More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3258 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3258  signal peptidase II  100 
 
 		 171 aa  336  7e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.802617  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3783  lipoprotein signal peptidase  50.91 
 
 		 172 aa  164  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.800649  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2356  lipoprotein signal peptidase  49.36 
 
 		 173 aa  152  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0383384 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  38.96 
 
 		 169 aa  108  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  38.96 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  38.96 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2861  lipoprotein signal peptidase  35.93 
 
 		 171 aa  102  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0978018 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4181  lipoprotein signal peptidase  40.14 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1007  lipoprotein signal peptidase  38.04 
 
 		 167 aa  99  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  31.71 
 
 		 171 aa  98.2  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  43.38 
 
 		 174 aa  97.8  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4860  lipoprotein signal peptidase  37.84 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.777227  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 168 aa  96.3  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  35.67 
 
 		 170 aa  96.3  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 164 aa  95.9  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2717  lipoprotein signal peptidase  41.94 
 
 		 227 aa  95.5  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.702732 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2543  lipoprotein signal peptidase  41.3 
 
 		 165 aa  94.4  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4414  signal peptidase II  44.35 
 
 		 123 aa  93.6  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849735  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4037  lipoprotein signal peptidase  40.41 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0359  lipoprotein signal peptidase  39.1 
 
 		 158 aa  92.4  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3163  lipoprotein signal peptidase  39.13 
 
 		 164 aa  92  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  30.67 
 
 		 170 aa  92  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  37.25 
 
 		 158 aa  91.7  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  30.67 
 
 		 170 aa  92  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  35.26 
 
 		 154 aa  90.5  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  36.36 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  29.45 
 
 		 182 aa  90.5  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0092  lipoprotein signal peptidase  38.62 
 
 		 160 aa  90.5  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.142417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  29.38 
 
 		 171 aa  89.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  34.62 
 
 		 168 aa  89.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4439  signal peptidase II  36.13 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  34.84 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  29.01 
 
 		 180 aa  88.6  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 169 aa  89.4  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  41.83 
 
 		 154 aa  89  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  35.48 
 
 		 164 aa  88.6  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  27.5 
 
 		 169 aa  88.6  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  35.48 
 
 		 164 aa  88.6  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2219  lipoprotein signal peptidase  39.62 
 
 		 165 aa  88.2  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  35.44 
 
 		 169 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0052  lipoprotein signal peptidase  32.56 
 
 		 166 aa  88.2  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876995  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0051  lipoprotein signal peptidase  32.56 
 
 		 166 aa  88.2  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0475146 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  28.93 
 
 		 168 aa  88.2  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0051  lipoprotein signal peptidase  32.56 
 
 		 166 aa  88.2  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  35.44 
 
 		 169 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2603  lipoprotein signal peptidase  41.13 
 
 		 171 aa  87.8  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172447 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  32.56 
 
 		 166 aa  87.4  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.322975 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0050  lipoprotein signal peptidase  32.56 
 
 		 166 aa  87.4  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  34.84 
 
 		 164 aa  87.4  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  34.84 
 
 		 164 aa  87.4  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  34.84 
 
 		 164 aa  87.4  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  34.84 
 
 		 164 aa  87.4  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2281  lipoprotein signal peptidase  42.74 
 
 		 171 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  33.95 
 
 		 171 aa  87  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  34.97 
 
 		 170 aa  86.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  36.48 
 
 		 166 aa  85.9  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  34.25 
 
 		 169 aa  86.3  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  34.59 
 
 		 181 aa  85.9  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0585  lipoprotein signal peptidase  34.69 
 
 		 166 aa  86.3  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00142013  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  34.84 
 
 		 164 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  34.84 
 
 		 164 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0632  lipoprotein signal peptidase  35.12 
 
 		 177 aa  85.9  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.263263  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 166 aa  85.1  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0480  lipoprotein signal peptidase  36.08 
 
 		 159 aa  85.1  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  35.66 
 
 		 166 aa  84.7  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 166 aa  84.7  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  35.15 
 
 		 169 aa  84.3  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  36.99 
 
 		 166 aa  84.3  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  36.99 
 
 		 166 aa  84.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  36.99 
 
 		 166 aa  84.3  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  37.25 
 
 		 160 aa  84  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  36.99 
 
 		 166 aa  84.3  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  36.99 
 
 		 166 aa  84.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  32.52 
 
 		 167 aa  84.3  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  36.99 
 
 		 166 aa  84.3  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  36.99 
 
 		 166 aa  84.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0288  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 		 184 aa  84  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  36.99 
 
 		 166 aa  84.3  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  37.24 
 
 		 166 aa  84  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  31.82 
 
 		 170 aa  84  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  37.24 
 
 		 166 aa  84  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  37.24 
 
 		 166 aa  84  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2326  lipoprotein signal peptidase  39.52 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  0.6435 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  29.81 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  32.05 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  34.81 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  28.75 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  28.75 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  28.75 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  28.75 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  28.75 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  28.75 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  31.82 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  31.82 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  28.75 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  28.75 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  28.75 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  31.82 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  31.82 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>