More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1910 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1910  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 154 aa  309  6.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  75.66 
 
 		 155 aa  238  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3720  lipoprotein signal peptidase  64.08 
 
 		 152 aa  176  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3938  lipoprotein signal peptidase  63.38 
 
 		 152 aa  176  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000501111  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3945  lipoprotein signal peptidase  63.38 
 
 		 152 aa  176  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2542  lipoprotein signal peptidase  61.97 
 
 		 152 aa  173  7e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0674041  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3744  lipoprotein signal peptidase  59.6 
 
 		 152 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00517012  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3635  lipoprotein signal peptidase  59.6 
 
 		 152 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00213979  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3652  lipoprotein signal peptidase  59.6 
 
 		 152 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000204349  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3907  lipoprotein signal peptidase  59.6 
 
 		 152 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000548028 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4032  lipoprotein signal peptidase  59.6 
 
 		 152 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000325041  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1247  lipoprotein signal peptidase  59.6 
 
 		 152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000373462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3994  lipoprotein signal peptidase  58.94 
 
 		 152 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000820029  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  43.62 
 
 		 163 aa  120  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  43.62 
 
 		 163 aa  120  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0762  lipoprotein signal peptidase  47.01 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  42.21 
 
 		 165 aa  117  7e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  42.11 
 
 		 151 aa  117  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  43.26 
 
 		 162 aa  114  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  44.6 
 
 		 164 aa  111  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 		 166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  39.47 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 		 178 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1015  lipoprotein signal peptidase  39.19 
 
 		 154 aa  107  7.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000214304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  39.07 
 
 		 235 aa  105  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  45.59 
 
 		 160 aa  104  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  37.75 
 
 		 202 aa  104  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  40.13 
 
 		 162 aa  103  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  40.71 
 
 		 145 aa  103  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  41.73 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  37.09 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  41.18 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 		 168 aa  101  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  39.6 
 
 		 167 aa  101  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  38.16 
 
 		 163 aa  100  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  43.97 
 
 		 144 aa  100  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  37.33 
 
 		 182 aa  97.8  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  37.91 
 
 		 163 aa  95.9  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  37.97 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  38.26 
 
 		 169 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  38.26 
 
 		 169 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  41.61 
 
 		 156 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  37.25 
 
 		 165 aa  94  7e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  34.9 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  35.14 
 
 		 158 aa  92  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3649  lipoprotein signal peptidase  37.59 
 
 		 164 aa  90.1  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  36.17 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 154 aa  90.1  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  36.13 
 
 		 158 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  31.61 
 
 		 164 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  38.28 
 
 		 149 aa  90.1  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 154 aa  90.1  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 		 170 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 		 154 aa  89.4  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  34.93 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  37.33 
 
 		 160 aa  89.4  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  44.44 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 		 153 aa  89  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0555  lipoprotein signal peptidase  37.84 
 
 		 152 aa  88.6  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.803857  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0710  lipoprotein signal peptidase  37.84 
 
 		 152 aa  88.6  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108511 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  32.89 
 
 		 170 aa  88.6  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  38.26 
 
 		 159 aa  87.8  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  30.97 
 
 		 164 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 		 178 aa  87.4  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 		 163 aa  87.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  30.97 
 
 		 164 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  30.97 
 
 		 164 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  30.97 
 
 		 164 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  38.69 
 
 		 170 aa  87  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2691  lipoprotein signal peptidase  40.28 
 
 		 187 aa  87  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1346  lipoprotein signal peptidase  35.44 
 
 		 163 aa  87  8e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  30.97 
 
 		 164 aa  87  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  30.97 
 
 		 164 aa  87  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  30.97 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  31.45 
 
 		 182 aa  86.7  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3196  lipoprotein signal peptidase  39.46 
 
 		 212 aa  86.7  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000467207  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  30.97 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 179 aa  85.9  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  36.8 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 168 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  38.1 
 
 		 178 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  37.18 
 
 		 165 aa  85.5  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0585  lipoprotein signal peptidase  32.19 
 
 		 166 aa  85.9  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00142013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 		 162 aa  85.1  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  38.93 
 
 		 173 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  34.46 
 
 		 173 aa  85.1  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  33.76 
 
 		 170 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  33.76 
 
 		 170 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 169 aa  85.1  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  33.76 
 
 		 170 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1860  signal peptidase II  35.81 
 
 		 174 aa  84.7  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 170 aa  84.3  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  36.23 
 
 		 154 aa  84.7  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  38.19 
 
 		 160 aa  84.7  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  37.11 
 
 		 178 aa  84.3  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  37.23 
 
 		 170 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  34.03 
 
 		 166 aa  84.3  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 157 aa  84.3  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  38.62 
 
 		 176 aa  84  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  39.72 
 
 		 165 aa  83.6  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>