More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0762 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0762  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
161 aa  313  4e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  76.88 
 
 
163 aa  228  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  76.88 
 
 
163 aa  228  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  53.03 
 
 
155 aa  141  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3720  lipoprotein signal peptidase  51.39 
 
 
152 aa  135  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905453  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3945  lipoprotein signal peptidase  54.14 
 
 
152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3938  lipoprotein signal peptidase  54.14 
 
 
152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000501111  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2542  lipoprotein signal peptidase  51.06 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0674041  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3994  lipoprotein signal peptidase  51.06 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000820029  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1247  lipoprotein signal peptidase  51.06 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000373462  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3744  lipoprotein signal peptidase  50.35 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00517012  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3635  lipoprotein signal peptidase  50.35 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00213979  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3652  lipoprotein signal peptidase  50.35 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000204349  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4032  lipoprotein signal peptidase  50.35 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000325041  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3907  lipoprotein signal peptidase  50.35 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000548028 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1910  lipoprotein signal peptidase  47.01 
 
 
154 aa  117  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  37.01 
 
 
161 aa  112  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  37.42 
 
 
164 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0928  lipoprotein signal peptidase  42.18 
 
 
148 aa  102  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  35.37 
 
 
162 aa  101  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1081  lipoprotein signal peptidase  39.31 
 
 
150 aa  100  9e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1015  lipoprotein signal peptidase  38.67 
 
 
154 aa  96.7  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000214304  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2357  lipoprotein signal peptidase  38.31 
 
 
174 aa  96.3  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0614763  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  34.36 
 
 
163 aa  95.9  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  35.46 
 
 
153 aa  96.3  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 
145 aa  95.9  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  37.68 
 
 
151 aa  95.1  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  35.86 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  36.13 
 
 
154 aa  91.7  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  36.23 
 
 
164 aa  91.7  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  35.81 
 
 
162 aa  90.9  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  35.17 
 
 
165 aa  90.9  7e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  39.1 
 
 
154 aa  90.5  8e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  35.17 
 
 
163 aa  90.1  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  34.01 
 
 
161 aa  90.1  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  35.25 
 
 
162 aa  89  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  34.84 
 
 
154 aa  89.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  32.89 
 
 
160 aa  89  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  35.9 
 
 
160 aa  88.6  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 
152 aa  88.6  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  31.13 
 
 
159 aa  89  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
163 aa  89  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  35.17 
 
 
235 aa  87.4  7e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 
154 aa  87.4  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  33.09 
 
 
149 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  36.17 
 
 
172 aa  86.3  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  35.53 
 
 
176 aa  85.9  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  41.41 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  35.66 
 
 
170 aa  85.5  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  34.64 
 
 
180 aa  84.7  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  34.29 
 
 
166 aa  85.1  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  34.29 
 
 
166 aa  84.3  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  36.17 
 
 
173 aa  84.3  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  35.56 
 
 
164 aa  84  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  36.17 
 
 
166 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  33.57 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  30 
 
 
160 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  33.57 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3649  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  33.57 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  38.17 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  34.29 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  34.29 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  34.29 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  34.29 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  28.21 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  35.22 
 
 
160 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  31.21 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  34.29 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  34.29 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  34.29 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  32.47 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  34.19 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  32.41 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  34.75 
 
 
166 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  31.69 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  37.32 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  34.04 
 
 
166 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  35.92 
 
 
170 aa  81.6  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  33.82 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  34.29 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  36.67 
 
 
171 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
178 aa  81.3  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  36 
 
 
171 aa  80.5  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  36 
 
 
171 aa  80.5  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  29.61 
 
 
160 aa  80.5  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  36 
 
 
171 aa  80.5  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  35.21 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  32.1 
 
 
171 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  35.21 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
166 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  37.68 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0050  lipoprotein signal peptidase  35.92 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0051  lipoprotein signal peptidase  35.92 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0475146 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  35.92 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.322975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>