 
 
 
181 aa  89.4  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1007  lipoprotein signal peptidase  37.64 
 
 
167 aa  88.6  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2717  lipoprotein signal peptidase  32.34 
 
 
227 aa  88.6  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.702732 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1799  lipoprotein signal peptidase  48.39 
 
 
171 aa  87.8  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.408205  normal  0.0603455 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1410  lipoprotein signal peptidase  34.44 
 
 
174 aa  85.1  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0392  lipoprotein signal peptidase  42.31 
 
 
165 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.034269  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  30.53 
 
 
171 aa  81.6  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0632  lipoprotein signal peptidase  37.85 
 
 
177 aa  81.6  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.263263  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  33.72 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0139  lipoprotein signal peptidase  37.13 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000441491 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
154 aa  80.9  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3783  lipoprotein signal peptidase  34.83 
 
 
172 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.800649  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  36.16 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  31.07 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0142  lipoprotein signal peptidase  36.53 
 
 
157 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  32.76 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4043  signal peptidase II  37.99 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  34.27 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
165 aa  79  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0359  lipoprotein signal peptidase  32.76 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1099  lipoprotein signal peptidase  35.2 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  35.91 
 
 
154 aa  77.4  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  32.02 
 
 
170 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  35.43 
 
 
176 aa  77  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2356  lipoprotein signal peptidase  32.94 
 
 
173 aa  77  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0383384 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  35.38 
 
 
165 aa  77  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
166 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  36.78 
 
 
159 aa  77  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  35.16 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  30.11 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  32.97 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  31.11 
 
 
170 aa  75.1  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2219  lipoprotein signal peptidase  35.8 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2762  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145338  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2929  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0877107  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  29.74 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  31.67 
 
 
170 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  31.67 
 
 
170 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  31.67 
 
 
170 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  32.14 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  32.14 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  32.14 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  32.14 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  36.92 
 
 
154 aa  73.6  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  30.3 
 
 
163 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  43.36 
 
 
364 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1726  lipoprotein signal peptidase  37.02 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.88791  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  33.71 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  32.14 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  36.22 
 
 
171 aa  73.6  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  33.14 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  32.57 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0092  lipoprotein signal peptidase  41.23 
 
 
160 aa  73.6  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.142417  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  30.6 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  32.14 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  33.14 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  32.14 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  30.56 
 
 
170 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  34.3 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  31.11 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  38.33 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  33.92 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2861  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
171 aa  72  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0978018 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  31.98 
 
 
169 aa  72  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
169 aa  72  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  32.78 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  37.82 
 
 
358 aa  72  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  31.98 
 
 
169 aa  72  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  32.6 
 
 
172 aa  72  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  32.34 
 
 
172 aa  72  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_002978  WD0760  lipoprotein signal peptidase  35.61 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.473173  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  31.28 
 
 
171 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  32.74 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  31.28 
 
 
171 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  31.28 
 
 
171 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  31.4 
 
 
169 aa  71.2  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2206  lipoprotein signal peptidase  41.18 
 
 
177 aa  70.9  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.252335  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0487  lipoprotein signal peptidase  33.14 
 
 
178 aa  70.9  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  35.12 
 
 
165 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  34.56 
 
 
169 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  31.18 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  32.97 
 
 
173 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>