More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1860 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1860  signal peptidase II  100 
 
 
174 aa  349  1e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  47.1 
 
 
164 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  45.32 
 
 
160 aa  120  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  45.83 
 
 
154 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  45.91 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  43.87 
 
 
161 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  44.3 
 
 
169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  43.84 
 
 
153 aa  115  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  43.62 
 
 
169 aa  114  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  40.99 
 
 
162 aa  114  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  43.23 
 
 
182 aa  114  6.9999999999999995e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  42.47 
 
 
158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  44.97 
 
 
170 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  42.11 
 
 
162 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  40.54 
 
 
164 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3649  lipoprotein signal peptidase  47.59 
 
 
164 aa  111  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  41.79 
 
 
165 aa  110  9e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  41.94 
 
 
167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  44.3 
 
 
157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  45.52 
 
 
173 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  44.83 
 
 
168 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  45.27 
 
 
171 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  44.3 
 
 
176 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  40.62 
 
 
170 aa  106  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  45.75 
 
 
169 aa  106  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  44.3 
 
 
171 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  44.59 
 
 
171 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  44.6 
 
 
178 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  44.9 
 
 
163 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  37.59 
 
 
159 aa  104  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  38.56 
 
 
173 aa  103  9e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  39.1 
 
 
169 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 
164 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  39.1 
 
 
169 aa  103  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 
168 aa  103  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0050  lipoprotein signal peptidase  34.13 
 
 
166 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  34.13 
 
 
166 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.322975 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 
235 aa  102  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0051  lipoprotein signal peptidase  34.13 
 
 
166 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  43.05 
 
 
164 aa  102  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0051  lipoprotein signal peptidase  34.13 
 
 
166 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0475146 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  41.1 
 
 
163 aa  102  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0052  lipoprotein signal peptidase  34.13 
 
 
166 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876995  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  36.78 
 
 
169 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  42.25 
 
 
171 aa  101  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  40.62 
 
 
166 aa  101  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  40.62 
 
 
166 aa  101  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  40.62 
 
 
166 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  40.62 
 
 
166 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  40.62 
 
 
166 aa  101  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  40.62 
 
 
166 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 
155 aa  101  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  40.62 
 
 
166 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0487  lipoprotein signal peptidase  39.07 
 
 
178 aa  101  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  37.75 
 
 
154 aa  101  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  40.62 
 
 
166 aa  101  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  38.24 
 
 
173 aa  101  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  40.28 
 
 
173 aa  101  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  37.75 
 
 
154 aa  100  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  42.42 
 
 
170 aa  100  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  40.29 
 
 
171 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  36.94 
 
 
171 aa  100  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  40.29 
 
 
171 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  40.29 
 
 
171 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  38.89 
 
 
170 aa  99.8  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  39.29 
 
 
170 aa  99.8  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  41.1 
 
 
176 aa  99.4  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0585  lipoprotein signal peptidase  38.99 
 
 
166 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00142013  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  42.34 
 
 
161 aa  99.8  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  37.89 
 
 
176 aa  99.8  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  40.94 
 
 
163 aa  99.8  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  39.29 
 
 
170 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  39.29 
 
 
170 aa  99.8  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  39.29 
 
 
170 aa  99.8  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  39.29 
 
 
170 aa  99.8  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  39.29 
 
 
170 aa  99.8  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  39.29 
 
 
170 aa  99.8  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  39.29 
 
 
170 aa  99.8  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 
170 aa  99.4  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  39.29 
 
 
170 aa  99.8  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 
170 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 
170 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 
170 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  39.57 
 
 
171 aa  99  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 
202 aa  99  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  36.18 
 
 
170 aa  99  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  38 
 
 
170 aa  98.2  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  35.44 
 
 
166 aa  98.2  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  35.9 
 
 
169 aa  98.2  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  35.26 
 
 
164 aa  97.8  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  35.26 
 
 
164 aa  97.8  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  35.26 
 
 
164 aa  97.8  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  35.26 
 
 
164 aa  97.8  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  35.26 
 
 
164 aa  97.8  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  35.26 
 
 
164 aa  97.8  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  35.26 
 
 
164 aa  97.4  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  36.08 
 
 
165 aa  97.4  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  35.26 
 
 
164 aa  97.4  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  37.27 
 
 
176 aa  97.4  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  41.91 
 
 
164 aa  97.4  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>