More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0142 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0142  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
157 aa  309  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0139  lipoprotein signal peptidase  99.36 
 
 
157 aa  308  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000441491 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4973  lipoprotein signal peptidase  73.68 
 
 
160 aa  225  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  61.84 
 
 
157 aa  184  4e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  63.27 
 
 
165 aa  184  5e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4193  lipoprotein signal peptidase  61.18 
 
 
173 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  62.16 
 
 
158 aa  171  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1726  lipoprotein signal peptidase  56.25 
 
 
163 aa  171  5e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.88791  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  42.95 
 
 
173 aa  99.8  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  38.89 
 
 
359 aa  98.6  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  38.89 
 
 
359 aa  98.6  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  42.14 
 
 
180 aa  92.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  38.22 
 
 
182 aa  92.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  39.16 
 
 
171 aa  92  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  38.22 
 
 
170 aa  91.7  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 
154 aa  91.3  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 
154 aa  91.3  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16531  lipoprotein signal peptidase  41.8 
 
 
165 aa  90.9  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.710647 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  41.26 
 
 
168 aa  89.7  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  35.67 
 
 
170 aa  90.1  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  41.18 
 
 
170 aa  89  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  38.93 
 
 
182 aa  89.4  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  38.06 
 
 
168 aa  89.4  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10890  lipoprotein signal peptidase  38.93 
 
 
201 aa  89.4  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280945  unclonable  0.00000000228732 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  43.75 
 
 
149 aa  88.6  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  36.48 
 
 
165 aa  88.6  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  34.97 
 
 
168 aa  87.4  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  39.04 
 
 
169 aa  87.4  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  39.31 
 
 
170 aa  87.4  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 
164 aa  87  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  39.04 
 
 
172 aa  86.3  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  40.74 
 
 
167 aa  86.7  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  36.81 
 
 
166 aa  85.5  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  36.81 
 
 
166 aa  85.5  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  39.19 
 
 
176 aa  84.7  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  36.08 
 
 
169 aa  84.7  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  42.03 
 
 
158 aa  84  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 
171 aa  84  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  40.27 
 
 
163 aa  84  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2357  lipoprotein signal peptidase  39.23 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0614763  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  42.75 
 
 
358 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10211  putative lipoprotein signal peptidase  39.42 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.148717  normal  0.209845 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  36.94 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  39.62 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  41.09 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  35.48 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  36.08 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  36.08 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  39.57 
 
 
357 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  35.17 
 
 
164 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09981  lipoprotein signal peptidase  40.77 
 
 
152 aa  82  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0885  lipoprotein signal peptidase  38.06 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0111972  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  38.99 
 
 
163 aa  81.6  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1081  lipoprotein signal peptidase  35.17 
 
 
150 aa  81.6  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  39.57 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  36.67 
 
 
154 aa  81.3  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  36.67 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  38.78 
 
 
170 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  38.78 
 
 
170 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  38.78 
 
 
170 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  38.1 
 
 
170 aa  80.9  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 
145 aa  80.5  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  35.17 
 
 
164 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  35.17 
 
 
164 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  35.17 
 
 
164 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  35.17 
 
 
164 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  35.17 
 
 
164 aa  80.5  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  38.31 
 
 
154 aa  80.5  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  35.17 
 
 
164 aa  80.5  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  35.17 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1374  lipoprotein signal peptidase  36.48 
 
 
160 aa  80.1  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000912047  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3952  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 
157 aa  80.1  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.386002  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  41.91 
 
 
364 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  35.17 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  33.96 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 
171 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3614  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 
157 aa  80.1  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.463393  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  35.81 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0614  lipoprotein signal peptidase  36.53 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.107984 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  34.84 
 
 
171 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  38.51 
 
 
178 aa  79  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  35.25 
 
 
162 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  34.84 
 
 
171 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  34.57 
 
 
171 aa  79  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  34.84 
 
 
171 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
170 aa  79  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1185  lipoprotein signal peptidase  34.38 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021108  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  34.39 
 
 
167 aa  78.2  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07781  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.246414  normal  0.0597023 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  33.82 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  40.15 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0050  lipoprotein signal peptidase  34.03 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0051  lipoprotein signal peptidase  34.03 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0475146 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  35.56 
 
 
174 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0051  lipoprotein signal peptidase  34.03 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0052  lipoprotein signal peptidase  34.03 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876995  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  34.03 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.322975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>