More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1726 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1726  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 163 aa  325  2.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.88791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  59.86 
 
 		 165 aa  174  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0142  lipoprotein signal peptidase  56.25 
 
 		 157 aa  171  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0139  lipoprotein signal peptidase  56.25 
 
 		 157 aa  170  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000441491 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4193  lipoprotein signal peptidase  55.76 
 
 		 173 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  56.55 
 
 		 157 aa  163  6.9999999999999995e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4973  lipoprotein signal peptidase  52.63 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  55.03 
 
 		 158 aa  153  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  44.44 
 
 		 170 aa  98.6  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  40.27 
 
 		 168 aa  97.1  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  44.44 
 
 		 176 aa  95.9  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  42.96 
 
 		 170 aa  94.4  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  37.91 
 
 		 359 aa  94  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  37.91 
 
 		 359 aa  94  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 154 aa  93.6  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 170 aa  93.6  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 154 aa  93.2  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10890  lipoprotein signal peptidase  39.13 
 
 		 201 aa  92.8  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280945  unclonable  0.00000000228732 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  40.28 
 
 		 176 aa  91.7  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  36.25 
 
 		 165 aa  91.7  4e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  37.16 
 
 		 182 aa  91.3  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16531  lipoprotein signal peptidase  39.53 
 
 		 165 aa  91.3  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.710647 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  40.14 
 
 		 171 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  40.14 
 
 		 171 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  40.14 
 
 		 171 aa  88.6  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  40.14 
 
 		 171 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  40.41 
 
 		 182 aa  88.2  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  40.85 
 
 		 170 aa  88.2  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  40.85 
 
 		 170 aa  88.2  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  40.85 
 
 		 170 aa  88.2  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  40.14 
 
 		 170 aa  87.8  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09981  lipoprotein signal peptidase  36.6 
 
 		 152 aa  87.8  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  36.05 
 
 		 145 aa  87.4  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1081  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 		 150 aa  87.4  8e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  40.14 
 
 		 171 aa  87  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  37.09 
 
 		 169 aa  86.3  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  37.09 
 
 		 169 aa  86.3  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 		 169 aa  85.5  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 162 aa  85.5  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  39.01 
 
 		 358 aa  85.1  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  38.57 
 
 		 168 aa  84.3  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 		 162 aa  84.3  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  36.81 
 
 		 170 aa  84.7  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  35.48 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  33.77 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  37.23 
 
 		 357 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  35.06 
 
 		 364 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  33.99 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  38.51 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07781  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.246414  normal  0.0597023 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  39.26 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  37.96 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  34.69 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  33.81 
 
 		 154 aa  80.5  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  36.23 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  33.81 
 
 		 154 aa  80.5  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  44.64 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0928  lipoprotein signal peptidase  37.04 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10211  putative lipoprotein signal peptidase  41.09 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.148717  normal  0.209845 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  37.75 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  34.07 
 
 		 358 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  39.71 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  34.21 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3937  lipoprotein signal peptidase  35.92 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  35.8 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  37.59 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  33.82 
 
 		 170 aa  77.4  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  32.64 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  39.49 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  33.82 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  36.43 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  35.56 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  41.67 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  35.82 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  36.96 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  37.23 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  33.99 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  36.31 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2357  lipoprotein signal peptidase  36.29 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0614763  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  39.05 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  39.05 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  33.1 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 169 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  38.05 
 
 		 171 aa  73.9  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  34.31 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  34.31 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  31.82 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  29.17 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  34.56 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0614  lipoprotein signal peptidase  37.02 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.107984 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  29.17 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  32.67 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  30.88 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  34.56 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  34.27 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>